限制性兩階段多位點(diǎn)全基因組關(guān)聯(lián)分析方法（RTM-GWAS）是新建立的一種可以全面檢測(cè)自然群體和雙（多）親衍生群體中具有不同復(fù)等位變異QTL體系的關(guān)聯(lián)分析方法。本文介紹了提出RTM-GWAS的出發(fā)點(diǎn)及其兩大主要特點(diǎn),包括建立適合自然群體和和雙（多）親衍生群體特點(diǎn)的復(fù)等位變異標(biāo)記和控制總體貢獻(xiàn)率的多位點(diǎn)關(guān)聯(lián)分析模型。一般讀者和編者對(duì)RTM-GWAS的方法、原理,對(duì)復(fù)等位標(biāo)記和多位點(diǎn)模型并無(wú)異議,提問(wèn)與質(zhì)疑主要分為兩方面:一是RTM-GWAS檢測(cè)到的QTL數(shù)量較多,大大多于單位點(diǎn)MLM模型所檢出的QTL數(shù)目,懷疑增加的QTL是假陽(yáng)性所致;另一是采用常規(guī)顯著水準(zhǔn)要求太低,不適于關(guān)聯(lián)分析。本文對(duì)此做了嚴(yán)密釋疑。最后介紹了關(guān)于RTM-GWAS的應(yīng)用前景,包括遺傳體系解析與重要基因克隆,雙（多）親雜交衍生群體遺傳解析,群體遺傳分化與進(jìn)化和設(shè)計(jì)育種等方面。 

【文章來(lái)源】：中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,53(09)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】：5 頁(yè)

【文章目錄】：
1 提出RTM-GWAS的出發(fā)點(diǎn)及其兩大主要特點(diǎn)
2 RTM-GWAS方法的常見(jiàn)質(zhì)疑與辯解
    2.1 關(guān)于檢測(cè)的QTL數(shù)量多，懷疑假陽(yáng)性高的辯解
    2.2 關(guān)于所用顯著水平不夠嚴(yán)格的辯解
3 RTM-GWAS的應(yīng)用前景
    3.1 遺傳體系解析與重要基因克隆
    3.2 雙（多）親雜交衍生群體遺傳解析
    3.3 群體遺傳分化與進(jìn)化
    3.4 QTL-allele矩陣應(yīng)用于設(shè)計(jì)育種


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]東北大豆種質(zhì)群體百粒重QTL-等位變異的全基因組解析[J]. 郝曉帥,傅蒙蒙,劉再東,賀建波,王燕平,任海祥,王德亮,楊興勇,程延喜,杜維廣,蓋鈞鎰.  中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020(09)
[2]RTM-GWAS方法應(yīng)用于大豆RIL群體百粒重QTL檢測(cè)的功效[J]. 潘麗媛,賀建波,趙晉銘,王吳彬,邢光南,喻德躍,張小燕,李春燕,陳受宜,蓋鈞鎰.  中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020(09)
[3]大豆重組自交系群體異黃酮含量QTL連鎖定位與關(guān)聯(lián)定位的比較研究[J]. 劉再東,孟珊,賀建波,邢光南,王吳彬,趙團(tuán)結(jié),蓋鈞鎰.  中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020(09)
[4]大豆巢式關(guān)聯(lián)作圖群體蛋白質(zhì)含量的遺傳解析[J]. 李曙光,曹永策,賀建波,王吳彬,邢光南,楊加銀,趙團(tuán)結(jié),蓋鈞鎰.  中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020(09)
[5]限制性兩階段多位點(diǎn)全基因組關(guān)聯(lián)分析方法的特點(diǎn)與計(jì)算程序[J]. 賀建波,劉方東,邢光南,王吳彬,趙團(tuán)結(jié),管榮展,蓋鈞鎰.  作物學(xué)報(bào). 2018(09)



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