以長(zhǎng)江口發(fā)育最完善的河口型灘涂濕地-崇明東灘濕地為對(duì)象,采用高通量測(cè)序平臺(tái)和定量PCR技術(shù)對(duì)光灘區(qū)和植被區(qū)沉積物的微生物群落結(jié)構(gòu)進(jìn)行研究,考察灘涂濕地自然演替過程中微生物群落變化規(guī)律及其環(huán)境驅(qū)動(dòng)機(jī)制。結(jié)果表明,植被區(qū)沉積物表層的細(xì)菌16S rRNA基因拷貝數(shù)為光灘區(qū)表層的6.4倍,其Chao1指數(shù)與土壤有機(jī)碳、總氮和銨態(tài)氮呈顯著負(fù)相關(guān)。植被區(qū)和光灘區(qū)沉積物中相對(duì)豐度大于1%的微生物門類有12個(gè),占到總微生物群落的87%～90%。在屬水平上,與光灘濕地相比,植被區(qū)濕地中相對(duì)豐度發(fā)生顯著變化的優(yōu)勢(shì)屬（> 0.1%）為25個(gè),占到所有屬的8.3%和所有優(yōu)勢(shì)屬的64.1%;顯著增加的優(yōu)勢(shì)屬（> 0.2%）為10個(gè),其增幅范圍為0.22%～1.39%;其中,植被區(qū)沉積物中以脫硫球菌屬和硫桿菌屬微生物增加占主導(dǎo),Cylindrospermopsis屬為特有屬。冗余分析表明,綠彎菌門微生物對(duì)土壤TOC、TN和NO3-等較為敏感,而酸桿菌門和擬桿菌門微生物對(duì)SO2-4、EC值和pH值等敏感。 

【文章來源】：土壤通報(bào). 2019,50(05)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：7 頁

【部分圖文】：

不同土壤樣品細(xì)菌16S rRNA基因拷貝數(shù)

在門水平上，共獲得50個(gè)類群。而平均相對(duì)豐度>1%的優(yōu)勢(shì)微生物類群共計(jì)13門（圖2），其相對(duì)豐度占總微生物群落比例87.4%～89.6%。與光灘表層相比，蘆葦濕地表層共有4個(gè)門的相對(duì)豐度發(fā)生了顯著性變化，包括變形菌門Proteobacteria(48.1%）、綠彎菌門Chloroflexi(24.6%）、擬桿菌門Bacteroidetes(3.1%）和浮霉菌門Planctomycetes(3.8%），這些門占比共計(jì)79.6%。此外，與光灘深層相比，蘆葦濕地深層共有4個(gè)門發(fā)生了顯著性的變化，包括變形菌門Proteobacteria(60.0%）、綠彎菌門Chloroflexi(14.4%）、酸桿菌門Acidobacteria(6.8%）和擬桿菌門Bacteroidetes(3.0%）。值得注意的是，蘆葦濕地表層和底層之間僅有3個(gè)門具有顯著性差異，包括變形菌門、擬桿菌門和WS3；而光灘表層和底層之間僅有2個(gè)門存在顯著性差異，包括擬桿菌門和WS3。在屬水平上，共獲得303個(gè)類群。將平均相對(duì)豐度>0.1%類群歸類為優(yōu)勢(shì)屬，得到39個(gè)優(yōu)勢(shì)屬群（圖3）。其中，脫硫球菌屬（Desulfococcus）、硫桿菌屬（Thiobacillus）、浮霉?fàn)罹鷮伲≒lanctomyces）、希瓦氏菌屬（Shewanella）、厭氧繩菌屬（Anaerolinea）、假單胞菌屬（Pseudomonas）和Plesiocystis屬為主要優(yōu)勢(shì)類群，分別占總優(yōu)勢(shì)屬的8.1%～19.9%、4.3%～26.0%、3.4%～15.3%、1.4%～15.3%、2.1%～12.5%、1.6%～10.4%和0.5%～6.0%。

在屬水平上，共獲得303個(gè)類群。將平均相對(duì)豐度>0.1%類群歸類為優(yōu)勢(shì)屬，得到39個(gè)優(yōu)勢(shì)屬群（圖3）。其中，脫硫球菌屬（Desulfococcus）、硫桿菌屬（Thiobacillus）、浮霉?fàn)罹鷮伲≒lanctomyces）、希瓦氏菌屬（Shewanella）、厭氧繩菌屬（Anaerolinea）、假單胞菌屬（Pseudomonas）和Plesiocystis屬為主要優(yōu)勢(shì)類群，分別占總優(yōu)勢(shì)屬的8.1%～19.9%、4.3%～26.0%、3.4%～15.3%、1.4%～15.3%、2.1%～12.5%、1.6%～10.4%和0.5%～6.0%。對(duì)于潮灘濕地表層（0～10 cm）而言，與光灘濕地相比，蘆葦濕地中發(fā)生顯著變化的優(yōu)勢(shì)屬（>0.1%）為25個(gè)，占到所有屬的8.3%和所有優(yōu)勢(shì)屬的64.1%。圖4是發(fā)生顯著變化的主要優(yōu)勢(shì)屬（>0.2%），共16個(gè)。其中增幅最大的微生物屬包括脫硫球菌屬Desulfococcus(1.82%)，厭氧繩菌屬Anaerolinea(1.34%)，硫桿菌屬Thiobacillus(1.01%)，珊瑚球菌屬Corallococcus(0.44%)，地桿菌屬Geobacter(0.42%)，砂單胞菌屬Arenimonas(0.39%)，脫硫橄欖狀菌屬Desulfobacca(0.32%),SHD-231(0.30%)，海洋粘細(xì)菌屬Plesiocystis(0.64%)和Xylanimicrobium(0.22%)，分別增加1.39%、0.76%、0.68%、0.39%、0.37%、0.31%、0.29%、0.24%、0.24%和0.22%。相對(duì)豐度均顯著降低的主要優(yōu)勢(shì)屬包括Balneola屬、浮霉?fàn)罹鷮伲≒lanctomyces）、鹽單胞菌屬（Halomonas）、海桿菌屬（Marinobacter）、Sediminibacter屬和革蘭菌屬（Gramella），分別下降0.24%、0.27%、0.28%、0.28%、0.63%和0.93%。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
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碩士論文
[1]長(zhǎng)江口和東海海域細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)及其生態(tài)功能預(yù)測(cè)[D]. 吳冬梅.浙江海洋大學(xué) 2018



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