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輪作和連作對胡蘿卜根際和非根際細(xì)菌多樣性的影響

發(fā)布時間:2021-08-01 03:09
  細(xì)菌是土壤最重要的組成部分,土壤細(xì)菌的群落結(jié)構(gòu)對土壤的健康至關(guān)重要,可以直接影響植物的生長。胡蘿卜的長年連作導(dǎo)致其產(chǎn)量低、質(zhì)量差等一系列問題的發(fā)生,連作問題已成為不可忽視的問題。本研究通過HiSeq PE250高通量測序和生物信息學(xué)方法獲得了玉米胡蘿卜輪作種植和胡蘿卜連作種植中胡蘿卜根際和非根際土壤細(xì)菌的組成結(jié)構(gòu)。研究結(jié)果表明,相較于胡蘿卜連作,玉米胡蘿卜輪作種植改變了胡蘿卜根際土壤細(xì)菌的組成和群落多樣性。RM.M (玉米胡蘿卜輪作根際土壤樣品)樣品中的優(yōu)勢菌門為放線菌門和厚壁菌門,RM.R (胡蘿卜連作根際土壤樣品)的優(yōu)勢菌門是變形菌門;有益菌如芽孢桿菌屬和根瘤菌屬在玉米胡蘿卜輪作種植中的胡蘿卜根際富集。RM.M與RM.R的細(xì)菌類群差異顯著,群落多樣性較低;NRM.M(玉米胡蘿卜輪作非根際土壤樣品)和NRM.R (胡蘿卜連作非根際土壤樣)的細(xì)菌類群差異不明顯,群落多樣性較高。與連作根際土壤相比,輪作根際土壤中有益菌的相對豐度較大,細(xì)菌相對豐度明顯增加。本研究結(jié)果對通過調(diào)節(jié)根際土壤細(xì)菌組成來保證胡蘿卜產(chǎn)量和質(zhì)量的穩(wěn)定,解決連作問題具有重要的意義。 

【文章來源】:基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2019,38(05)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】:8 頁

【部分圖文】:

輪作和連作對胡蘿卜根際和非根際細(xì)菌多樣性的影響


四個樣品中基于97%細(xì)菌相似性聚類的OTUs稀釋Figure1Therarefactioncurvesbasedon97%similarityforbac-

物種豐度,聚類,樣品,多樣性指數(shù)


.R、NRM.M和NRM.R為一類,RM.M為一類。總之,分析結(jié)果表明RM.M與RM.R的細(xì)菌類群差異顯著;NRM.M與NRM.R的差異不大。表2不同樣品的α多樣性指數(shù)Table2Theαindexdiversityforthedifferentsamples樣品SampleRM.RNRM.RRM.MNRM.M研究物種Observedspecies1724248519882380多樣性指數(shù)Shannon6.8969.4326.6839.476多樣性指數(shù)Chao11764.3662721.5562221.4362533.845多樣性指數(shù)ACE1817.9012758.6872402.7582550.978覆蓋率(%)Coverage(%)0.9950.9880.9870.991圖3不同樣品在屬水平上的物種豐度聚類熱Figure3Theheatmapofdominantgeneradistributionforthedif-ferentsample圖2不同樣品在門水平上的組成和相對豐度Figure2Theanalysisoftherelativeabundanceofbacteriaphy-lumofthedifferentsamples2081

相對豐度,樣品,多樣性指數(shù),物種豐度


大。表2不同樣品的α多樣性指數(shù)Table2Theαindexdiversityforthedifferentsamples樣品SampleRM.RNRM.RRM.MNRM.M研究物種Observedspecies1724248519882380多樣性指數(shù)Shannon6.8969.4326.6839.476多樣性指數(shù)Chao11764.3662721.5562221.4362533.845多樣性指數(shù)ACE1817.9012758.6872402.7582550.978覆蓋率(%)Coverage(%)0.9950.9880.9870.991圖3不同樣品在屬水平上的物種豐度聚類熱Figure3Theheatmapofdominantgeneradistributionforthedif-ferentsample圖2不同樣品在門水平上的組成和相對豐度Figure2Theanalysisoftherelativeabundanceofbacteriaphy-lumofthedifferentsamples2081

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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本文編號:3314719

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