以生菜連作和生菜-菠菜輪作不同次數(shù)的土壤樣品為材料,研究比較生菜不同種植方式下土壤細(xì)菌群落的差異。采集0-20 cm深度土壤樣品,分別提取樣品總DNA,采用高通量測(cè)序技術(shù)分析生菜種植前后土壤樣品中細(xì)菌多樣性。測(cè)序結(jié)果經(jīng)過(guò)質(zhì)控過(guò)濾,共獲得有效序列46 865條,對(duì)相似水平為97%的OTU進(jìn)行生物信息統(tǒng)計(jì)分析,共得到OTU 21 692個(gè)。Heatmap圖和群落組成分析顯示,樣品共檢測(cè)到細(xì)菌40個(gè)門(mén),89個(gè)綱,190個(gè)目,371個(gè)科,693個(gè)屬,其中變形菌門(mén)、厚壁菌門(mén)和放線菌門(mén)在連作過(guò)程中占比逐漸下降,而在輪作過(guò)程中較為穩(wěn)定。另外,壤霉菌屬、節(jié)細(xì)菌屬、黃桿菌屬、溶桿菌屬及微細(xì)菌屬等有益菌屬逐漸成為輪作土壤樣品中的優(yōu)勢(shì)菌屬。主成分分析結(jié)果表明,輪作和連作土壤樣品差異明顯。生菜在連續(xù)種植第5次后,產(chǎn)量和過(guò)氧化氫酶活性分別下降了24.1%和20.7%,出現(xiàn)連作障礙,而輪作生菜產(chǎn)量和過(guò)氧化氫酶活性較連作分別提高了49.6%和10.5%。菠菜-生菜輪作土壤中細(xì)菌類(lèi)群具有豐富的多樣性,隨著輪作的增加有上升的趨勢(shì),可在一定程度上緩解生菜連作過(guò)程中出現(xiàn)的問(wèn)題。 

【文章來(lái)源】：生物技術(shù)通報(bào). 2019,35(08)北大核心CSCD

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各土壤樣品在門(mén)分類(lèi)水平上細(xì)菌類(lèi)群比較

2019,35(8)21洪潔等：生菜連作及生菜-菠菜輪作對(duì)土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的影響示，分析表明連作與輪作土壤細(xì)菌群落存在顯著差異（R=0.3542，P=0.04）。圖2各土壤樣品在屬分類(lèi)水平上細(xì)菌類(lèi)群比較圖3土壤樣品中細(xì)菌多樣性的相關(guān)性分析壤樣品細(xì)菌群落多樣性的20.98%，主成分2（PC2）可解釋土壤樣品細(xì)菌群落的17.49%，兩者總計(jì)可解釋樣品的38.47%。其中輪作土壤樣品主要集中在PC1和PC2的負(fù)值區(qū)域，連作土壤樣品大部分集中在PC1的負(fù)值區(qū)域和PC2的正值區(qū)域。這樣的結(jié)果與ANOSIM統(tǒng)計(jì)分析的結(jié)果相類(lèi)似，如圖5所圖4基于OTU水平的PCA分析2.4LEfSe多級(jí)物種差異分析組間樣品菌群差異性分析結(jié)果見(jiàn)圖6。與輪作土壤樣品相比較，連作有21個(gè)菌屬發(fā)生改變，包括g_norank_p_Latescibacteria、g_norank_f_BIrii41、g_norank_c_Ardenticatenia、g_11_24、

生物技術(shù)通報(bào)BiotechnologyBulletin222019,Vol.35,No.8g_Panacagrimonas、g_norank__f_env__OPS_17、g_norank_c__OPB35__soil__group、蛭微菌屬（Bdellovibrio）、g_unclassified_f_FamilyI_o__SubsectionIV、g_unclassified_f__Blastocatellaceae__Subgroup_4_、珊瑚狀放線菌屬（Actinocorallia）、g_norank_f_FamilyI_o_SubsectionIV、g_norank_c_BD7_11、苯基桿菌屬（Phenylobacterium）、g_norank_c_Pla3_lineage、索氏菌屬（Thauera）、g_norank_o_MVP_88、Inquilinus、Tepidanaerobacter和g_norank_o_Lineage_IIb的相對(duì)豐度顯著升高；而鞘氨醇單胞菌屬（Sphingomonas）、芽胞桿菌目未知菌屬（g_unclassified_o_Bacillales）、類(lèi)諾卡氏菌科未知菌屬（g_unclassified_f_Nocardioidaceae）、Ilumatobacter、類(lèi)芽孢桿菌屬（Paenibacillus）、馬杜拉放線菌屬（Actinomadura）、Solirubrobacter、Iamia、中慢生根瘤菌屬（Mesorhizobium）、g_unclassified_f_Phyllobacteriaceae、g_norank_o_Ardenticatenales、Skermanella、Cohnella、特呂珀菌屬（Truepera）、Lautropia、Anaerotruncus、Limnobacter、Haloactinopolyspora、Defluviicoccus、g_norank_f_MNC12、貧養(yǎng)桿菌屬（Modestobacter）、Marinimicrobium、房間芽孢桿菌屬（Domibacillus）、Parafilimonas、丙酸桿菌科未知菌屬（g_unclassified_f_Propionibacteriaceae）和g_norank_f_Euzebyaceae而的相對(duì)豐度顯著降低。圖5基于OTU水平的ANOSIM分析圖6LEfSe分析屬水平下LDA值分布柱狀圖

【參考文獻(xiàn)】：
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碩士論文
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本文編號(hào)：3240868