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作物種質資源大數(shù)據(jù)體系研究

發(fā)布時間:2021-03-26 18:43
  隨著生物技術的快速發(fā)展和數(shù)據(jù)獲取方式的多源化,作物種質資源研究領域產(chǎn)生了大量的結構化、半結構化和非結構化數(shù)據(jù),作物種質資源邁入了大數(shù)據(jù)時代。大數(shù)據(jù)技術在海量異構數(shù)據(jù)處理方面具有絕對優(yōu)勢,通過對數(shù)據(jù)高度自動化的分析,做出歸納性的推理,從中挖掘出潛在的模式和規(guī)則,為社會提供更具價值的信息。雖然近年來我國部分學者逐漸意識到建設作物種質資源大數(shù)據(jù)的重要性,然而作物種質資源大數(shù)據(jù)相關概念尚需界定與明晰,作物種質資源大數(shù)據(jù)體系及其內容尚待建立與實施。因此,本文基于作物種質資源大數(shù)據(jù)的研究現(xiàn)狀,對作物種質資源大數(shù)據(jù)體系構建進行了一定的理論探索與實踐創(chuàng)新,旨在為進一步推動作物種質資源大數(shù)據(jù)建設提供理論依據(jù)和應用借鑒。本文研究工作主要包括以下幾個方面:(1)構建了作物種質資源大數(shù)據(jù)體系總體框架。提出了基于大數(shù)據(jù)和作物種質資源的體系構建依據(jù),制定了適用性、系統(tǒng)性、兼容性等8項體系建設原則,提出了以“基礎-目標-過程-保障”為主路線的作物種質資源大數(shù)據(jù)四維要素結構,包括作物種質資源業(yè)務需求、大數(shù)據(jù)技術、數(shù)據(jù)加工和標準規(guī)范等,確定了體系構建的邊界與內容,設計了作物種質資源大數(shù)據(jù)體系的總體框架。(2)詳細設計了... 

【文章來源】:中國農(nóng)業(yè)科學院北京市

【文章頁數(shù)】:109 頁

【學位級別】:博士

【部分圖文】:

作物種質資源大數(shù)據(jù)體系研究


作物種質資源數(shù)據(jù)分類Fig.4-2Classificationofcropgermplasmresourcesdata通過對作物種質資源業(yè)務的調研可知,作物種質資源數(shù)據(jù)通常有以下幾個特征:第一,數(shù)據(jù)

麥穗,表型,小區(qū),圖像


中國農(nóng)業(yè)科學院博士學位論文第五章技術/工具體系設計59由于普通數(shù)碼相機具備高分辨率、低成本和高可靠性的特點,因此被廣泛用于實驗中(ZHOUetal.,2012;JIetal.,2012;CHANGetal.,2012;AQUINOetal.,2015;MALDONADOetal.,2016)。可將數(shù)碼相機加裝到田間移動表型平臺(SVENSGAARDetal.,2014;CRAINetal.,2016;STARKetal.,2016;CENDRERO-MATEOetal.,2017)上采集RGB數(shù)據(jù),但會增加實驗成本,本次實驗通過人工手持DJIHG310OSMO+相機在自然光照下以距地面1.7m至1.9m的高度垂直向下拍攝。這樣做的優(yōu)點是使得麥穗之間盡可能不發(fā)生遮擋,同時麥穗在圖像中表現(xiàn)大小適中,清晰可辨。(a)實驗小區(qū)(b)原始小麥表型圖像圖5-8實驗小區(qū)麥穗表型圖像Fig.5-8Experimentalplotandphenotypicimagesofwheatear(2)數(shù)據(jù)預處理采集的麥穗圖像每幅大小約3MB~4MB,分辨率為4000×2250。為了有效計算小麥單位面積穗數(shù),在數(shù)據(jù)處理分析前先對圖像進行壓縮和統(tǒng)一圖片大小等預處理操作。對原始圖像進行截取,僅保留紅色邊框區(qū)域,并將分辨率設置為1000×1004,再對處理后的圖像進行標注。實驗使用LabelImg軟件標注了136幅圖片約10000個麥穗樣本作為訓練數(shù)據(jù)集,另外標注了12幅圖片1400個麥穗樣本作為測試數(shù)據(jù)集用于對訓練生成的麥穗檢測模型進行驗證。如圖5-9所示。在標注過程中需對圖片中所有麥穗進行標注,不能只對部分麥穗標注,否則將影響模型的檢測效果,同時對于存在部分重疊的麥穗也要標注,這樣有利于檢測模型對重疊麥穗的識別。(a)標注前(b)標注后圖5-9標注前和標注后的訓練數(shù)據(jù)Fig.5-9Trainingdatabeforeandafterlabeling

作物種質資源大數(shù)據(jù)體系研究


標注前和

【參考文獻】:
期刊論文
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博士論文
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本文編號:3102065

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