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六種儲(chǔ)糧甲蟲(chóng)線粒體基因組測(cè)定及分析

發(fā)布時(shí)間:2021-03-15 16:41
  鞘翅目(Coleoptera)昆蟲(chóng)通稱(chēng)甲蟲(chóng),屬于昆蟲(chóng)綱、有翅亞綱、全變態(tài)類(lèi),由原鞘亞目(Archostemata),藻食亞目(Myxophaga),肉食亞目(Adephaga)和多食亞目(Polyphaga)四個(gè)亞目組成。甲蟲(chóng)是世界上最具多樣性的類(lèi)群,目前已知39萬(wàn)多種,約占全球已知昆蟲(chóng)總數(shù)的三分之一,其中有很多種類(lèi)的幼蟲(chóng)和成蟲(chóng)對(duì)畜牧業(yè)、農(nóng)林業(yè)和倉(cāng)儲(chǔ)業(yè)具有嚴(yán)重的危害。在儲(chǔ)糧害蟲(chóng)中,最重要的是甲蟲(chóng)。儲(chǔ)糧甲蟲(chóng)是一類(lèi)能在干燥的儲(chǔ)糧里正常生活、繁殖的危害嚴(yán)重的昆蟲(chóng),目前全球廣泛使用磷化氫等呼吸毒劑來(lái)對(duì)其進(jìn)行防治。磷化氫主要作用于線粒體呼吸鏈,而線粒體基因組編碼的很多基因都直接參與細(xì)胞呼吸過(guò)程。線粒體是細(xì)胞進(jìn)行有氧呼吸的主要場(chǎng)所,其基因組因具有組成穩(wěn)定,排列相對(duì)保守、序列簡(jiǎn)單、進(jìn)化速率快、普遍為母系遺傳等特點(diǎn)被廣泛地用作分子標(biāo)記以及研究昆蟲(chóng)的系統(tǒng)發(fā)育和種群的遺傳變異與分化。目前在GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)中可以檢索到44條鞘翅目昆蟲(chóng)線粒體基因組的全序列和76條接近完全的序列,然而僅有2條完整的線粒體基因組序列來(lái)自儲(chǔ)糧甲蟲(chóng)。本研究對(duì)雜擬谷盜(Tribolium confusum),美洲黑擬谷盜(Trib... 

【文章來(lái)源】:陜西師范大學(xué)陜西省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】:104 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
Abstract
第1章 前言
    1.1 線粒體基因組概述
        1.1.1 線粒體基因組的結(jié)構(gòu)特征
        1.1.2 線粒體基因組各組分特征
    1.2 鞘翅目與研究物種介紹
        1.2.1 鞘翅目簡(jiǎn)介
        1.2.2 鞘翅目昆蟲(chóng)線粒體基因組研究現(xiàn)狀
        1.2.3 研究物種介紹
    1.3 論文的研究目的及意義
第2章 研究材料與方法
    2.1 研究材料
        2.1.1 動(dòng)物材料
        2.1.2 主要儀器與試劑
    2.2 研究方法
        2.2.1 DNA的提取與檢測(cè)
        2.2.2 引物設(shè)計(jì)與PCR擴(kuò)增
        2.2.3 序列拼接與注釋
        2.2.4 系統(tǒng)發(fā)育分析
第3章 六種多食亞目甲蟲(chóng)線粒體基因組
    3.1 雜擬谷盜線粒體基因組
        3.1.1 基因組結(jié)構(gòu)
        3.1.2 堿基組成
        3.1.3 基因的間隔區(qū)與重疊區(qū)
        3.1.4 蛋白質(zhì)編碼基因
        3.1.5 tRNA基因與rRNA基因
        3.1.6 A+T豐富區(qū)
    3.2 美洲黑擬谷盜線粒體基因組
        3.2.1 基因組結(jié)構(gòu)
        3.2.2 堿基組成
        3.2.3 基因的間隔區(qū)與重疊區(qū)
        3.2.4 蛋白質(zhì)編碼基因
        3.2.5 tRNA基因與rRNA基因
        3.2.6 A+T豐富區(qū)
    3.3 米象線粒體基因組
        3.3.1 基因組結(jié)構(gòu)
        3.3.2 堿基組成
        3.3.3 基因的間隔區(qū)與重疊區(qū)
        3.3.4 蛋白質(zhì)編碼基因
        3.3.5 tRNA基因與rRNA基因
    3.4 鋸谷盜線粒體基因組
        3.4.1 基因組結(jié)構(gòu)
        3.4.2 堿基組成
        3.4.3 基因的間隔區(qū)與重疊區(qū)
        3.4.4 蛋白質(zhì)編碼基因
        3.4.5 tRNA基因與rRNA基因
    3.5 綠豆象線粒體基因組
        3.5.1 基因組結(jié)構(gòu)
        3.5.2 堿基組成
        3.5.3 基因的間隔區(qū)與重疊區(qū)
        3.5.4 蛋白質(zhì)編碼基因
        3.5.5 tRNA基因與rRNA基因
        3.5.6 A+T豐富區(qū)
    3.6 煙草甲線粒體基因組
        3.6.1 基因組結(jié)構(gòu)
        3.6.2 堿基組成
        3.6.3 基因的間隔區(qū)與重疊區(qū)
        3.6.4 蛋白質(zhì)編碼基因
        3.6.5 tRNA基因與rRNA基因
    3.7 六種多食亞目甲蟲(chóng)線粒體基因組比較
        3.7.1 基因組結(jié)構(gòu)與堿基組成
        3.7.2 蛋白質(zhì)編碼基因
        3.7.3 基因間隔與基因重疊
        3.7.4 tRNA基因
第4章 多食亞目甲蟲(chóng)蛋白質(zhì)編碼基因比較研究
    4.1 蛋白質(zhì)編碼基因的堿基組成
    4.2 蛋白質(zhì)編碼基因的氨基酸使用頻率
    4.3 蛋白質(zhì)編碼基因的密碼子使用情況
    4.4 蛋白質(zhì)編碼基因的起始密碼子
第5章 多食亞目甲蟲(chóng)系統(tǒng)發(fā)育分析
    5.1 材料與方法
        5.1.1 外類(lèi)群的選擇
        5.1.2 序列來(lái)源
        5.1.3 序列的比對(duì)與修飾
    5.2 建樹(shù)結(jié)果分析
        5.2.1 似然法構(gòu)建的多食亞目系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)
        5.2.2 貝葉斯法構(gòu)建的多食亞目系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)
        5.2.3 系統(tǒng)發(fā)育結(jié)果分析及討論
第6章 總結(jié)
參考文獻(xiàn)
致謝
攻讀碩士期間的研究成果


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[3]鞘翅目高級(jí)階元分子系統(tǒng)學(xué):研究現(xiàn)狀及存在的問(wèn)題[J]. 聶瑞娥,楊星科.  昆蟲(chóng)學(xué)報(bào). 2013(09)
[4]蕭氏松莖象線粒體基因組全序列測(cè)定與分析[J]. 李國(guó)宏,尚娜,魏建榮.  昆蟲(chóng)學(xué)報(bào). 2012(11)
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[6]綠豆象的發(fā)生特點(diǎn)及其防治試驗(yàn)研究[J]. 鄧蕓,王佛生,李元龍.  雜糧作物. 2008(06)
[7]核糖體DNA序列分析在昆蟲(chóng)系統(tǒng)學(xué)研究中的應(yīng)用[J]. 江世宏,孟子燁,陳曉琴,李廣京.  昆蟲(chóng)分類(lèi)學(xué)報(bào). 2008(03)
[8]分子生物學(xué)技術(shù)在鞘翅目昆蟲(chóng)分類(lèi)研究中的應(yīng)用[J]. 陳曉琴,江世宏,李廣京.  華中農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2008(04)
[9]鳳蝶亞科(鳳蝶科,鱗翅目)16S rRNA基因的分子系統(tǒng)發(fā)生分析[J]. 蘇成勇,朱國(guó)萍,郝家勝,陳娜,潘鴻春,吳冬霞,張小平.  動(dòng)物分類(lèi)學(xué)報(bào). 2007(02)
[10]基于線粒體16S rDNA序列探討蛺蝶科(鱗翅目,蝶亞目)主要分類(lèi)群的系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系[J]. 陳娜,朱國(guó)萍,郝家勝,張小平,蘇成勇,潘鴻春,吳冬霞.  動(dòng)物學(xué)報(bào). 2007(01)

博士論文
[1]三種蚱總科昆蟲(chóng)線粒體基因組分析及系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系研究[D]. 林立亮.陜西師范大學(xué) 2014
[2]膜翅目線粒體基因組的特征與進(jìn)化及其在系統(tǒng)發(fā)育研究中的應(yīng)用[D]. 魏書(shū)軍.浙江大學(xué) 2009

碩士論文
[1]基于16S rRNA和12S rRNA基因序列的帽兒山地區(qū)異色瓢蟲(chóng)分子系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系研究[D]. 姚大彬.東北林業(yè)大學(xué) 2009



本文編號(hào):3084483

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