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基于高通量測(cè)序技術(shù)分析2種菌草根際土壤細(xì)菌群落多樣性

發(fā)布時(shí)間:2021-02-28 03:39
  為詳細(xì)了解福州菌草基地巨菌草和綠洲一號(hào)2種菌草的根際土壤細(xì)菌群落組成與結(jié)構(gòu),本研究應(yīng)用高通量測(cè)序技術(shù),分析了巨菌草和綠洲一號(hào)根際土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)及多樣性。結(jié)果表明,菌草根際土檢測(cè)到細(xì)菌類群主要的優(yōu)勢(shì)菌門(mén)為酸桿菌門(mén)(Acidobacteria)、變形菌門(mén)(Proteobacteria)、放線菌門(mén)(Actinobacteria)、厚壁菌門(mén)(Firmicutes)、綠彎菌門(mén)(Chloroflexi)、芽單胞菌門(mén)(Gemmatimonadetes)、硝化螺旋門(mén)(Nitrospirae)、疣微菌門(mén)(Verrucomicrobia)、浮霉菌門(mén)(Planctomycetes);主要的優(yōu)勢(shì)菌綱為γ-變形菌綱(Gammaproteobacteria)、α-變形菌綱(Alphaproteobacteria)、芽孢桿菌綱(Bacilli)、放線菌綱(Actinobacteria)、酸桿菌綱(Acidobacteria-6)、β-變形菌綱(Betaproteobacteria)、酸桿菌綱(Acidobacteriia)、纖線桿菌綱(Ktedonobacteria)、δ-變形菌綱(Deltaproteobact... 

【文章來(lái)源】:熱帶作物學(xué)報(bào). 2019,40(09)北大核心

【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)

【部分圖文】:

基于高通量測(cè)序技術(shù)分析2種菌草根際土壤細(xì)菌群落多樣性


門(mén)水平TOP10的優(yōu)勢(shì)細(xì)菌相對(duì)豐度Fig.1RelativeabundanceofbacterialofTOP10atphylumlevel

土壤細(xì)菌,群落結(jié)構(gòu)


上主要類群為酸桿菌門(mén)(Acidobacteria)、變形菌門(mén)(Proteobacteria)、放線菌門(mén)(Actinobacteria)、厚壁菌門(mén)(Firmicutes)、綠彎菌門(mén)(Chloroflexi)、芽單胞菌門(mén)(Gemmatimonadetes)、硝化螺旋菌門(mén)(Nitrospirae)、疣微菌門(mén)(Verrucomicrobia)、浮霉菌門(mén)(Planctomycetes),相對(duì)豐度分別為87.60%、97.67%、31.70%、21.39%、13.28%、10.46%、5.98%、7.59%、7.01%。巨菌草和綠洲一號(hào)根際土變形菌門(mén)(Proteobacteria)是優(yōu)勢(shì)菌門(mén),其非根際土放線菌門(mén)(Actinobacteria)是優(yōu)勢(shì)菌門(mén)。2.1.2綱水平群落結(jié)構(gòu)分析由圖2可知,巨菌圖1門(mén)水平TOP10的優(yōu)勢(shì)細(xì)菌相對(duì)豐度Fig.1RelativeabundanceofbacterialofTOP10atphylumlevel草和綠洲一號(hào)根際土壤細(xì)菌群落在綱類水平上主要類群為γ-變形菌綱(Gammaproteobacteria)、α-變形菌綱(Alphaproteobacteria)、芽孢桿菌綱(Bacilli)、放線菌綱(Actinobacteria)、酸桿菌綱(Acidobacteria-6)、β-變形菌綱(Betaprote-obacteria)、酸桿菌綱(Acidobacteriia)、纖線桿菌綱(Ktedonobacteria)、δ-變形菌綱(Deltapro-teobacteria)相對(duì)豐度分別為34.08%、29.58%、19.70%、16.30%、16.30%、17.63%、12.00%、7.25%、15.87%。巨菌草和綠洲一號(hào)根際土γ-變形菌綱(Gammaproteobacteria)是優(yōu)勢(shì)菌綱,其非根際土DA052是優(yōu)勢(shì)菌綱。圖2綱水平土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)Fig.2Soilbacterialcommunityatclasslevel2.1.3屬水平群落結(jié)構(gòu)分析由圖3可知,巨菌草和綠洲一號(hào)根際土壤細(xì)菌群落在屬水平上主要類群為葡萄球菌屬(Staphylococcus)、糖多孢菌屬(Saccharopolyspora)、類芽孢桿菌屬(Paeni-bacillus)、沙雷氏菌屬(Serratia)、鏈球菌屬(Strep-toc

土壤細(xì)菌,群落結(jié)構(gòu)


(Bacilli)、放線菌綱(Actinobacteria)、酸桿菌綱(Acidobacteria-6)、β-變形菌綱(Betaprote-obacteria)、酸桿菌綱(Acidobacteriia)、纖線桿菌綱(Ktedonobacteria)、δ-變形菌綱(Deltapro-teobacteria)相對(duì)豐度分別為34.08%、29.58%、19.70%、16.30%、16.30%、17.63%、12.00%、7.25%、15.87%。巨菌草和綠洲一號(hào)根際土γ-變形菌綱(Gammaproteobacteria)是優(yōu)勢(shì)菌綱,其非根際土DA052是優(yōu)勢(shì)菌綱。圖2綱水平土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)Fig.2Soilbacterialcommunityatclasslevel2.1.3屬水平群落結(jié)構(gòu)分析由圖3可知,巨菌草和綠洲一號(hào)根際土壤細(xì)菌群落在屬水平上主要類群為葡萄球菌屬(Staphylococcus)、糖多孢菌屬(Saccharopolyspora)、類芽孢桿菌屬(Paeni-bacillus)、沙雷氏菌屬(Serratia)、鏈球菌屬(Strep-tococcus)、紅游動(dòng)菌屬(Rhodoplanes)、不動(dòng)細(xì)菌屬(Acinetobacter)、未確定屬(CandidatusSolib-acter)、未確定屬(CandidatusKoribacter)、假單胞菌屬(Pseudomonas),相對(duì)豐度分別為8.92%、5.49%、1.71%、2.93%、5.52%、4.89%、2.01%、3.61%、3.31%、0.98%。巨菌草和綠洲一號(hào)根際土葡萄球菌屬(Staphylococcus)是優(yōu)勢(shì)菌屬,其圖3屬水平土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)Fig.3Soilbacterialcommunityatgenuslevel

【參考文獻(xiàn)】:
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本文編號(hào):3055261

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