內(nèi)蒙古鹽漬土不同處理方式對微生物多樣性的影響及南極節(jié)桿菌多相分類研究
發(fā)布時間:2021-01-27 02:03
本文首先對微生物多樣性進行了簡單地介紹,然后說明了對土壤微生物的多樣性的兩種研究方法,即:基于生物或化學(xué)的方法和基于分子生物學(xué)技術(shù)的方法。然后,對于應(yīng)用于微生物多樣性研究的高通量測序技術(shù)進行了分析,又對高通量測序技術(shù)在微生物多樣性的應(yīng)用領(lǐng)域進行了總結(jié)。本文對來自內(nèi)蒙古鹽堿地采用免耕覆膜系列處理、潛耕層培肥系列處理、鋪設(shè)秸稈節(jié)水灌溉系列處理三組改良措施的土壤微生物分別采用可培養(yǎng)微生物分析法或高通量測序分析法進行了分析,可培養(yǎng)實驗結(jié)果表明對于鹽堿地采用免耕覆膜和潛耕層培肥處理可以有效增加土壤中微生物的種類和數(shù)目,鋪設(shè)秸稈后可以節(jié)省常規(guī)灌溉量的10%。高通量測序結(jié)果表明鹽堿地采用免耕覆膜處理微生物多樣性較高,潛耕層培肥處理微生物多樣性較低。此外,本文還對實驗室從南極長城科考站附近土壤中分離得到的一株細菌NJ-Z5T進行了系統(tǒng)分類研究。研究表明,菌株NJ-Z5 T與節(jié)桿菌屬中Arthrobacter sulfonivorans JCM13520T親緣關(guān)系最近,其16S rRNA相似度為98.07%,初步確定為疑似新種。DNA同源...
【文章來源】:北京理工大學(xué)北京市 211工程院校 985工程院校
【文章頁數(shù)】:70 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
鹽堿地免耕覆膜實驗系列處理土壤中細菌群落稀釋曲線
Sample nameShannon(mean±SD)Simpson(mean±SD)Chao1(mean±SD)ACE(mean±SD)YJD1 9.715±0.125 0.996±0.000 3,696.247±333.520 3,793.669±370.798YJD2 9.828±0.116 0.996±0.001 3,896.566±236.882 3,987.135±264.609YJD3 9.836±0.026 0.997±0.001 3,920.573±95.714 4,095.262±163.988YJD4 9.935±0.045 0.997±0.000 3,945.300±62.699 4,025.552±53.380YJD5 9.728±0.177 0.995±0.001 3,759.280±184.363 3,919.664±216.9812.3.1.2.2 聚類分析本實驗在門水平共檢測出 46 個菌門,門水平排名前 10 的各組處理中微生物優(yōu)勢菌群分布情況如圖2.2所示,所有鹽堿地中優(yōu)勢物種為Proteobacteria(變形菌門) 、Actinobacteria( 放線菌門 ) 、 Acidobacteria( 酸桿菌門 ) 、 Firmicutes( 硬壁菌門 ) 、Bacteroidetes(擬桿菌門)等,其中 Proteobacteria(變形菌門)所占比例均為最高。排名前 10 的門水平細菌占所有微生物種類的 91.71%-94.00%。免耕結(jié)合地膜覆蓋(YJD4)中 Proteobacteria(變形菌門)在所有微生物種類所占的比例最少為 36.63%。
2.3.1.2.2 聚類分析本實驗在門水平共檢測出 46 個菌門,門水平排名前 10 的各組處理中微生物優(yōu)勢菌群分布情況如圖2.2所示,所有鹽堿地中優(yōu)勢物種為Proteobacteria(變形菌門) 、Actinobacteria( 放線菌門 ) 、 Acidobacteria( 酸桿菌門 ) 、 Firmicutes( 硬壁菌門 ) 、Bacteroidetes(擬桿菌門)等,其中 Proteobacteria(變形菌門)所占比例均為最高。排名前 10 的門水平細菌占所有微生物種類的 91.71%-94.00%。免耕結(jié)合地膜覆蓋(YJD4)中 Proteobacteria(變形菌門)在所有微生物種類所占的比例最少為 36.63%。在科水平分析鑒定出 341 個菌科。如圖 2.3 所示,已被鑒定的序列中其中排名前 10 的優(yōu)勢菌科為 OM1_clade、Bacillaceae(芽胞桿菌科)、Pseudomonadaceae(假單胞菌科)、Halomonadaceae(鹽單胞菌科)、Xanthomonadaceae(黃單胞菌科)、圖 2.2 鹽堿地免耕覆膜系列處理細菌群落門水平優(yōu)勢物種Fig2.2 Dominant bacterial community species in phylum level treated with no-tillage film series
本文編號:3002221
【文章來源】:北京理工大學(xué)北京市 211工程院校 985工程院校
【文章頁數(shù)】:70 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
鹽堿地免耕覆膜實驗系列處理土壤中細菌群落稀釋曲線
Sample nameShannon(mean±SD)Simpson(mean±SD)Chao1(mean±SD)ACE(mean±SD)YJD1 9.715±0.125 0.996±0.000 3,696.247±333.520 3,793.669±370.798YJD2 9.828±0.116 0.996±0.001 3,896.566±236.882 3,987.135±264.609YJD3 9.836±0.026 0.997±0.001 3,920.573±95.714 4,095.262±163.988YJD4 9.935±0.045 0.997±0.000 3,945.300±62.699 4,025.552±53.380YJD5 9.728±0.177 0.995±0.001 3,759.280±184.363 3,919.664±216.9812.3.1.2.2 聚類分析本實驗在門水平共檢測出 46 個菌門,門水平排名前 10 的各組處理中微生物優(yōu)勢菌群分布情況如圖2.2所示,所有鹽堿地中優(yōu)勢物種為Proteobacteria(變形菌門) 、Actinobacteria( 放線菌門 ) 、 Acidobacteria( 酸桿菌門 ) 、 Firmicutes( 硬壁菌門 ) 、Bacteroidetes(擬桿菌門)等,其中 Proteobacteria(變形菌門)所占比例均為最高。排名前 10 的門水平細菌占所有微生物種類的 91.71%-94.00%。免耕結(jié)合地膜覆蓋(YJD4)中 Proteobacteria(變形菌門)在所有微生物種類所占的比例最少為 36.63%。
2.3.1.2.2 聚類分析本實驗在門水平共檢測出 46 個菌門,門水平排名前 10 的各組處理中微生物優(yōu)勢菌群分布情況如圖2.2所示,所有鹽堿地中優(yōu)勢物種為Proteobacteria(變形菌門) 、Actinobacteria( 放線菌門 ) 、 Acidobacteria( 酸桿菌門 ) 、 Firmicutes( 硬壁菌門 ) 、Bacteroidetes(擬桿菌門)等,其中 Proteobacteria(變形菌門)所占比例均為最高。排名前 10 的門水平細菌占所有微生物種類的 91.71%-94.00%。免耕結(jié)合地膜覆蓋(YJD4)中 Proteobacteria(變形菌門)在所有微生物種類所占的比例最少為 36.63%。在科水平分析鑒定出 341 個菌科。如圖 2.3 所示,已被鑒定的序列中其中排名前 10 的優(yōu)勢菌科為 OM1_clade、Bacillaceae(芽胞桿菌科)、Pseudomonadaceae(假單胞菌科)、Halomonadaceae(鹽單胞菌科)、Xanthomonadaceae(黃單胞菌科)、圖 2.2 鹽堿地免耕覆膜系列處理細菌群落門水平優(yōu)勢物種Fig2.2 Dominant bacterial community species in phylum level treated with no-tillage film series
本文編號:3002221
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