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三七種植土壤放線菌群落多樣性的初步研究

發(fā)布時間:2020-09-14 09:30
   三七是我國特有的一種中藥材,具有很高的藥用價值和經(jīng)濟價值。三七的生長對土壤、氣候等環(huán)境條件要求特殊,且生長周期長,免耕時間為3-5年。三七的連作障礙嚴重,種植間隔達20年之久。微生物變化,尤其是病原滋生被認為是三七連作障礙的一個重要原因。放線菌是土壤生態(tài)中一個重要的類群,在農(nóng)業(yè)病蟲害的防治中具有重要作用,但是在三七種植生態(tài)中的作用鮮有報道。因此,本研究通過MiSeq高通量測序和純培養(yǎng)相結(jié)合的手段對三七種植土壤的放線菌群落結(jié)構(gòu)和多樣性變化進行分析,并初步評估了純培養(yǎng)菌株對三七根腐病主要病原菌的生防潛力及其對10種三七常用農(nóng)藥的響應(yīng)。研究結(jié)果對于理解放線菌在三七種植中的生態(tài)功能具有重要意義。MiSeq高通量測序結(jié)果表明,非種植土壤中的放線菌主要分布于8目44科的115 屬,在科水平上 unclassified、Pseudonocardiaceae、Micromonosporaceae 為優(yōu)勢類群,在屬水平上unclassified和Mycobacterium為優(yōu)勢放線菌類群,隨著時間的變化,非種植土壤中的放線菌群落結(jié)構(gòu)相對穩(wěn)定。三七種植土壤放線菌主要分布于8目45科的117屬,在科水平上unclassified、Pseudonocardiaceae、Micromonosporaceae為優(yōu)勢類群,在屬水平上unclassified和Mycobacterium為優(yōu)勢放線菌類群。與對照組相比,三七種植土壤中Thermoleophilales和Thermoleophilaceae的豐度顯著降低;而剛種植三七的土壤中Nocardioidaceae和Streptomycetaceae相對豐度明顯升高,但是隨著種植時間增長,其相對豐度大幅度降低,同樣的變化趨勢也體現(xiàn)在屬于Nocardioidaceae的Nocardioides和Marmoricola以及屬于Streptomycetaceae的Streptomyces的豐度變化上。占比例最高的unclassifed類群隨著種植時間的增加略有升高。從三七種植土壤中共分離獲得放線菌446株,分布于7目8科10屬中,Streptomycetale、Streptomycetaceae、Streptomyces均為3個樣品的優(yōu)勢類群,占79%。隨著時間的變化,三七種植土壤與非種植土壤樣品放線菌數(shù)量量呈現(xiàn)先增加后減少的趨勢,鏈霉菌屬無明顯變化。采用平板對峙培養(yǎng)法和瓊脂擴散法,以Fusarium solani、Epicoccum nigrum、Phomaherbarum、Fusarium oxysporum、Fusarium flocciferum、Alterrnaria panax、Plectosphaerellc cucumeriaa 7株三七病原菌為靶標,篩選對三七病原菌有抑制活性的放線菌。結(jié)果顯示28株放線菌對7株病原菌具有不同程度的抑制作用,其中菌株 PH21294(Streptomyc s spiroverticillauus)對 7 株病原菌抑制作用明顯,對A.panax的抑菌圈直徑達40.0 mm,具有較好的生防應(yīng)用潛力。通過生物量法,評價活性菌株P(guān)H21294(S.spiroverticillatus)對10種三七常用農(nóng)藥的耐受性。結(jié)果表明在低濃度下(0.1 μg/mL)9種三七常用農(nóng)藥可以促進菌株P(guān)H21294的生長。當(dāng)甲霜·錳鋅的濃度為0.1μg/mL時,PH21294的生物量是對照組的6倍。在高濃度時,7種農(nóng)藥能夠抑制PH21294生長;當(dāng)甲硫·福美雙、代森錳鋅濃度為50μg/mL時,異菌脲、殺撲磷和高氯·馬的濃度為110 μg/mL時,多抗霉素和甲霜·錳鋅在濃度為330 μg/mL時,菌株P(guān)H21294均無法生長。.而腐霉利在高濃度下(330μg/mL)仍表現(xiàn)出促進PH21294生長。
【學(xué)位單位】:云南大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位年份】:2017
【中圖分類】:S567.236;S154.3
【部分圖文】:

三七,植株形態(tài)


監(jiān)測不同環(huán)境過程和生態(tài)功能等的最有效的分子途徑。逡逑1.2三七病害與連作障礙關(guān)系逡逑三七(/^/?似《0/0笑/>7.記/7發(fā)),是一種多年生宿根草本植物(植株形態(tài)見圖1-1),逡逑又稱為田七、金不換等|29],是我國傳統(tǒng)名貴中藥材。生長要求特殊,主要分布在逡逑文山中、高海拔地區(qū)[3(>1。三七有防止動脈硬化和血栓形成、降血脂和血粘稠度,逡逑抗腫瘤,還能增強免疫力等[31_36]。三七中的皂苷作用突出,許多三七中的天然物逡逑質(zhì)己經(jīng)被分離出來[%391。云南文山是三七的主產(chǎn)地,現(xiàn)在以三七作為主要原料的逡逑商品有百余種,如云南白藥、三七片等。逡逑if逡逑v逡逑圖1-1三七植株形態(tài)(王強拍攝)逡逑Fig.邋1-1邋Panax邋notoginseng邋plant邋(photo邋from邋Wang邋Qiang)逡逑三七生長年限比較長,免耕連作加之蔽蔭潮濕的環(huán)境致使三七容易受到病害的逡逑侵襲。為了控制病害和提高產(chǎn)量大量施撒農(nóng)藥化肥,導(dǎo)致了三七生長環(huán)境生態(tài)失逡逑衡

數(shù)據(jù)預(yù)處理,測序


圖2-1邋PCR擴增結(jié)果逡逑-

三七,放線菌,植土,種植土壤


邐CK3逡逑樣品逡逑圖2-2三七非種植土壤放線菌群落在科水平上的分布逡逑Fig邋2-2邋Community邋composition邋of邋actinobacteria邋in邋non-cultivated邋soil邋of邋Panax邋notoginsen^逡逑at邋the邋family邋level逡逑如圖2-2所示,在屬的分類水平上分析非種植土壤樣品中放線菌分布,優(yōu)勢類逡逑群為//"c/a.swyi^t/邋(41.54%)和邋A^v,c(,/^7c/e77"/;7邋(9.24%)。CK1邋分屬于邋100邋個屬和逡逑/"7c7a.v可/W,""c/as’.v丨NB/W、逡逑度為邋43.57邋%,邋8.57邋%,8.34邋°/0。CK2邋中放線菌分布于邋93邋個屬和邋w/7c/a^i/?^/,逡逑13逡逑

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本文編號:2818006

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