葉綠體是植物光合作用的重要場所,葉綠體全基因組是綠色植物獨立遺傳的一種基因組類型。由于核基因信息的復(fù)雜性以及線粒體基因在植物中較慢的進(jìn)化速率,堿基置換率適中的葉綠體基因組越來越多地被用于構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系。隨著高通量測序技術(shù)的發(fā)展,多種植物的葉綠體全基因組序列被獲得,基于葉綠體完整基因組的系統(tǒng)發(fā)育基因組學(xué)研究得到較快發(fā)展。裸子植物作為被子植物的姊妹群,在植物的進(jìn)化中具有重要作用。但在裸子植物的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系構(gòu)建中還存在一些爭議,主要有買麻藤目、銀杏屬、以及紅杉類(北美紅杉、巨杉和水杉)的系統(tǒng)發(fā)育位置。本研究運用高通量測序技術(shù)首先獲取了北美紅杉(Sequoia sempervirens)和巨杉(Sequoiadendron giganteum)兩個物種的完整葉綠體基因組序列,并與已獲得的近緣種水杉(Metasequoia glyptostroboides)的葉綠體基因組序列進(jìn)行比較;進(jìn)而通過提取NCBI數(shù)據(jù)庫中67個物種(2種蕨類植物作為外類群,4個被子植物和61個裸子植物)的葉綠體完整基因組序列構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系。主要研究結(jié)果如下:1)北美紅杉和巨杉的葉綠體基因組長度分別為135,651 b...

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【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖３－１北美紅杉物理圖譜??Ｆｉｇ．?３－１?Ｇｅｎｅ??

?華東師范大學(xué)２０１７屆碩士學(xué)位論文???為反式剪接基因（ｔｒａｎｓ－ｓｐｌｉｃｅｄ?ｇｅｎｅ）??

圖３－２巨杉物理圖譜??Ｆｉｇ．?３－２?Ｇｅｎｅ?ｍａｐ?ｏｆ?ｔｈｅ?Ｓ．?

■?ｔｒａｎｓｆｅｒ?ＲＮＡｓ??網(wǎng)?ｒｉｂｏｓｏｍａｌ?ＲＮＡｓ??圖３－１北美紅杉物理圖譜??Ｆｉｇ．?３－１?Ｇｅｎｅ?ｍａｐ?ｏｆ?ｔｈｅ?Ｓ．?ｓｅｍｐｅｒｖｉｒｅｎｓ?ｃｐ?ｇｅｎｏｍｅ??２２??

圖３－４北美紅杉中ＳＳＲ的數(shù)量??－

?６０－６５??Ｓｉｚｅ?ｏｆ?ｒｅｐｅａｔｓ?（ｂｐ）??圖３－３北美紅杉和巨杉Ｍｉｎｉｓａｔｅｌｌｉｔｅ的頻率分布??Ｆｉｇ．?３－３?Ｆｒｅｑｕｅｎｃｙ?ｏｆ?Ｍｉｎｉｓａｔｅｌｌｉｔｅ?ｂｙ?ｌｅｎｇｔｈ?ｉｎ?ｔｈｅ?ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ?ｇｅｎｏｍｅｓ?Ｓ．?ｓｅｍ....

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