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雜交楊R2R3-MYB基因抗銹菌侵染表達(dá)

發(fā)布時(shí)間:2024-03-17 17:31
  楊樹廣泛分布于北緯3072°間世界各地,因其生長(zhǎng)速度快、無(wú)性繁殖簡(jiǎn)便、用途廣泛、適應(yīng)性強(qiáng)、輪伐期短而備受歡迎,為主要用材樹種。然而,楊樹病蟲害多且重,其中楊樹葉銹病是分布最廣、危害最大的楊樹葉部病害之一。而MYB轉(zhuǎn)錄因子作為存在于所有植物中的轉(zhuǎn)錄因子,對(duì)多種植物特殊進(jìn)程具有重要的調(diào)控作用,在植物與病原互作過(guò)程中扮演重要角色。為系統(tǒng)研究楊樹R2R3-MYB轉(zhuǎn)錄因子在生物脅迫反應(yīng)中的功能,建立關(guān)于R2R3-MYB轉(zhuǎn)錄因子如何調(diào)控具有生物學(xué)功能的特異性靶基因表達(dá)的調(diào)控網(wǎng)絡(luò),從本實(shí)驗(yàn)室收集的對(duì)落葉松-楊柵銹菌E4生理小種感病性存在差異的十余種楊樹品種中挑選出感病指數(shù)為2級(jí)的低感病樹種雜交楊作為主要研究對(duì)象,感病指數(shù)為4級(jí)的高感病樹種歐美楊為對(duì)照樹種。以雜交楊、歐美楊轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)為基礎(chǔ),鑒定得到217個(gè)楊樹R2R3-MYB基因,其中214個(gè)可以對(duì)應(yīng)到毛果楊version 3.0基因組的19條染色體上,另3條定位于scaffold25,scaffold221和scaffold408。轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)生物信息學(xué)分...

【文章頁(yè)數(shù)】:62 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

圖1-1植物MYB轉(zhuǎn)錄因子家族分類Fig.1-1PlantMYBtranscriptionfactorclassesR2R3-MYB僅存在于植物中且在植物中分布最為廣泛,是植物中最大的MYB轉(zhuǎn)錄

圖1-1植物MYB轉(zhuǎn)錄因子家族分類Fig.1-1PlantMYBtranscriptionfactorclassesR2R3-MYB僅存在于植物中且在植物中分布最為廣泛,是植物中最大的MYB轉(zhuǎn)錄

東北林業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文1.2.2MYB轉(zhuǎn)錄因子分類轉(zhuǎn)錄因子通常根據(jù)其所含保守DNA結(jié)合域的類型和數(shù)量進(jìn)行分類。根據(jù)含有MY結(jié)構(gòu)域的數(shù)量可將MYB轉(zhuǎn)錄因子分為1R-MYB、R2R3-MYB、3R-MYB和4R-MYB四類。原型MYB蛋白c-Myb的三....


圖2-1R2R3-MYB轉(zhuǎn)錄因子家族系統(tǒng)發(fā)生樹

圖2-1R2R3-MYB轉(zhuǎn)錄因子家族系統(tǒng)發(fā)生樹

東北林業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文進(jìn)化的單位。在楊樹中,所有的MYB轉(zhuǎn)錄因子都含有1-4個(gè)由大約52個(gè)氨基酸殘基構(gòu)成的MYB結(jié)構(gòu)域。為了明確楊樹MYB轉(zhuǎn)錄因子的分類情況,利用最大似然法,對(duì)雜交楊、歐美楊和擬南芥R2R3-MYB蛋白進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化分析。


圖2-2雜交楊R2R3-MYB基因的染色體定位Fig.2-2ChromosomaldistributionofPopulusR2R3-MYBgenes另外,有些染色體上分布的MYB基因呈現(xiàn)出集群的現(xiàn)象,比如PdtMYB130、PdtMYB131、PdtMYB132和PdtMYB133成簇地定位在了11號(hào)染色體上(圖2-2),而

圖2-2雜交楊R2R3-MYB基因的染色體定位Fig.2-2ChromosomaldistributionofPopulusR2R3-MYBgenes另外,有些染色體上分布的MYB基因呈現(xiàn)出集群的現(xiàn)象,比如PdtMYB130、PdtMYB131、PdtMYB132和PdtMYB133成簇地定位在了11號(hào)染色體上(圖2-2),而

2雜交楊R2R3-MYB基因鑒定2.2.3雜交楊R2R3-MYB基因的染色體定位為了解雜交楊R2R3-MYB基因在楊樹染色體上的定位情況,MYB基因通過(guò)在楊樹version3.0基因組上進(jìn)行比對(duì),發(fā)現(xiàn)在217個(gè)雜交楊R2R3-MYB基因中,有214....


圖2-3銹菌侵染前后雜交楊R2R3-MYBs表達(dá)量Fig.2-3ExpressionchangingofPopulus×euramericanaR2R3-MYBsfollowingtheinfectionofM.larici-populina

圖2-3銹菌侵染前后雜交楊R2R3-MYBs表達(dá)量Fig.2-3ExpressionchangingofPopulus×euramericanaR2R3-MYBsfollowingtheinfectionofM.larici-populina

東北林業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文后雜交楊與歐美楊R2R3-MYB基因表達(dá)量差異分析結(jié)果表明MYB基因中僅有3條R2R3-MYB基因表達(dá)量差異不顯著量顯著,207條R2R3-MYB基因表達(dá)量差異極顯著(表2-2



本文編號(hào):3931385

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