基于SSRs的青海云杉無性系遺傳多樣性及遺傳關系的研究
發(fā)布時間:2024-02-02 15:01
青海云杉(Picea crassifolia Kom.)是松科(Pinaceae)云杉屬(Picea)的木本植物,常綠喬木,是青藏高原東北邊緣特有的森林樹種,也是西北地區(qū)重要的造林和城市綠化樹種,在祁連山乃至西北地區(qū)生態(tài)建設中發(fā)揮著不可替代的作用。目前國內對青海云杉的種子萌發(fā)特性、表型變異、同工酶遺傳變異等研究已有文獻報道,但是基于SSR標記的青海云杉的研究和應用還鮮有報道。本研究主要包含兩部分的內容:(1)青海云杉SSR-PCR反應體系的建立和優(yōu)化,以及引物的篩選;(2)基于SSRs的青海云杉無性系的遺傳多樣性和親緣關系研究。采用正交試驗設計和單因素分析方法,建立并優(yōu)化了青海云杉的SSR-PCR反應體系。結果顯示,青海云杉SSR-PCR最適反應體系為總體積為20.0μL,包括模板DNA(5-10 ng·μL-1)1.0μL、dNTP(10 mmol·L-1)0.45μL、正反向引物(10μmol·L-1)0.25μL、Mg2+(25 mmol·L-1)2.0μL、Taq DNA聚合酶(5 U·μL-1)0.8μL、10×PCR緩沖液2.0μL、HPLC超純水13.25μL。PCR擴增...
【文章頁數】:55 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
本文編號:3892853
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【部分圖文】:
圖2-2青海云杉無性系基因組DNA
(260/280)約為1.8,符合進行ISSR-PCR反應的要求,最后將青海云杉的DNA產物放入-20℃冰箱中保存以備用。青海云杉無性系部分基因組DNA電泳圖譜如圖2-2所示。
圖4-2青海云杉SSR-PCR反應體系的瓊脂糖凝膠電泳圖譜
SSR引物篩選圖4-2青海云杉SSR-PCR反應體系的瓊脂糖凝膠電泳圖譜Fig.4-2ElectrophoreticpatternsofSSR-PCRreactionsystemforQinghaispruce
圖4-2青海云杉SSR引物篩選電泳圖譜
圖4-2為青海云杉無性系編號1-30的EAC1A07引物SSR-PCR擴增電泳結圖4-2青海云杉SSR引物篩選電泳圖譜Fig.4-2ElectrophoreticpatternsofSSRprimerselectionforQinghai....
圖3-3a上圖基于SSRs和Dice相似性系數的青海云杉109個無性系聚類圖
Dice’sSimilarityCoefficient圖3-3a上圖基于SSRs和Dice相似性系數的青海云杉109個無性系聚類圖Fig.3-3aUpperclusterofUPGMAdendrogramfor109clonesofP.....
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