馬尾松產(chǎn)脂性狀EST-SSR引物開(kāi)發(fā)及關(guān)聯(lián)分析
發(fā)布時(shí)間:2023-12-02 11:36
馬尾松(Pinus massoniana Lamb.)屬于松科(Pinaceae)松屬(Pinus L.)雙維管束松亞屬(Subgen.Pinus)常綠喬木。馬尾松是我國(guó)分布最廣泛的針葉樹(shù)種之一,也是我國(guó)重要的荒山造林樹(shù)種和我國(guó)南方林業(yè)產(chǎn)業(yè)的當(dāng)家樹(shù)種。馬尾松脂材兼用是我國(guó)最主要的產(chǎn)脂樹(shù)種,馬尾松松脂占全國(guó)產(chǎn)脂量的70%以上。由于市場(chǎng)對(duì)松脂的需求量較大,但目前可推廣的高產(chǎn)脂馬尾松品系較少,不能滿足市場(chǎng)對(duì)松脂的需求量,因此對(duì)馬尾松產(chǎn)脂性狀的遺傳改良非常重要。傳統(tǒng)的改良方式主要是通過(guò)選擇優(yōu)良單株和雜交實(shí)現(xiàn)的,但這種改良方式所需的周期較長(zhǎng)。而通過(guò)基因組關(guān)聯(lián)分析等方法開(kāi)發(fā)出與馬尾松產(chǎn)脂性狀顯著相關(guān)的分子標(biāo)記,進(jìn)行分子標(biāo)記輔助選擇,可以縮短育種周期,提高育種效率,加快高產(chǎn)脂良種選育的進(jìn)程。本研究通過(guò)對(duì)馬尾松無(wú)性系的3種組織進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,分析轉(zhuǎn)錄組序列中SSR的重復(fù)單元類型、頻率及分布特點(diǎn),根據(jù)產(chǎn)脂差異序列篩選并設(shè)計(jì)合成EST-SSR引物,并對(duì)所開(kāi)發(fā)的259對(duì)引物進(jìn)行驗(yàn)證,將篩選出具有多態(tài)性的EST-SSR引物對(duì)馬尾松無(wú)性系進(jìn)行分型檢測(cè),結(jié)合產(chǎn)脂量表型數(shù)據(jù)進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析,旨在尋找與馬尾松產(chǎn)脂性狀顯著...
【文章頁(yè)數(shù)】:68 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第1章 緒論
1.1 研究背景
1.1.1 馬尾松簡(jiǎn)介
1.1.2 松脂及針葉樹(shù)種的產(chǎn)脂機(jī)理研究
1.1.3 馬尾松高產(chǎn)脂遺傳改良進(jìn)展
1.2 分子標(biāo)記在林木研究中的應(yīng)用進(jìn)展
1.2.1 林木分子標(biāo)記研究進(jìn)展
1.2.2 SSR分子標(biāo)記研究進(jìn)展
1.2.3 SSR標(biāo)記在松樹(shù)研究進(jìn)展
1.3 關(guān)聯(lián)分析研究進(jìn)展
1.3.1 基因組關(guān)聯(lián)分析的概念、優(yōu)點(diǎn)及影響
1.3.2 候選基因關(guān)聯(lián)分析
1.3.3 關(guān)聯(lián)分析在農(nóng)作物的研究
1.3.4 關(guān)聯(lián)分析在林木上的應(yīng)用
1.4 研究?jī)?nèi)容及技術(shù)路線
1.4.1 研究?jī)?nèi)容
1.4.2 研究技術(shù)路線
1.5 研究目的及意義
1.6 項(xiàng)目來(lái)源與經(jīng)費(fèi)支持
第2章 材料與方法
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.1 采集地概況及馬尾松轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的材料
2.1.2 馬尾松引物驗(yàn)證及關(guān)聯(lián)群體的材料
2.2 主要儀器、試劑及配制方法
2.2.1 實(shí)驗(yàn)主要儀器
2.2.2 實(shí)驗(yàn)試劑及配制方法
2.3 實(shí)驗(yàn)方法
2.3.1 提取DNA的方法
2.3.2 馬尾松SSR引物設(shè)計(jì)
2.3.3 PCR擴(kuò)增及檢測(cè)
2.3.4 聚丙烯酰胺凝膠電泳的方法
2.3.5 馬尾松產(chǎn)脂性狀調(diào)查
2.4 數(shù)據(jù)處理
2.4.1 SSR標(biāo)記的設(shè)計(jì)及開(kāi)發(fā)
2.4.2 關(guān)聯(lián)分析的數(shù)據(jù)分析
2.4.3 關(guān)聯(lián)位點(diǎn)的表型效應(yīng)計(jì)算
第3章 結(jié)果與討論
3.1 馬尾松候選基因挖掘及SSR引物設(shè)計(jì)
3.1.1 馬尾松轉(zhuǎn)錄組中SSR重復(fù)單元類型、頻率及分布特點(diǎn)
3.1.2 馬尾松轉(zhuǎn)錄組表達(dá)序列測(cè)序含SSR差異序列分析
3.1.3 SSR引物有效性分析及多態(tài)性檢測(cè)
3.2 馬尾松產(chǎn)脂性狀關(guān)聯(lián)分析
3.2.1 群體結(jié)構(gòu)分析
3.2.2 馬尾松產(chǎn)脂性狀的測(cè)定
3.2.3 關(guān)聯(lián)分析
3.2.4 關(guān)聯(lián)位點(diǎn)的表型效應(yīng)計(jì)算
3.3 討論
3.3.1 基于候選基因策略的馬尾松SSR標(biāo)記開(kāi)發(fā)
3.3.2 基因關(guān)聯(lián)分析
第4章 結(jié)論與展望
4.1 結(jié)論
4.2 展望
參考文獻(xiàn)
攻讀碩士階段發(fā)表論文
致謝
本文編號(hào):3869587
【文章頁(yè)數(shù)】:68 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第1章 緒論
1.1 研究背景
1.1.1 馬尾松簡(jiǎn)介
1.1.2 松脂及針葉樹(shù)種的產(chǎn)脂機(jī)理研究
1.1.3 馬尾松高產(chǎn)脂遺傳改良進(jìn)展
1.2 分子標(biāo)記在林木研究中的應(yīng)用進(jìn)展
1.2.1 林木分子標(biāo)記研究進(jìn)展
1.2.2 SSR分子標(biāo)記研究進(jìn)展
1.2.3 SSR標(biāo)記在松樹(shù)研究進(jìn)展
1.3 關(guān)聯(lián)分析研究進(jìn)展
1.3.1 基因組關(guān)聯(lián)分析的概念、優(yōu)點(diǎn)及影響
1.3.2 候選基因關(guān)聯(lián)分析
1.3.3 關(guān)聯(lián)分析在農(nóng)作物的研究
1.3.4 關(guān)聯(lián)分析在林木上的應(yīng)用
1.4 研究?jī)?nèi)容及技術(shù)路線
1.4.1 研究?jī)?nèi)容
1.4.2 研究技術(shù)路線
1.5 研究目的及意義
1.6 項(xiàng)目來(lái)源與經(jīng)費(fèi)支持
第2章 材料與方法
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.1 采集地概況及馬尾松轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的材料
2.1.2 馬尾松引物驗(yàn)證及關(guān)聯(lián)群體的材料
2.2 主要儀器、試劑及配制方法
2.2.1 實(shí)驗(yàn)主要儀器
2.2.2 實(shí)驗(yàn)試劑及配制方法
2.3 實(shí)驗(yàn)方法
2.3.1 提取DNA的方法
2.3.2 馬尾松SSR引物設(shè)計(jì)
2.3.3 PCR擴(kuò)增及檢測(cè)
2.3.4 聚丙烯酰胺凝膠電泳的方法
2.3.5 馬尾松產(chǎn)脂性狀調(diào)查
2.4 數(shù)據(jù)處理
2.4.1 SSR標(biāo)記的設(shè)計(jì)及開(kāi)發(fā)
2.4.2 關(guān)聯(lián)分析的數(shù)據(jù)分析
2.4.3 關(guān)聯(lián)位點(diǎn)的表型效應(yīng)計(jì)算
第3章 結(jié)果與討論
3.1 馬尾松候選基因挖掘及SSR引物設(shè)計(jì)
3.1.1 馬尾松轉(zhuǎn)錄組中SSR重復(fù)單元類型、頻率及分布特點(diǎn)
3.1.2 馬尾松轉(zhuǎn)錄組表達(dá)序列測(cè)序含SSR差異序列分析
3.1.3 SSR引物有效性分析及多態(tài)性檢測(cè)
3.2 馬尾松產(chǎn)脂性狀關(guān)聯(lián)分析
3.2.1 群體結(jié)構(gòu)分析
3.2.2 馬尾松產(chǎn)脂性狀的測(cè)定
3.2.3 關(guān)聯(lián)分析
3.2.4 關(guān)聯(lián)位點(diǎn)的表型效應(yīng)計(jì)算
3.3 討論
3.3.1 基于候選基因策略的馬尾松SSR標(biāo)記開(kāi)發(fā)
3.3.2 基因關(guān)聯(lián)分析
第4章 結(jié)論與展望
4.1 結(jié)論
4.2 展望
參考文獻(xiàn)
攻讀碩士階段發(fā)表論文
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本文編號(hào):3869587
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