耐水濕竹種SSR引物篩選及基于ISSRs標(biāo)記的耐水濕竹種親緣關(guān)系研究
發(fā)布時間:2023-10-21 14:19
竹類植物是禾本科(Gramineae)竹亞科(Bambusoideae)植物的總稱,是森林資源的重要構(gòu)成部分。我國南方地區(qū)的沿江灘涂地以及低濕地竹類資源較豐富,這些耐水濕竹類對于土地資源的利用、調(diào)整當(dāng)?shù)剞r(nóng)村產(chǎn)業(yè)結(jié)構(gòu)以及改善當(dāng)?shù)氐纳鷳B(tài)環(huán)境具有重要的作用,但一些竹種之間的親緣關(guān)系尚存在爭議,影響了一些竹種的科學(xué)和有效的利用。本論文主要對剛竹屬、苦竹屬和箬竹屬共3個屬11個耐水濕竹種進行了兩方面的研究:(1)耐水濕竹種SSR-PCR反應(yīng)體系的建立和優(yōu)化及SSR引物篩選;(2)基于ISSRs的耐水濕竹種的遺傳多樣性及親緣關(guān)系研究。研究結(jié)果如下:1.采用正交試驗設(shè)計和單因素分析方法建立和優(yōu)化了耐水濕竹種SSR-PCR反應(yīng)體系,篩選了SSR引物。反應(yīng)體系總體積為20.0μL:模板DNA(5-10 ng·μL-1)1.1μL、dNTP(10 mmol·L-1)0.44μL、正反向引物(10μmol·L-1)0.26μL、Mg2+(25 mmol·L-1)2.0μL、Taq DNA聚合酶(5 U·μL-1)0.8μL、10×PCR緩沖液2.0μL、HPLC超純水13.14μL。PCR擴增程序為:94℃...
【文章頁數(shù)】:61 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 文獻綜述
1.1 竹子簡介
1.2 竹類研究現(xiàn)狀
1.2.1 繁殖技術(shù)研究
1.2.2 遺傳學(xué)研究
1.3 DNA分子標(biāo)記技術(shù)
1.3.1 常見分子標(biāo)記技術(shù)簡介
1.3.1.1 RFLP分子標(biāo)記(限制性內(nèi)切酶片段長度多態(tài)性)
1.3.1.2 RAPD分子標(biāo)記(隨機擴增DNA多態(tài)性)
1.3.1.3 AFLP分子標(biāo)記(擴增片段長度多態(tài)性)
1.3.1.4 SCAR分子標(biāo)記(序列特異擴增區(qū)域)
1.3.1.5 SRAP分子標(biāo)記技術(shù)(相關(guān)序列擴增多態(tài)性)
1.3.1.6 SSR分子標(biāo)記(微衛(wèi)星標(biāo)記)
1.3.1.7 ISSR分子標(biāo)記(簡單序列重復(fù)區(qū)間擴增多態(tài)性)
1.3.2 基于分子標(biāo)記的竹亞科研究
1.4 遺傳變異的量化
1.4.1 基本的遺傳參數(shù)
1.4.2 遺傳變異的度量
1.5 研究內(nèi)容、目的和意義
2 耐水濕竹種SSR-PCR反應(yīng)體系的建立、優(yōu)化和引物篩選
2.1 引言
2.2 材料與方法
2.2.1 實驗材料
2.2.2 竹子DNA的提取與檢測方法
2.2.3 耐水濕竹種SSR-PCR反應(yīng)體系建立及優(yōu)化
2.2.4 耐水濕竹種SSR引物篩選
2.3 結(jié)果與分析
2.3.1 供試材料DNA的檢測
2.3.2 正交試驗
2.3.3 SSR-PCR體系優(yōu)化
2.3.4 SSR引物篩選
2.4 討論和結(jié)論
3 基于ISSR-PCR的耐水濕竹種遺傳多樣性及親緣關(guān)系分析
3.1 引言
3.2 材料與方法
3.2.1 材料
3.2.2 實驗方法
3.3 結(jié)果與分析
3.3.1 ISSR引物篩選
3.3.2 耐水濕竹屬遺傳多樣性
3.3.3 耐水濕竹屬遺傳距離及親緣關(guān)系分析
3.3.4 耐水濕竹種親緣關(guān)系
3.4 討論
3.4.1 ISSR反應(yīng)體系的優(yōu)越性
3.4.2 ISSR反應(yīng)體系的優(yōu)化
3.4.3 ISSR在研究耐水濕竹種間親緣關(guān)系的適用性
3.4.4 耐水濕竹種遺傳多樣性
3.4.5 斑苦竹歸屬
3.4.6 ISSR引物特異性條帶
3.4.7 展望
3.5 結(jié)論
參考文獻
附圖
附錄
附錄A SSR-PCR反應(yīng)規(guī)程
附錄B ISSR-PCR反應(yīng)規(guī)程
附錄C ISSR引物序列(UBC Set
附錄D 基于ISSRS的耐水濕竹種遺傳多樣性參數(shù)
附錄E 耐水濕竹種的主坐標(biāo)分析圖
致謝
個人簡歷
本文編號:3856002
【文章頁數(shù)】:61 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 文獻綜述
1.1 竹子簡介
1.2 竹類研究現(xiàn)狀
1.2.1 繁殖技術(shù)研究
1.2.2 遺傳學(xué)研究
1.3 DNA分子標(biāo)記技術(shù)
1.3.1 常見分子標(biāo)記技術(shù)簡介
1.3.1.1 RFLP分子標(biāo)記(限制性內(nèi)切酶片段長度多態(tài)性)
1.3.1.2 RAPD分子標(biāo)記(隨機擴增DNA多態(tài)性)
1.3.1.3 AFLP分子標(biāo)記(擴增片段長度多態(tài)性)
1.3.1.4 SCAR分子標(biāo)記(序列特異擴增區(qū)域)
1.3.1.5 SRAP分子標(biāo)記技術(shù)(相關(guān)序列擴增多態(tài)性)
1.3.1.6 SSR分子標(biāo)記(微衛(wèi)星標(biāo)記)
1.3.1.7 ISSR分子標(biāo)記(簡單序列重復(fù)區(qū)間擴增多態(tài)性)
1.3.2 基于分子標(biāo)記的竹亞科研究
1.4 遺傳變異的量化
1.4.1 基本的遺傳參數(shù)
1.4.2 遺傳變異的度量
1.5 研究內(nèi)容、目的和意義
2 耐水濕竹種SSR-PCR反應(yīng)體系的建立、優(yōu)化和引物篩選
2.1 引言
2.2 材料與方法
2.2.1 實驗材料
2.2.2 竹子DNA的提取與檢測方法
2.2.3 耐水濕竹種SSR-PCR反應(yīng)體系建立及優(yōu)化
2.2.4 耐水濕竹種SSR引物篩選
2.3 結(jié)果與分析
2.3.1 供試材料DNA的檢測
2.3.2 正交試驗
2.3.3 SSR-PCR體系優(yōu)化
2.3.4 SSR引物篩選
2.4 討論和結(jié)論
3 基于ISSR-PCR的耐水濕竹種遺傳多樣性及親緣關(guān)系分析
3.1 引言
3.2 材料與方法
3.2.1 材料
3.2.2 實驗方法
3.3 結(jié)果與分析
3.3.1 ISSR引物篩選
3.3.2 耐水濕竹屬遺傳多樣性
3.3.3 耐水濕竹屬遺傳距離及親緣關(guān)系分析
3.3.4 耐水濕竹種親緣關(guān)系
3.4 討論
3.4.1 ISSR反應(yīng)體系的優(yōu)越性
3.4.2 ISSR反應(yīng)體系的優(yōu)化
3.4.3 ISSR在研究耐水濕竹種間親緣關(guān)系的適用性
3.4.4 耐水濕竹種遺傳多樣性
3.4.5 斑苦竹歸屬
3.4.6 ISSR引物特異性條帶
3.4.7 展望
3.5 結(jié)論
參考文獻
附圖
附錄
附錄A SSR-PCR反應(yīng)規(guī)程
附錄B ISSR-PCR反應(yīng)規(guī)程
附錄C ISSR引物序列(UBC Set
附錄D 基于ISSRS的耐水濕竹種遺傳多樣性參數(shù)
附錄E 耐水濕竹種的主坐標(biāo)分析圖
致謝
個人簡歷
本文編號:3856002
本文鏈接:http://sikaile.net/nykjlw/lylw/3856002.html
最近更新
教材專著