漆樹(shù)(Toxicodendron vernicifluum(Stokes)F.A.Barkl.)是新生代第三紀(jì)古老孑遺樹(shù)種,雌雄同株或異株,變異類型多,在我國(guó)已有2000余年的栽培歷史。漆樹(shù)所產(chǎn)的生漆是一種水球形的乳濁液,其主要成分是漆酚(60%-70%)、漆酶(<1.0%)、漆多糖(5%-7%)、水分(20%-30%)等,生漆中成分占比最高的漆酚對(duì)漆膜性能有著很大的影響。目前,對(duì)漆酚生物合成過(guò)程尚未深入研究,因此,從分子水平探究漆酚的生物合成具有很大的理論價(jià)值與實(shí)踐指導(dǎo)意義。本研究首先從漆樹(shù)不同組織中漆酚含量差異著手,利用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)獲得漆樹(shù)的全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄本,并預(yù)測(cè)可能參與調(diào)控漆酚生物合成的基因。研究結(jié)果為解析漆酚的生物合成途徑和漆樹(shù)品種的改良提供分子生物學(xué)依據(jù)。取得的主要結(jié)果如下:(1)應(yīng)用超高效液相色譜法測(cè)定漆酚含量,探究漆樹(shù)不同組織間漆酚生物合成量的差異。研究發(fā)現(xiàn),漆酚的生物合成主要發(fā)生在葉片組織中,莖中飽和漆酚合成量較低,根中最少,且漆樹(shù)葉片組織中單位質(zhì)量的漆酚積累顯著高于根和莖。(2)基于Pacific Bioscience(Pac Bio)三代測(cè)序技術(shù)和Illumin...

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【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
    1.1 漆樹(shù)生物學(xué)研究進(jìn)展
    1.2 漆酚研究進(jìn)展
    1.3 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及其在植物研究中的應(yīng)用
    1.4 MYB轉(zhuǎn)錄因子研究進(jìn)展
    1.5 研究目的及意義
    1.6 研究?jī)?nèi)容
    1.7 技術(shù)路線
第二章 漆樹(shù)根莖葉組織漆酚含量差異分析
    2.1 試驗(yàn)材料
        2.1.1 植物材料
        2.1.2 試驗(yàn)儀器
        2.1.3 試驗(yàn)試劑
    2.2 試驗(yàn)方法
        2.2.1 漆酚提取
        2.2.2 漆酚含量測(cè)定
    2.3 結(jié)果與分析
        2.3.1 標(biāo)準(zhǔn)曲線繪制
        2.3.2 漆樹(shù)根莖葉漆酚含量差異
    2.4 小結(jié)
第三章 漆樹(shù)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(kù)構(gòu)建及漆酚合成相關(guān)基因挖掘
    3.1 試驗(yàn)材料
        3.1.1 植物材料
        3.1.2 試驗(yàn)儀器
        3.1.3 試驗(yàn)試劑
    3.2 試驗(yàn)方法
        3.2.1 漆樹(shù)總RNA提取及純化
        3.2.2 三代全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
        3.2.3 二代轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
        3.2.4 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)質(zhì)量控制
        3.2.5 轉(zhuǎn)錄本拼接
        3.2.6 二代測(cè)序數(shù)據(jù)與轉(zhuǎn)錄本比對(duì)
        3.2.7 基因功能注釋
        3.2.8 差異表達(dá)基因GO分類和富集分析
        3.2.9 差異表達(dá)基因KEGG注釋和富集分析
        3.2.10 轉(zhuǎn)錄因子分析
        3.2.11 漆酚合成相關(guān)基因篩選
        3.2.12 基因表達(dá)量測(cè)定
    3.3 結(jié)果與分析
        3.3.1 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果分析
        3.3.2 轉(zhuǎn)錄組組裝結(jié)果統(tǒng)計(jì)與分析
        3.3.3 Unigene數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)結(jié)果
        3.3.4 NR數(shù)據(jù)庫(kù)注釋結(jié)果
        3.3.5 KOG數(shù)據(jù)庫(kù)注釋結(jié)果
        3.3.6 COG數(shù)據(jù)庫(kù)注釋結(jié)果
        3.3.7 GO數(shù)據(jù)庫(kù)注釋結(jié)果
        3.3.8 KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)注釋結(jié)果
        3.3.9 差異表達(dá)基因分析
        3.3.10 差異表達(dá)基因GO富集分析
        3.3.11 差異表達(dá)基因KEGG pathyway富集分析
        3.3.12 轉(zhuǎn)錄因子分析
        3.3.13 漆酚合成相關(guān)基因的篩選及表達(dá)分析
        3.3.14 基因表達(dá)量測(cè)定
    3.4 小結(jié)
第四章 基于轉(zhuǎn)錄組的漆樹(shù)MYB轉(zhuǎn)錄因子的篩選及分析
    4.1 試驗(yàn)材料
    4.2 試驗(yàn)方法
        4.2.1 漆樹(shù)MYB轉(zhuǎn)錄本篩選
        4.2.2 生物信息學(xué)分析
    4.3 結(jié)果與分析
        4.3.1 漆樹(shù)MYB家族成員的獲取
        4.3.2 漆樹(shù)MYB蛋白序列的分類與結(jié)構(gòu)域特征分析
        4.3.3 漆樹(shù)MYB轉(zhuǎn)錄因子基序分析
        4.3.4 漆樹(shù)MYB家族蛋白理化性質(zhì)分析
        4.3.5 漆樹(shù)MYB轉(zhuǎn)錄因子的GO注釋分析
        4.3.6 漆樹(shù)MYB轉(zhuǎn)錄因子的聚類分析
        4.3.7 漆樹(shù)MYB轉(zhuǎn)錄因子基因表達(dá)分析
    4.4 小結(jié)
第五章 漆葉漆酚積累和相關(guān)基因表達(dá)量對(duì)MeJA的響應(yīng)
    5.1 試驗(yàn)材料
        5.1.1 植物材料
        5.1.2 試驗(yàn)儀器
        5.1.3 試驗(yàn)試劑
    5.2 試驗(yàn)方法
        5.2.1 漆酚提取
        5.2.2 漆酚含量測(cè)定
        5.2.3 基因表達(dá)量測(cè)定
        5.2.4 數(shù)據(jù)分析
    5.3 結(jié)果與分析
        5.3.1 茉莉酸甲酯對(duì)漆葉漆酚含量的影響
        5.3.2 茉莉酸甲酯誘導(dǎo)下漆酚含量測(cè)定結(jié)果
        5.3.3 茉莉酸甲酯對(duì)漆酚合成相關(guān)基因的影響
    5.4 小結(jié)
第六章 討論與結(jié)論
    6.1 討論
    6.2 結(jié)論
    6.3 創(chuàng)新點(diǎn)
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
作者簡(jiǎn)介



本文編號(hào)：3831097