土壤鹽漬化一直是困擾農(nóng)業(yè)生產(chǎn)的一大難題,對(duì)于土地資源日趨緊張的今天,如何合理利用鹽漬化土壤成為了當(dāng)今各國(guó)的一個(gè)重要課題。運(yùn)用蛋白質(zhì)組學(xué)的研究方法研究植物在鹽脅迫下的應(yīng)答機(jī)制,發(fā)掘參與鹽應(yīng)答反應(yīng)的關(guān)鍵蛋白,對(duì)于全面揭示植物的抗鹽機(jī)理有重要的意義。本研究通過(guò)基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)同位素標(biāo)記相對(duì)和絕對(duì)定量(isobaric tags for relative and absolute quantitation,i TRAQ)技術(shù),以AB SCIEX Triple TOFTM5600液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜儀為研究平臺(tái),分析研究了二倍體和四倍體白花泡桐鹽脅迫處理后的表達(dá)差異,為進(jìn)一步研究相關(guān)基因及其編碼的蛋白功能打下基礎(chǔ),以探究泡桐抗鹽分子機(jī)制。在本次質(zhì)譜實(shí)驗(yàn)中共鑒定到2851個(gè)蛋白,8590個(gè)肽段,其中含7221個(gè)Unique肽段,并對(duì)這2851個(gè)蛋白進(jìn)行GO(Gene Ontology)COG(Cluster of Ortholog Genes)KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)注釋分析,這些蛋白被注釋到47個(gè)GO條目上,屬于24個(gè)COG cl...

【文章頁(yè)數(shù)】：39 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
致謝
摘要
1 文獻(xiàn)綜述
    1.1 植物鹽脅迫在國(guó)內(nèi)外的研究進(jìn)展
    1.2 植物蛋白質(zhì)組研究
        1.2.1 蛋白質(zhì)組學(xué)產(chǎn)生背景和相關(guān)概念
        1.2.2 蛋白質(zhì)組學(xué)的研究方法
        1.2.3 轉(zhuǎn)錄組學(xué)與蛋白質(zhì)組學(xué)的關(guān)聯(lián)
        1.2.4 植物響應(yīng)鹽脅迫蛋白質(zhì)組學(xué)研究
    1.3 二倍體和四倍體泡桐的研究
        1.3.1 泡桐概述
        1.3.2 泡桐新品種的培育
    1.4 本文研究的目的和意義
2 引言
3 材料與方法
    3.1 試驗(yàn)材料及鹽處理
    3.2 主要試劑和儀器設(shè)備
        3.2.1 主要試劑
        3.2.2 主要儀器設(shè)備
    3.3 蛋白質(zhì)提取
    3.4 iTRAQ實(shí)驗(yàn)
        3.4.1 蛋白消化
        3.4.2 iTRAQ標(biāo)記
        3.4.3 SCX分離
        3.4.4 基于Triple TOF 5600 的LC-ESI-MSMS分析
    3.5 生物信息學(xué)分析
        3.5.1 數(shù)據(jù)庫(kù)的選擇和搜索
        3.5.2 蛋白質(zhì)鑒定信息統(tǒng)計(jì)
        3.5.3 差異蛋白關(guān)聯(lián)分析
    3.6 總RNA的提取
    3.7 qRT-PCR驗(yàn)證
4 結(jié)果與分析
    4.1 樣品蛋白質(zhì)含量
    4.2 蛋白質(zhì)鑒定
        4.2.1 基本鑒定信息
        4.2.2 蛋白組整體分布情況
    4.3 蛋白質(zhì)注釋
        4.3.1 GO分類
        4.3.2 COG分類
        4.3.3 Pathway代謝通路分類
    4.4 差異蛋白統(tǒng)計(jì)
        4.4.1 蛋白質(zhì)相對(duì)定量
        4.4.2 鹽應(yīng)答蛋白確定方案分析
        4.4.3 鹽應(yīng)答蛋白的GO分類
        4.4.4 鹽應(yīng)答蛋白Pathway分析
    4.5 蛋白質(zhì)組與轉(zhuǎn)錄組的關(guān)聯(lián)分析
    4.6 差異表達(dá)蛋白的qRT-PCR驗(yàn)證
5 結(jié)論與討論
參考文獻(xiàn)
ABSTRACT



本文編號(hào)：3777987