發(fā)布時間：2022-08-29 18:41

　　馬尾松（Pinus massoniana Lamb.）是我國主要產(chǎn)脂樹種之一,近些年來由于其森林面積和產(chǎn)脂樹木的減少,導(dǎo)致松脂產(chǎn)量降低;采用經(jīng)典的輪回育種策略對馬尾松高產(chǎn)脂進行遺傳改良所需周期較長,短時間內(nèi)難以滿足市場對馬尾松高產(chǎn)脂良種的需求。運用基因組關(guān)聯(lián)分析方法,通過篩選出與產(chǎn)脂性狀顯著關(guān)聯(lián)的分子標記,開展分子標記輔助選擇研究,對馬尾松高產(chǎn)脂良種快速選育,縮短育種周期具有重要意義。而對于顯著性關(guān)聯(lián)標記所在基因序列進行深度挖掘,是發(fā)現(xiàn)控制目標性狀重要基因的有效途徑,對于深層次探究并最終揭示馬尾松產(chǎn)脂量性狀遺傳調(diào)控機理具有重要意義。本研究基于馬尾松產(chǎn)脂性狀候選基因組關(guān)聯(lián)分析和簡化基因組關(guān)聯(lián)分析研究所得到的3個顯著性關(guān)聯(lián)分子標記（1個SSR標記和2個SNP標記）,開展相關(guān)基因序列深度挖掘工作。研究的主要內(nèi)容包括:（1）基于高通量轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果對SSR-PCZ90標記所在基因序列進行追溯,并通過生物信息學(xué)軟件分析SSR-PCZ90標記所在的mRNA序列,包括同源序列比對、蛋白結(jié)構(gòu)（包括一級、二級和三級結(jié)構(gòu)）和功能基因的預(yù)測;（2）基于通過簡化基因組測序獲得的SNP-M181697、SNP-... 

【文章頁數(shù)】：55 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
第1章 前言
    1.1 研究背景與目的意義
    1.2 國內(nèi)外研究進展
        1.2.1 針葉樹產(chǎn)脂機理的研究
        1.2.2 谷胱甘肽S-轉(zhuǎn)移酶(GST)的概述
        1.2.3 關(guān)聯(lián)分析
        1.2.4 關(guān)聯(lián)分析中常用的分子標記
        1.2.5 染色體步移
    1.3 研究內(nèi)容與路線
        1.3.1 研究內(nèi)容
        1.3.2 技術(shù)路線
        1.3.3 項目來源和經(jīng)費支持
第2章 馬尾松SSR-PCZ90 標記相關(guān)基因挖掘及其生物信息學(xué)
    2.1 材料和方法
        2.1.1 馬尾松SSR-PCZ90 標記所在基因序列的追溯
        2.1.2 基于第3 代高通量轉(zhuǎn)錄組測序的SSR-PCZ90 相關(guān)序列獲取
        2.1.3 生物信息學(xué)分析
    2.2 結(jié)果與分析
        2.2.1 SSR-PCZ90 相關(guān)序列獲取
        2.2.2 序列比對分析
        2.2.3 SSR-PCZ90 相關(guān)基因的ORF預(yù)測
        2.2.4 蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)預(yù)測
        2.2.5 蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)預(yù)測
        2.2.6 蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)預(yù)測
    2.3 討論
第3章 SNP-M181697和SNP-M249970 標記相關(guān)序列挖掘
    3.1 實驗材料與設(shè)備
        3.1.1 實驗材料
        3.1.2 主要試劑
        3.1.3 實驗儀器
    3.2 實驗方法
        3.2.1 總DNA提取
        3.2.2 中間片段的克隆
        3.2.3 染色體步移
    3.3 結(jié)果與分析
        3.3.1 DNA質(zhì)量檢測
        3.3.2 181697克隆結(jié)果分析
        3.3.3 249970克隆結(jié)果分析
    3.4 討論
第4章 結(jié)果和展望
    4.1 結(jié)果
    4.2 討論
    4.3 展望
參考文獻
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表論文情況
致謝



本文編號：3678812