基于SSR標記的杉木重要性狀關聯(lián)分析研究
發(fā)布時間:2022-07-20 15:04
杉木[Cunninghamia lanceolata(Lamb.)Hook.]是我國南方特有的優(yōu)良速生用材樹種,分布遍及南方17個省區(qū)。本研究以來自11個地理種源的188個杉木無性系為實驗材料,測定了木材的纖維素和木質(zhì)素含量數(shù)據(jù),并分析其變異規(guī)律。開發(fā)了一套杉木木材形成相關基因內(nèi)的SSR標記,結(jié)合自主開發(fā)的EST-SSR標記,分析了杉木優(yōu)株群體的遺傳多樣性和群體結(jié)構。通過關聯(lián)分析尋找與重要表型性狀相關聯(lián)的SSR位點,并挖掘其優(yōu)異等位變異。主要研究結(jié)果如下:(1)結(jié)合范式纖維洗滌分析法和近紅外光譜建立了杉木纖維素和木質(zhì)素含量預測模型,相關系數(shù)分別達到了0.9409和0.9468,表明模型預測效果較好,可以用來預測真實值。通過對纖維素和木質(zhì)素含量變異分析發(fā)現(xiàn),其含量的總體變異系數(shù)均較小,分別為6.00%和5.89%。方差分析表明纖維素含量在不同無性系間存在極顯著差異。(2)克隆得到10個杉木木材形成相關基因的全長序列,共覆蓋杉木基因組長度為32785bp,從中找到13個SSR位點,共開發(fā)出7對多態(tài)性SSR引物,檢測到17個等位變異,平均每對引物產(chǎn)生2.429個等位變異,多態(tài)性引物占總設計引...
【文章頁數(shù)】:65 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
1 文獻綜述
1.1 杉木木材生長和材質(zhì)性狀研究進展
1.1.1 生長性狀
1.1.2 物理力學性質(zhì)及解剖特征
1.1.3 化學組成
1.1.4 各性狀間相關性
1.1.5 杉木多性狀綜合選擇
1.2 近紅外光譜技術在木材材性分析中的應用
1.2.1 化學性質(zhì)
1.2.2 物理力學性質(zhì)
1.2.3 解剖性質(zhì)
1.3 基于SSR標記的林木遺傳多樣性研究進展
1.3.1 SSR分子標記
1.3.2 基于SSR標記的林木遺傳多樣性研究
1.4 林木關聯(lián)分析的研究進展
1.4.1 關聯(lián)分析的概念
1.4.2 關聯(lián)分析的方法和步驟
1.4.3 關聯(lián)分析在林木中的研究進展
1.5 立題依據(jù)和研究意義
2 杉木纖維素和木質(zhì)素含量的近紅外模型建立及變異分析
2.1 材料與方法
2.1.1 實驗材料
2.1.2 纖維素、木質(zhì)素測定
2.1.3 近紅外光譜(NIR)的采集
2.1.4 模型的建立與評價
2.1.5 未知樣品的預測與數(shù)據(jù)分析
2.2 結(jié)果與分析
2.2.1 杉木木材近紅外光譜圖描述
2.2.2 纖維素含量近紅外模型的建立與評價
2.2.2.1 樣品的選擇
2.2.2.2 模型的建立
2.2.3 木質(zhì)素含量近紅外模型的建立與評價
2.2.3.1 樣品的選擇
2.2.3.2 模型的建立
2.2.4 杉木纖維素和木質(zhì)素含量變異分析
2.2.4.1 種源間變異分析
2.2.4.2 無性系間變異分析
2.3 結(jié)論與討論
3 杉木木材形成相關基因內(nèi)SSR標記的開發(fā)
3.1 材料與方法
3.1.1 植物材料
3.1.2 總DNA的提取
3.1.3 SSR位點搜尋及引物開發(fā)
3.1.4 SSR位點擴增及電泳檢測
3.1.5 SSR位點多態(tài)性分析
3.2 結(jié)果與分析
3.2.1 杉木木材形成相關基因內(nèi)SSR位點的發(fā)現(xiàn)
3.2.2 SSR位點PCR擴增引物的設計及多態(tài)性分析
3.3 結(jié)論與討論
4 杉木優(yōu)株群體遺傳多樣性和群體結(jié)構分析
4.1 材料與方法
4.1.1 實驗材料
4.1.2 EST-SSR引物設計
4.1.3 基因組DNA的提取和EST-SSR標記的開發(fā)
4.1.4 群體遺傳多樣性分析
4.1.5 群體結(jié)構分析
4.1.6 多態(tài)性位點的連鎖不平衡分析
4.2 結(jié)果與分析
4.2.1 DNA提取及多態(tài)性引物開發(fā)
4.2.2 杉木優(yōu)株群體遺傳多樣性分析
4.2.3 杉木優(yōu)株群體遺傳結(jié)構分析
4.2.4 連鎖不平衡分析
4.3 結(jié)論與討論
5 杉木重要性狀關聯(lián)分析及優(yōu)異等位變異的發(fā)掘
5.1 材料與方法
5.1.1 實驗材料
5.1.2 重要表型性狀與分子標記的關聯(lián)分析
5.1.3 優(yōu)異位點及優(yōu)異等位變異的確認
5.2 結(jié)果與分析
5.2.1 重要性狀與標記的關聯(lián)分析
5.2.2 生長性狀優(yōu)異等位變異
5.2.3 材質(zhì)性狀優(yōu)異等位變異
5.3 結(jié)論與討論
6 結(jié)論與展望
6.1 主要結(jié)論
6.2 研究展望
參考文獻
個人簡介
論文發(fā)表情況
學術交流活動
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]基于SSR標記的板栗地方品種遺傳多樣性與關聯(lián)分析[J]. 江錫兵,湯丹,龔榜初,賴俊聲. 園藝學報. 2015(12)
[2]杉木應壓木木質(zhì)部細胞形態(tài)特征及主要代謝成分表征[J]. 張勝龍,劉京晶,樓雄珍,劉洋,童再康,黃華宏. 北京林業(yè)大學學報. 2015(05)
[3]21年生杉木優(yōu)良無性系生長與材質(zhì)性狀研究[J]. 朱安明,賴樹華,段愛國,張建國,孫建軍,鄧宗富. 林業(yè)科技通訊. 2015(04)
[4]杉木無性系主要經(jīng)濟性狀遺傳變異和無性系選擇[J]. 何貴平,林陽峰,程亞平,徐肇友,曹高銓,王幫順. 浙江林業(yè)科技. 2015(01)
[5]30年生不同生長勢杉木的胸徑和樹高的生長動態(tài)[J]. 劉麗穎,張紹軒,任佳佳,孟京輝,李磊. 西北林學院學報. 2014(06)
[6]杉木無性系生長和木材品質(zhì)性狀遺傳變異研究[J]. 李榮麗,黃壽先,梁機,周傳明,何長虹,李龍梅,唐國強. 南方農(nóng)業(yè)學報. 2014(09)
[7]杉木EST-SSR與基因組SSR引物開發(fā)[J]. 徐陽,陳金慧,李亞,洪舟,王穎,趙亞琦,王新民,施季森. 南京林業(yè)大學學報(自然科學版). 2014(01)
[8]馬尾松生長和產(chǎn)脂性狀在SSR和ESTP標記不同基因型間的變異研究[J]. 何韻,劉天頤,蔡燕靈,曾令海,黃少偉. 廣東林業(yè)科技. 2013(06)
[9]杉木育種群體SSR分子標記遺傳多樣性分析[J]. 歐陽磊,陳金慧,鄭仁華,徐陽,林宇峰,黃金華,葉代全,方揚輝,施季森. 南京林業(yè)大學學報(自然科學版). 2014(01)
[10]基于近紅外光譜技術的人工林楊木苯醇抽提物質(zhì)量分數(shù)的預測[J]. 劉鎮(zhèn)波,孫鳳亮,李耀翔,劉一星,Xiang-Ming Wang. 東北林業(yè)大學學報. 2013(06)
博士論文
[1]不同海拔藏川楊遺傳多樣性評估及苗期表型關聯(lián)分析[D]. 沈登鋒.北京林業(yè)大學 2014
[2]東北亞地區(qū)粳稻遺傳多樣性及主要株型性狀與SSR標記的關聯(lián)分析[D]. 王敬國.東北林業(yè)大學 2014
[3]杉木人工林生長及材種結(jié)構規(guī)律研究[D]. 相聰偉.中國林業(yè)科學研究院 2013
[4]小葉楊遺傳資源評價及重要性狀的SSRs關聯(lián)分析[D]. 衛(wèi)尊征.北京林業(yè)大學 2010
[5]山楊遺傳多樣性研究與核心種質(zhì)構建及利用[D]. 白卉.東北林業(yè)大學 2010
[6]利用ISSR和EST-SSR標記研究中國茶樹資源的遺傳多樣性和遺傳結(jié)構[D]. 姚明哲.浙江大學 2009
[7]水稻關聯(lián)定位群體的構建及若干品質(zhì)性狀的關聯(lián)分析[D]. 金亮.浙江大學 2009
[8]云杉天然群體遺傳多樣性研究[D]. 羅建勛.中國林業(yè)科學研究院 2004
碩士論文
[1]基于SSR標記構建白蠟種質(zhì)資源分子身份證及其遺傳多樣性分析[D]. 胡春龍.山東農(nóng)業(yè)大學 2015
[2]浙江楠EST-SSR標記開發(fā)及天然種群遺傳多樣性研究[D]. 丁亞軍.浙江農(nóng)林大學 2014
[3]榧樹群體遺傳結(jié)構及與苗期生長性狀關聯(lián)的SRAP標記分析[D]. 董雷鳴.浙江農(nóng)林大學 2013
[4]黃淮冬麥區(qū)175個小麥品種的SSR多態(tài)性及其與株高、產(chǎn)量相關性狀的關聯(lián)分析[D]. 武玉國.山東農(nóng)業(yè)大學 2012
[5]玉米自交系遺傳多樣性及產(chǎn)量性狀與SSR標記的關聯(lián)分析[D]. 徐亮.揚州大學 2012
[6]近紅外光譜分析法預測歐美楊材性的研究[D]. 鄒鑫.北京林業(yè)大學 2010
[7]利用近紅外光譜技術預測粗皮桉木材微纖絲角和氣干密度的研究[D]. 張黎.西北農(nóng)林科技大學 2008
[8]馬尾松實生種子園遺傳多樣性研究[D]. 龔佳.南京林業(yè)大學 2007
[9]核桃SSR反應體系的優(yōu)化及群體遺傳多樣性分析[D]. 劉曉麗.山東農(nóng)業(yè)大學 2007
[10]杉木無性系生長與材性綜合遺傳改良研究[D]. 韋立權.廣西大學 2004
本文編號:3664213
【文章頁數(shù)】:65 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
1 文獻綜述
1.1 杉木木材生長和材質(zhì)性狀研究進展
1.1.1 生長性狀
1.1.2 物理力學性質(zhì)及解剖特征
1.1.3 化學組成
1.1.4 各性狀間相關性
1.1.5 杉木多性狀綜合選擇
1.2 近紅外光譜技術在木材材性分析中的應用
1.2.1 化學性質(zhì)
1.2.2 物理力學性質(zhì)
1.2.3 解剖性質(zhì)
1.3 基于SSR標記的林木遺傳多樣性研究進展
1.3.1 SSR分子標記
1.3.2 基于SSR標記的林木遺傳多樣性研究
1.4 林木關聯(lián)分析的研究進展
1.4.1 關聯(lián)分析的概念
1.4.2 關聯(lián)分析的方法和步驟
1.4.3 關聯(lián)分析在林木中的研究進展
1.5 立題依據(jù)和研究意義
2 杉木纖維素和木質(zhì)素含量的近紅外模型建立及變異分析
2.1 材料與方法
2.1.1 實驗材料
2.1.2 纖維素、木質(zhì)素測定
2.1.3 近紅外光譜(NIR)的采集
2.1.4 模型的建立與評價
2.1.5 未知樣品的預測與數(shù)據(jù)分析
2.2 結(jié)果與分析
2.2.1 杉木木材近紅外光譜圖描述
2.2.2 纖維素含量近紅外模型的建立與評價
2.2.2.1 樣品的選擇
2.2.2.2 模型的建立
2.2.3 木質(zhì)素含量近紅外模型的建立與評價
2.2.3.1 樣品的選擇
2.2.3.2 模型的建立
2.2.4 杉木纖維素和木質(zhì)素含量變異分析
2.2.4.1 種源間變異分析
2.2.4.2 無性系間變異分析
2.3 結(jié)論與討論
3 杉木木材形成相關基因內(nèi)SSR標記的開發(fā)
3.1 材料與方法
3.1.1 植物材料
3.1.2 總DNA的提取
3.1.3 SSR位點搜尋及引物開發(fā)
3.1.4 SSR位點擴增及電泳檢測
3.1.5 SSR位點多態(tài)性分析
3.2 結(jié)果與分析
3.2.1 杉木木材形成相關基因內(nèi)SSR位點的發(fā)現(xiàn)
3.2.2 SSR位點PCR擴增引物的設計及多態(tài)性分析
3.3 結(jié)論與討論
4 杉木優(yōu)株群體遺傳多樣性和群體結(jié)構分析
4.1 材料與方法
4.1.1 實驗材料
4.1.2 EST-SSR引物設計
4.1.3 基因組DNA的提取和EST-SSR標記的開發(fā)
4.1.4 群體遺傳多樣性分析
4.1.5 群體結(jié)構分析
4.1.6 多態(tài)性位點的連鎖不平衡分析
4.2 結(jié)果與分析
4.2.1 DNA提取及多態(tài)性引物開發(fā)
4.2.2 杉木優(yōu)株群體遺傳多樣性分析
4.2.3 杉木優(yōu)株群體遺傳結(jié)構分析
4.2.4 連鎖不平衡分析
4.3 結(jié)論與討論
5 杉木重要性狀關聯(lián)分析及優(yōu)異等位變異的發(fā)掘
5.1 材料與方法
5.1.1 實驗材料
5.1.2 重要表型性狀與分子標記的關聯(lián)分析
5.1.3 優(yōu)異位點及優(yōu)異等位變異的確認
5.2 結(jié)果與分析
5.2.1 重要性狀與標記的關聯(lián)分析
5.2.2 生長性狀優(yōu)異等位變異
5.2.3 材質(zhì)性狀優(yōu)異等位變異
5.3 結(jié)論與討論
6 結(jié)論與展望
6.1 主要結(jié)論
6.2 研究展望
參考文獻
個人簡介
論文發(fā)表情況
學術交流活動
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]基于SSR標記的板栗地方品種遺傳多樣性與關聯(lián)分析[J]. 江錫兵,湯丹,龔榜初,賴俊聲. 園藝學報. 2015(12)
[2]杉木應壓木木質(zhì)部細胞形態(tài)特征及主要代謝成分表征[J]. 張勝龍,劉京晶,樓雄珍,劉洋,童再康,黃華宏. 北京林業(yè)大學學報. 2015(05)
[3]21年生杉木優(yōu)良無性系生長與材質(zhì)性狀研究[J]. 朱安明,賴樹華,段愛國,張建國,孫建軍,鄧宗富. 林業(yè)科技通訊. 2015(04)
[4]杉木無性系主要經(jīng)濟性狀遺傳變異和無性系選擇[J]. 何貴平,林陽峰,程亞平,徐肇友,曹高銓,王幫順. 浙江林業(yè)科技. 2015(01)
[5]30年生不同生長勢杉木的胸徑和樹高的生長動態(tài)[J]. 劉麗穎,張紹軒,任佳佳,孟京輝,李磊. 西北林學院學報. 2014(06)
[6]杉木無性系生長和木材品質(zhì)性狀遺傳變異研究[J]. 李榮麗,黃壽先,梁機,周傳明,何長虹,李龍梅,唐國強. 南方農(nóng)業(yè)學報. 2014(09)
[7]杉木EST-SSR與基因組SSR引物開發(fā)[J]. 徐陽,陳金慧,李亞,洪舟,王穎,趙亞琦,王新民,施季森. 南京林業(yè)大學學報(自然科學版). 2014(01)
[8]馬尾松生長和產(chǎn)脂性狀在SSR和ESTP標記不同基因型間的變異研究[J]. 何韻,劉天頤,蔡燕靈,曾令海,黃少偉. 廣東林業(yè)科技. 2013(06)
[9]杉木育種群體SSR分子標記遺傳多樣性分析[J]. 歐陽磊,陳金慧,鄭仁華,徐陽,林宇峰,黃金華,葉代全,方揚輝,施季森. 南京林業(yè)大學學報(自然科學版). 2014(01)
[10]基于近紅外光譜技術的人工林楊木苯醇抽提物質(zhì)量分數(shù)的預測[J]. 劉鎮(zhèn)波,孫鳳亮,李耀翔,劉一星,Xiang-Ming Wang. 東北林業(yè)大學學報. 2013(06)
博士論文
[1]不同海拔藏川楊遺傳多樣性評估及苗期表型關聯(lián)分析[D]. 沈登鋒.北京林業(yè)大學 2014
[2]東北亞地區(qū)粳稻遺傳多樣性及主要株型性狀與SSR標記的關聯(lián)分析[D]. 王敬國.東北林業(yè)大學 2014
[3]杉木人工林生長及材種結(jié)構規(guī)律研究[D]. 相聰偉.中國林業(yè)科學研究院 2013
[4]小葉楊遺傳資源評價及重要性狀的SSRs關聯(lián)分析[D]. 衛(wèi)尊征.北京林業(yè)大學 2010
[5]山楊遺傳多樣性研究與核心種質(zhì)構建及利用[D]. 白卉.東北林業(yè)大學 2010
[6]利用ISSR和EST-SSR標記研究中國茶樹資源的遺傳多樣性和遺傳結(jié)構[D]. 姚明哲.浙江大學 2009
[7]水稻關聯(lián)定位群體的構建及若干品質(zhì)性狀的關聯(lián)分析[D]. 金亮.浙江大學 2009
[8]云杉天然群體遺傳多樣性研究[D]. 羅建勛.中國林業(yè)科學研究院 2004
碩士論文
[1]基于SSR標記構建白蠟種質(zhì)資源分子身份證及其遺傳多樣性分析[D]. 胡春龍.山東農(nóng)業(yè)大學 2015
[2]浙江楠EST-SSR標記開發(fā)及天然種群遺傳多樣性研究[D]. 丁亞軍.浙江農(nóng)林大學 2014
[3]榧樹群體遺傳結(jié)構及與苗期生長性狀關聯(lián)的SRAP標記分析[D]. 董雷鳴.浙江農(nóng)林大學 2013
[4]黃淮冬麥區(qū)175個小麥品種的SSR多態(tài)性及其與株高、產(chǎn)量相關性狀的關聯(lián)分析[D]. 武玉國.山東農(nóng)業(yè)大學 2012
[5]玉米自交系遺傳多樣性及產(chǎn)量性狀與SSR標記的關聯(lián)分析[D]. 徐亮.揚州大學 2012
[6]近紅外光譜分析法預測歐美楊材性的研究[D]. 鄒鑫.北京林業(yè)大學 2010
[7]利用近紅外光譜技術預測粗皮桉木材微纖絲角和氣干密度的研究[D]. 張黎.西北農(nóng)林科技大學 2008
[8]馬尾松實生種子園遺傳多樣性研究[D]. 龔佳.南京林業(yè)大學 2007
[9]核桃SSR反應體系的優(yōu)化及群體遺傳多樣性分析[D]. 劉曉麗.山東農(nóng)業(yè)大學 2007
[10]杉木無性系生長與材性綜合遺傳改良研究[D]. 韋立權.廣西大學 2004
本文編號:3664213
本文鏈接:http://sikaile.net/nykjlw/lylw/3664213.html
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