泡桐屬植物的系統(tǒng)發(fā)育研究
發(fā)布時(shí)間:2022-02-26 05:40
泡桐(Paulownia Sieb.et Zucc)為玄參科唯一落葉喬木,其自然分布區(qū)和栽培區(qū)覆蓋我國(guó)各個(gè)地區(qū),是一種重要的優(yōu)質(zhì)速生樹材經(jīng)濟(jì)林木。由于泡桐多為異花授粉,均可通過(guò)種間雜交并產(chǎn)生可育后代,而且可以通過(guò)無(wú)性繁殖,形成和保留過(guò)渡類型,經(jīng)過(guò)漫長(zhǎng)的種間雜交和反復(fù)回交與自然選擇,各個(gè)種的基因與基因組合,滲入雜交,使得泡桐屬在植物學(xué)分類上屬于困難屬。傳統(tǒng)意義上的形態(tài)學(xué)利用表型的重點(diǎn)差異結(jié)構(gòu)將泡桐屬歸入玄參科或紫葳科,而隨后發(fā)展的花粉形態(tài)學(xué)在對(duì)花粉形態(tài)的比對(duì)中發(fā)現(xiàn)顯著差異而將泡桐屬歸入玄參科中,但人們對(duì)泡桐屬及其近緣屬之間的進(jìn)化關(guān)系及其種間進(jìn)化關(guān)系尚未進(jìn)行相關(guān)報(bào)道。本實(shí)驗(yàn)通過(guò)對(duì)葉綠體基因組psb E-pet L、trn D-trn T兩條序列及其聯(lián)合序列數(shù)據(jù)集處理,旨在通過(guò)對(duì)泡桐屬植物種內(nèi)及與其相近科屬的系統(tǒng)發(fā)育學(xué)分析,闡明屬內(nèi)進(jìn)化關(guān)系及系統(tǒng)學(xué)地位,為泡桐屬歸科問(wèn)題提供依據(jù),同時(shí)也為更有效的收集種質(zhì)資源和選育良種提供參考依據(jù)。主要實(shí)驗(yàn)結(jié)果如下:(1)提取植物基因組DNA并檢測(cè)DNA的濃度與質(zhì)量。通過(guò)對(duì)改良CTAB法和尿素法的比對(duì)和綜合考慮,最終選擇能提取出質(zhì)量較好,適合基因組擴(kuò)增需求的改...
【文章來(lái)源】:河南農(nóng)業(yè)大學(xué)河南省
【文章頁(yè)數(shù)】:47 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
致謝
摘要
1 文獻(xiàn)綜述
1.1 分子系統(tǒng)學(xué)
1.1.1 分子系統(tǒng)學(xué)的形成
1.1.2 分子系統(tǒng)學(xué)的研究進(jìn)展
1.1.2.1 分子系統(tǒng)發(fā)生學(xué)
1.1.2.2 系統(tǒng)基因組學(xué)
1.1.2.3 群體遺傳學(xué)
1.1.2.4 系統(tǒng)地理學(xué)
1.1.2.5 DNA條形碼
1.1.2.6 DNA分類學(xué)
1.2 分子系統(tǒng)學(xué)的研究方法
1.2.1 分類群的正確選擇
1.2.2 目的基因的選擇
1.2.3 基因序列數(shù)據(jù)的對(duì)比
1.2.4 基因樹的構(gòu)建方法
1.3 葉綠體基因組
1.3.1 葉綠體基因組的結(jié)構(gòu)與功能
1.3.2 葉綠體基因組在植物系統(tǒng)發(fā)育研究中的應(yīng)用及優(yōu)勢(shì)
1.4 泡桐屬簡(jiǎn)介
1.4.1 泡桐屬資源及特征
1.4.2 泡桐屬種類
2 引言
3 材料與方法
3.1 材料與試劑
3.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
3.1.2 實(shí)驗(yàn)所用試劑
3.1.2.1 提取植物基因組DNA所用試劑
3.1.2.2 反應(yīng)體系所用試劑及所需儀器
3.2 試驗(yàn)方法
3.2.1 植物基因組DNA的提取
3.2.2 模板DNA質(zhì)量檢測(cè)及濃度檢測(cè)
3.2.2.1 DNA的質(zhì)量檢測(cè)
3.2.2.2 DNA的濃度檢測(cè)
3.2.3 cpDNA分子發(fā)育系統(tǒng)PCR體系的建立及優(yōu)化
3.2.4 PCR體系和擴(kuò)增引物的篩選
3.2.4.1 PCR體系和反應(yīng)程序
3.2.4.2 PCR反應(yīng)體系優(yōu)化及引物篩選
3.3 數(shù)據(jù)處理與分析
3.3.1 序列編輯與比對(duì)
3.3.2 數(shù)據(jù)特征分析
4 結(jié)果與分析
4.1 植物總DNA的檢測(cè)結(jié)果
4.2 PCR反應(yīng)體系的優(yōu)化
4.2.1 PCR反應(yīng)體系單因子試驗(yàn)
4.2.1.1 不同DNA模板濃度對(duì)PCR體系的影響
4.2.1.2 不同引物濃度對(duì)PCR體系的影響
4.2.1.3 不同退火溫度對(duì)PCR體系的影響
4.2.2 PR引物的篩選
4.3 PCR擴(kuò)增和序列的測(cè)定
4.4 測(cè)序結(jié)果和分析
4.4.1 序列分析
4.4.2 序列特點(diǎn)
4.4.2.1 petL-psbE序列
4.4.2.2 trnD-trnT序列
4.4.2.3 petL-psbE和trnD-trnT結(jié)合序列
4.4.3 系統(tǒng)發(fā)育結(jié)果分析
4.4.3.1 基于petL-psbE序列數(shù)據(jù)集構(gòu)建的最大簡(jiǎn)約樹(MP)
4.4.3.2 基于trnD-trnT序列數(shù)據(jù)集構(gòu)建的最大簡(jiǎn)約樹(MP)
4.4.3.3 基于petL-psbE和trnD-trnT聯(lián)合數(shù)據(jù)集構(gòu)建的最大簡(jiǎn)約樹(MP)
5 結(jié)論與討論
5.1 改良CTAB法及尿素法提取基因組總DNA
5.2 優(yōu)化建立PCR最佳反應(yīng)體系
5.3 泡桐屬植物及其近緣科植物的遺傳距離
5.4 cpDNA序列信息揭示泡桐屬植物系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系
參考文獻(xiàn)
英文摘要
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]系統(tǒng)發(fā)育基因組學(xué)研究進(jìn)展[J]. 王章群,解增言,蔡應(yīng)繁,舒坤賢,黃飛飛. 遺傳. 2014(07)
[2]泡桐ITS序列測(cè)定及特征分析[J]. 申響保,喬杰,李芳東,袁德義. 中南林業(yè)科技大學(xué)學(xué)報(bào). 2013(10)
[3]生物DNA條形碼:十年發(fā)展歷程、研究尺度和功能[J]. 裴男才,陳步峰. 生物多樣性. 2013(05)
[4]泡桐屬植物ISSR-PCR反應(yīng)體系的優(yōu)化[J]. 盧妍妍,李海英,茹廣欣,林彩麗,陳志濤,楊陽(yáng). 河南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2013(03)
[5]生物資源的DNA條形碼技術(shù)[J]. 陳士林,龐曉慧,羅焜,姚輝,韓建萍,宋經(jīng)元. 生命科學(xué). 2013(05)
[6]分子系統(tǒng)學(xué)研究進(jìn)展[J]. 陳軍,李琪,孔令鋒. 生命科學(xué). 2013(05)
[7]泡桐屬植物親緣關(guān)系的ISSR分析[J]. 莫文娟,傅建敏,喬杰,雷莉莉,李芳東,袁德義,邱乾棟. 林業(yè)科學(xué). 2013(01)
[8]被子植物葉綠體基因組的結(jié)構(gòu)變異研究進(jìn)展[J]. 王玲,董文攀,周世良. 西北植物學(xué)報(bào). 2012(06)
[9]利用DNA條形碼技術(shù)識(shí)別植物物種[J]. 裴男才. 應(yīng)用生態(tài)學(xué)報(bào). 2012(05)
[10]正交設(shè)計(jì)優(yōu)化柿屬植物SSR-PCR反應(yīng)體系[J]. 梁玉琴,李芳東,傅建敏,烏云塔娜,吳碩. 經(jīng)濟(jì)林研究. 2011(04)
博士論文
[1]中國(guó)廣義蓼屬植物及其近緣類群的分子系統(tǒng)學(xué)研究[D]. 閔運(yùn)江.安徽大學(xué) 2013
[2]鵝掌楸屬群體遺傳結(jié)構(gòu)及分子系統(tǒng)地理學(xué)研究[D]. 李康琴.南京林業(yè)大學(xué) 2013
[3]東亞特有瀕危植物黃山梅的親緣地理學(xué)與群體遺傳學(xué)研究[D]. 孫逸.浙江大學(xué) 2012
[4]馬褂木遺傳多樣性及系統(tǒng)地理學(xué)研究[D]. 惠利省.南京林業(yè)大學(xué) 2010
[5]杏屬植物(Armeniaca Mill.)種質(zhì)資源分子系統(tǒng)學(xué)研究[D]. 苑兆和.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
[6]羅漢松科、山茶科和紅豆杉科植物內(nèi)生擬盤多毛孢的多樣性及擬盤多毛孢屬分子系統(tǒng)學(xué)研究[D]. 韋繼光.浙江大學(xué) 2004
碩士論文
[1]瀕危植物太行菊屬譜系地理學(xué)研究[D]. 韓夏.山西師范大學(xué) 2013
[2]中國(guó)野生秋子梨群體遺傳學(xué)及形態(tài)變異研究[D]. 許靖詩(shī).中南林業(yè)科技大學(xué) 2013
[3]基于Agt1序列及nSSR的黃精葉鉤吻屬親緣地理學(xué)研究[D]. 方明.南昌大學(xué) 2012
[4]美麗桐屬的分子系統(tǒng)學(xué)研究[D]. 劉國(guó)麗.華東師范大學(xué) 2011
本文編號(hào):3644104
【文章來(lái)源】:河南農(nóng)業(yè)大學(xué)河南省
【文章頁(yè)數(shù)】:47 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
致謝
摘要
1 文獻(xiàn)綜述
1.1 分子系統(tǒng)學(xué)
1.1.1 分子系統(tǒng)學(xué)的形成
1.1.2 分子系統(tǒng)學(xué)的研究進(jìn)展
1.1.2.1 分子系統(tǒng)發(fā)生學(xué)
1.1.2.2 系統(tǒng)基因組學(xué)
1.1.2.3 群體遺傳學(xué)
1.1.2.4 系統(tǒng)地理學(xué)
1.1.2.5 DNA條形碼
1.1.2.6 DNA分類學(xué)
1.2 分子系統(tǒng)學(xué)的研究方法
1.2.1 分類群的正確選擇
1.2.2 目的基因的選擇
1.2.3 基因序列數(shù)據(jù)的對(duì)比
1.2.4 基因樹的構(gòu)建方法
1.3 葉綠體基因組
1.3.1 葉綠體基因組的結(jié)構(gòu)與功能
1.3.2 葉綠體基因組在植物系統(tǒng)發(fā)育研究中的應(yīng)用及優(yōu)勢(shì)
1.4 泡桐屬簡(jiǎn)介
1.4.1 泡桐屬資源及特征
1.4.2 泡桐屬種類
2 引言
3 材料與方法
3.1 材料與試劑
3.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
3.1.2 實(shí)驗(yàn)所用試劑
3.1.2.1 提取植物基因組DNA所用試劑
3.1.2.2 反應(yīng)體系所用試劑及所需儀器
3.2 試驗(yàn)方法
3.2.1 植物基因組DNA的提取
3.2.2 模板DNA質(zhì)量檢測(cè)及濃度檢測(cè)
3.2.2.1 DNA的質(zhì)量檢測(cè)
3.2.2.2 DNA的濃度檢測(cè)
3.2.3 cpDNA分子發(fā)育系統(tǒng)PCR體系的建立及優(yōu)化
3.2.4 PCR體系和擴(kuò)增引物的篩選
3.2.4.1 PCR體系和反應(yīng)程序
3.2.4.2 PCR反應(yīng)體系優(yōu)化及引物篩選
3.3 數(shù)據(jù)處理與分析
3.3.1 序列編輯與比對(duì)
3.3.2 數(shù)據(jù)特征分析
4 結(jié)果與分析
4.1 植物總DNA的檢測(cè)結(jié)果
4.2 PCR反應(yīng)體系的優(yōu)化
4.2.1 PCR反應(yīng)體系單因子試驗(yàn)
4.2.1.1 不同DNA模板濃度對(duì)PCR體系的影響
4.2.1.2 不同引物濃度對(duì)PCR體系的影響
4.2.1.3 不同退火溫度對(duì)PCR體系的影響
4.2.2 PR引物的篩選
4.3 PCR擴(kuò)增和序列的測(cè)定
4.4 測(cè)序結(jié)果和分析
4.4.1 序列分析
4.4.2 序列特點(diǎn)
4.4.2.1 petL-psbE序列
4.4.2.2 trnD-trnT序列
4.4.2.3 petL-psbE和trnD-trnT結(jié)合序列
4.4.3 系統(tǒng)發(fā)育結(jié)果分析
4.4.3.1 基于petL-psbE序列數(shù)據(jù)集構(gòu)建的最大簡(jiǎn)約樹(MP)
4.4.3.2 基于trnD-trnT序列數(shù)據(jù)集構(gòu)建的最大簡(jiǎn)約樹(MP)
4.4.3.3 基于petL-psbE和trnD-trnT聯(lián)合數(shù)據(jù)集構(gòu)建的最大簡(jiǎn)約樹(MP)
5 結(jié)論與討論
5.1 改良CTAB法及尿素法提取基因組總DNA
5.2 優(yōu)化建立PCR最佳反應(yīng)體系
5.3 泡桐屬植物及其近緣科植物的遺傳距離
5.4 cpDNA序列信息揭示泡桐屬植物系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系
參考文獻(xiàn)
英文摘要
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]系統(tǒng)發(fā)育基因組學(xué)研究進(jìn)展[J]. 王章群,解增言,蔡應(yīng)繁,舒坤賢,黃飛飛. 遺傳. 2014(07)
[2]泡桐ITS序列測(cè)定及特征分析[J]. 申響保,喬杰,李芳東,袁德義. 中南林業(yè)科技大學(xué)學(xué)報(bào). 2013(10)
[3]生物DNA條形碼:十年發(fā)展歷程、研究尺度和功能[J]. 裴男才,陳步峰. 生物多樣性. 2013(05)
[4]泡桐屬植物ISSR-PCR反應(yīng)體系的優(yōu)化[J]. 盧妍妍,李海英,茹廣欣,林彩麗,陳志濤,楊陽(yáng). 河南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2013(03)
[5]生物資源的DNA條形碼技術(shù)[J]. 陳士林,龐曉慧,羅焜,姚輝,韓建萍,宋經(jīng)元. 生命科學(xué). 2013(05)
[6]分子系統(tǒng)學(xué)研究進(jìn)展[J]. 陳軍,李琪,孔令鋒. 生命科學(xué). 2013(05)
[7]泡桐屬植物親緣關(guān)系的ISSR分析[J]. 莫文娟,傅建敏,喬杰,雷莉莉,李芳東,袁德義,邱乾棟. 林業(yè)科學(xué). 2013(01)
[8]被子植物葉綠體基因組的結(jié)構(gòu)變異研究進(jìn)展[J]. 王玲,董文攀,周世良. 西北植物學(xué)報(bào). 2012(06)
[9]利用DNA條形碼技術(shù)識(shí)別植物物種[J]. 裴男才. 應(yīng)用生態(tài)學(xué)報(bào). 2012(05)
[10]正交設(shè)計(jì)優(yōu)化柿屬植物SSR-PCR反應(yīng)體系[J]. 梁玉琴,李芳東,傅建敏,烏云塔娜,吳碩. 經(jīng)濟(jì)林研究. 2011(04)
博士論文
[1]中國(guó)廣義蓼屬植物及其近緣類群的分子系統(tǒng)學(xué)研究[D]. 閔運(yùn)江.安徽大學(xué) 2013
[2]鵝掌楸屬群體遺傳結(jié)構(gòu)及分子系統(tǒng)地理學(xué)研究[D]. 李康琴.南京林業(yè)大學(xué) 2013
[3]東亞特有瀕危植物黃山梅的親緣地理學(xué)與群體遺傳學(xué)研究[D]. 孫逸.浙江大學(xué) 2012
[4]馬褂木遺傳多樣性及系統(tǒng)地理學(xué)研究[D]. 惠利省.南京林業(yè)大學(xué) 2010
[5]杏屬植物(Armeniaca Mill.)種質(zhì)資源分子系統(tǒng)學(xué)研究[D]. 苑兆和.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
[6]羅漢松科、山茶科和紅豆杉科植物內(nèi)生擬盤多毛孢的多樣性及擬盤多毛孢屬分子系統(tǒng)學(xué)研究[D]. 韋繼光.浙江大學(xué) 2004
碩士論文
[1]瀕危植物太行菊屬譜系地理學(xué)研究[D]. 韓夏.山西師范大學(xué) 2013
[2]中國(guó)野生秋子梨群體遺傳學(xué)及形態(tài)變異研究[D]. 許靖詩(shī).中南林業(yè)科技大學(xué) 2013
[3]基于Agt1序列及nSSR的黃精葉鉤吻屬親緣地理學(xué)研究[D]. 方明.南昌大學(xué) 2012
[4]美麗桐屬的分子系統(tǒng)學(xué)研究[D]. 劉國(guó)麗.華東師范大學(xué) 2011
本文編號(hào):3644104
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