箭竹屬隸屬于禾本科竹亞科北美箭竹族,課題組前期基于3個(gè)葉綠體基因片段、核基因rpb2和nrITS的分子系統(tǒng)學(xué)研究結(jié)果表明,該屬分為具佛焰苞支和無(wú)佛焰苞支。具佛焰苞支由15個(gè)竹種組成,我們稱(chēng)之為箭竹物種復(fù)合體,其突出的形態(tài)學(xué)特點(diǎn)是:花序縮短,花序下包被有一組佛焰苞狀的葉鞘,小穗從花序一側(cè)伸出,花具3枚柱頭,竹竿無(wú)縱肋且表面無(wú)刺毛。主要分布于四川北部、陜西南部、甘肅、寧夏、貴州、湖北和河南等地。復(fù)合體內(nèi)各竹種間的區(qū)別主要依賴于營(yíng)養(yǎng)器官的形態(tài)學(xué)特征,但在很多形態(tài)學(xué)特征上在種間存在著不同程度的過(guò)渡,物種劃分非常困難;分子系統(tǒng)學(xué)研究結(jié)果表明,復(fù)合體內(nèi)物種間的界限不清。因此,本研究利用微衛(wèi)星分子標(biāo)記研究箭竹物種復(fù)合體的遺傳多樣性,進(jìn)而討論該物種復(fù)合體內(nèi)基于營(yíng)養(yǎng)器官進(jìn)行的竹種分類(lèi)的合理性及可能原因,并根據(jù)具體情況進(jìn)行分類(lèi)學(xué)處理。本論文基于箭竹物種復(fù)合體內(nèi)的4個(gè)竹種的全基因組高通量測(cè)序結(jié)果,開(kāi)發(fā)了 14對(duì)微衛(wèi)星分子標(biāo)記,這些分子標(biāo)記的研究結(jié)果顯示,在箭竹物種復(fù)合體的總居群水平上其多態(tài)性百分率（PPL）均值為83.515%,在15個(gè)竹種的750個(gè)個(gè)體共檢測(cè)到103個(gè)等位基因,14個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)的平均多態(tài)性... 

【文章來(lái)源】：陜西師范大學(xué)陜西省211工程院校教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】：96 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
第1章 前言
    1.1 箭竹屬的研究背景
        1.1.1 箭竹屬的分類(lèi)
        1.1.2 箭竹物種復(fù)合體
    1.2 遺傳多樣性與遺傳結(jié)構(gòu)
        1.2.1 遺傳多樣性
        1.2.2 遺傳結(jié)構(gòu)
        1.2.3 植物遺傳多樣性的研究方法
    1.3 遺傳多樣性和遺傳分化的基本參數(shù)
    1.4 SSR分子標(biāo)記
        1.4.1 SSR分子標(biāo)記的相關(guān)概念及原理
        1.4.2 SSR分子標(biāo)記開(kāi)發(fā)方法
        1.4.3 SSR標(biāo)記的特點(diǎn)及應(yīng)用
        1.4.4 SSR分子標(biāo)記在竹類(lèi)植物中的應(yīng)用
    1.5 研究目的與意義
第2章 材料與方法
    2.1 微衛(wèi)星序列篩選
        2.1.2 序列組裝
        2.1.3 微衛(wèi)星位點(diǎn)的查找與引物設(shè)計(jì)
    2.2 材料與方法
        2.2.1 DNA樣品采集
        2.2.2 試劑與儀器
    2.3 總DNA提取與PCR擴(kuò)增
        2.3.1 總DNA的提取
        2.3.2 DNA的質(zhì)量檢測(cè)
        2.3.3 PCR引物的合成
        2.3.4 PCR擴(kuò)增
    2.4 數(shù)據(jù)分析
        2.4.1 數(shù)據(jù)整理
        2.4.2 哈迪-溫伯格平衡檢測(cè)
        2.4.3 連鎖不平衡分析
        2.4.4 遺傳多樣性參數(shù)計(jì)算
        2.4.5 居群遺傳分化分析
        2.4.6 居群遺傳結(jié)構(gòu)分析
        2.4.7 空間遺傳結(jié)構(gòu)分析
第3章 結(jié)果
    3.1 箭竹復(fù)合體居群水平的哈迪溫-伯格平衡
    3.2 微衛(wèi)星序列的連鎖不平衡檢測(cè)
    3.3 箭竹物種復(fù)合體遺傳多樣性的結(jié)果
    3.4 遺傳距離和遺傳一致性
    3.5 微衛(wèi)星水平的遺傳多樣性
    3.6 箭竹物種復(fù)合體遺傳結(jié)構(gòu)分析
        3.6.1 系統(tǒng)聚類(lèi)分析
        3.6.2 主坐標(biāo)分析
        3.6.3 貝葉斯遺傳結(jié)構(gòu)聚類(lèi)分析
    3.7 分子方差分析
    3.8 箭竹物種復(fù)合體形態(tài)學(xué)性狀演化分析
    3.9 箭竹物種復(fù)合體群體動(dòng)態(tài)歷史
        3.9.1 地理隔離效應(yīng)(IBD)檢測(cè)
        3.9.2 瓶頸效應(yīng)的檢測(cè)
第4章 討論
    4.1 微衛(wèi)星位點(diǎn)遺傳多樣性
    4.2 箭竹物種復(fù)合體遺傳多樣性
    4.3 箭竹物種復(fù)合體的遺傳結(jié)構(gòu)分析
    4.4 箭竹物種復(fù)合體物種重新劃分
參考文獻(xiàn)
致謝


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
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[3]毛竹微衛(wèi)星標(biāo)記的開(kāi)發(fā)及其在竹類(lèi)植物基因組分析中的應(yīng)用[D]. 盧江杰.浙江林學(xué)院 2009
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