野生油茶潛在分布及緯度梯度遺傳分化格局
發(fā)布時間:2022-01-10 16:38
油茶(Camellia oleifera)是我國第一大木本油料作物。大力發(fā)展油茶產(chǎn)業(yè)有助于提高我國植物油的自給率,保障國家的糧油安全。野生油茶(C.oleifera)是油茶育種寶貴的遺傳資源。了解野生油茶的地理分布,分析不同地理種群的遺傳分化格局,是野生油茶遺傳資源保護與利用的基礎(chǔ)。本研究從中國數(shù)字植物標本館篩選獲得可靠的野生油茶分布點數(shù)據(jù),結(jié)合氣象和土壤數(shù)據(jù),分別應(yīng)用最大熵(Max Ent)和規(guī)則集遺傳算法(GARP)模型構(gòu)建了野生油茶的生態(tài)位模型,預(yù)測了野生油茶的潛在分布區(qū),分析了影響野生油茶分布的關(guān)鍵環(huán)境因子。對反映緯度梯度分布的7個野生油茶種群進行了實地考察,采集了374份葉片樣本。基于廬山和井岡山8個野生油茶樣本的高通量轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù),篩選了65個多態(tài)性微衛(wèi)星(SSR)分子標記。選用35個多態(tài)性的SSR分子標記,應(yīng)用高通量測序技術(shù),對不同緯度的野生油茶樣本進行了微衛(wèi)星基因分型。比較了SSR位點等位基因頻率未知和已知情況下,六倍體野生油茶遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)分析結(jié)果的差異。分析了緯度梯度上野生油茶的遺傳結(jié)構(gòu)與遺傳多樣性。本研究的主要結(jié)果及結(jié)論如下:1、Max Ent和GARP兩...
【文章來源】:南昌大學江西省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:82 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
第1章 前言
1.1 作物野生近緣種研究概述
1.2 油茶及野生油茶
1.3 作物野生近緣種的分布研究
1.3.1 生態(tài)位模型及其應(yīng)用
1.3.2 基于生態(tài)位模型的作物及其野生近緣種分布研究
1.4 作物野生近緣種的種群遺傳分化
1.4.1 影響種群遺傳分化的因素
1.4.2 緯度梯度上種群遺傳分化
1.5 高通量微衛(wèi)星分子標記開發(fā)和基因分型
1.5.1 高通量微衛(wèi)星分子標記開發(fā)
1.5.2 高通量微衛(wèi)星基因分型
1.6 本研究的目的與意義
第2章 基于生態(tài)位模型預(yù)測野生油茶的潛在分布
2.1 材料與方法
2.1.1 獲得野生油茶分布點數(shù)據(jù)
2.1.2 收集環(huán)境圖層數(shù)據(jù)
2.1.3 Max Ent模型分析
2.1.4 GARP模型分析
2.1.5 適生等級劃分可靠性分析
2.1.6 野生油茶分布點的實地考察
2.2 結(jié)果
2.2.1 生態(tài)位模型的準確性
2.2.2 影響油茶分布的主要環(huán)境變量
2.2.3 Max Ent模型預(yù)測的野生油茶分布區(qū)
2.2.4 GARP模型預(yù)測的野生油茶分布區(qū)
2.2.5 適生等級劃分可靠性分析
2.2.6 野生油茶分布點的實地考察
2.3 討論
第3章 高多態(tài)性SSR分子標記開發(fā)
3.1 材料與方法
3.1.1 油茶樣品的采集
3.1.2 主要試劑與儀器
3.1.3 實驗方法
3.1.3.1 基因組DNA提取
3.1.3.2 微衛(wèi)星(SSR)引物的設(shè)計
3.1.3.3 微衛(wèi)星引物的驗證
3.2 結(jié)果
3.2.1 微衛(wèi)星標記的鑒定
3.2.2 微衛(wèi)星標記驗證
3.3 討論
第4章 基于微衛(wèi)星的野生油茶緯度梯度遺傳分化格局
4.1 實驗材料
4.2 主要試劑與儀器
4.3 實驗方法
4.3.1 基因組DNA的提取
4.3.2 單位點引物優(yōu)化
4.3.3 多重體系優(yōu)化
4.3.4 多重PCR擴增
4.3.5 各樣本添加特異性標簽序列
4.4 高通量測序與分析
4.5 SSR基因分型
4.6 油茶遺傳多樣性及遺傳結(jié)構(gòu)分析
4.6.1 遺傳多樣性分析
4.6.2 遺傳結(jié)構(gòu)分析
4.6.3 遺傳分化水平分析
4.7 結(jié)果與分析
4.7.1 不同緯度油茶的遺傳多樣性
4.7.2 不同緯度油茶的遺傳結(jié)構(gòu)
4.7.3 不同緯度油茶的遺傳分化水平
4.8 討論
第5章 主要結(jié)論與展望
5.1 本研究的主要結(jié)論
5.2 展望
附錄
致謝
參考文獻
攻讀碩士學位期間科研成果及獲獎情況
【參考文獻】:
期刊論文
[1]基于MaxEnt模型的可可潛在適宜分布研究[J]. 秦曉威,郝朝運,李付鵬,譚樂和,宋應(yīng)輝,賴劍雄. 熱帶作物學報. 2016(05)
[2]藥用植物細辛在中國的潛在適生區(qū)分布[J]. 景鵬飛,武坤毅,龔曄,韓立敏,崔浪軍. 植物分類與資源學報. 2015(03)
[3]應(yīng)用GIS和最大熵模型分析秦嶺冷杉潛在地理分布[J]. 高蓓,衛(wèi)海燕,郭彥龍,顧蔚. 生態(tài)學雜志. 2015(03)
[4]基于MaxEnt分析金錢松適生的生物氣候特征[J]. 王雷宏,楊俊仙,徐小牛. 林業(yè)科學. 2015(01)
[5]基于生態(tài)位模型的石蒜適生區(qū)預(yù)測[J]. 毛志遠,張兆金,周堅. 林業(yè)科技開發(fā). 2014(06)
[6]基于Maxent和ArcGIS預(yù)測川貝母潛在分布及適宜性評價[J]. 王娟娟,曹博,白成科,張琳琳,車樂. 植物研究. 2014(05)
[7]基于MaxEnt生態(tài)學模型的檀香在中國的潛在種植區(qū)預(yù)測[J]. 胡秀,吳福川,郭微,劉念. 林業(yè)科學. 2014(05)
[8]基于MaxEnt和ArcGIS對太白米的潛在分布預(yù)測及適宜性評價[J]. 車樂,曹博,白成科,王娟娟,張琳琳. 生態(tài)學雜志. 2014(06)
[9]提高生態(tài)位模型轉(zhuǎn)移能力來模擬入侵物種的潛在分布[J]. 朱耿平,劉強,高玉葆. 生物多樣性. 2014(02)
[10]雜交-漸滲的遺傳進化效應(yīng)與栽培作物野生近緣種多樣性保護[J]. 盧寶榮. 科學通報. 2014(06)
碩士論文
[1]基于微衛(wèi)星分子標記研究井岡山和廬山六倍體野生油茶的遺傳結(jié)構(gòu)[D]. 黃小毛.南昌大學 2016
[2]廬山和井岡山不同海拔野生油茶葉片比較轉(zhuǎn)錄組研究[D]. 陳家銘.南昌大學 2015
[3]基于GARP和MAXENT的空心蓮子草在中國的入侵風險預(yù)測[D]. 劉欣.山東師范大學 2012
[4]中亞熱帶常綠闊葉林植物區(qū)系地理研究[D]. 陳衛(wèi)娟.華東師范大學 2006
本文編號:3581034
【文章來源】:南昌大學江西省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:82 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
第1章 前言
1.1 作物野生近緣種研究概述
1.2 油茶及野生油茶
1.3 作物野生近緣種的分布研究
1.3.1 生態(tài)位模型及其應(yīng)用
1.3.2 基于生態(tài)位模型的作物及其野生近緣種分布研究
1.4 作物野生近緣種的種群遺傳分化
1.4.1 影響種群遺傳分化的因素
1.4.2 緯度梯度上種群遺傳分化
1.5 高通量微衛(wèi)星分子標記開發(fā)和基因分型
1.5.1 高通量微衛(wèi)星分子標記開發(fā)
1.5.2 高通量微衛(wèi)星基因分型
1.6 本研究的目的與意義
第2章 基于生態(tài)位模型預(yù)測野生油茶的潛在分布
2.1 材料與方法
2.1.1 獲得野生油茶分布點數(shù)據(jù)
2.1.2 收集環(huán)境圖層數(shù)據(jù)
2.1.3 Max Ent模型分析
2.1.4 GARP模型分析
2.1.5 適生等級劃分可靠性分析
2.1.6 野生油茶分布點的實地考察
2.2 結(jié)果
2.2.1 生態(tài)位模型的準確性
2.2.2 影響油茶分布的主要環(huán)境變量
2.2.3 Max Ent模型預(yù)測的野生油茶分布區(qū)
2.2.4 GARP模型預(yù)測的野生油茶分布區(qū)
2.2.5 適生等級劃分可靠性分析
2.2.6 野生油茶分布點的實地考察
2.3 討論
第3章 高多態(tài)性SSR分子標記開發(fā)
3.1 材料與方法
3.1.1 油茶樣品的采集
3.1.2 主要試劑與儀器
3.1.3 實驗方法
3.1.3.1 基因組DNA提取
3.1.3.2 微衛(wèi)星(SSR)引物的設(shè)計
3.1.3.3 微衛(wèi)星引物的驗證
3.2 結(jié)果
3.2.1 微衛(wèi)星標記的鑒定
3.2.2 微衛(wèi)星標記驗證
3.3 討論
第4章 基于微衛(wèi)星的野生油茶緯度梯度遺傳分化格局
4.1 實驗材料
4.2 主要試劑與儀器
4.3 實驗方法
4.3.1 基因組DNA的提取
4.3.2 單位點引物優(yōu)化
4.3.3 多重體系優(yōu)化
4.3.4 多重PCR擴增
4.3.5 各樣本添加特異性標簽序列
4.4 高通量測序與分析
4.5 SSR基因分型
4.6 油茶遺傳多樣性及遺傳結(jié)構(gòu)分析
4.6.1 遺傳多樣性分析
4.6.2 遺傳結(jié)構(gòu)分析
4.6.3 遺傳分化水平分析
4.7 結(jié)果與分析
4.7.1 不同緯度油茶的遺傳多樣性
4.7.2 不同緯度油茶的遺傳結(jié)構(gòu)
4.7.3 不同緯度油茶的遺傳分化水平
4.8 討論
第5章 主要結(jié)論與展望
5.1 本研究的主要結(jié)論
5.2 展望
附錄
致謝
參考文獻
攻讀碩士學位期間科研成果及獲獎情況
【參考文獻】:
期刊論文
[1]基于MaxEnt模型的可可潛在適宜分布研究[J]. 秦曉威,郝朝運,李付鵬,譚樂和,宋應(yīng)輝,賴劍雄. 熱帶作物學報. 2016(05)
[2]藥用植物細辛在中國的潛在適生區(qū)分布[J]. 景鵬飛,武坤毅,龔曄,韓立敏,崔浪軍. 植物分類與資源學報. 2015(03)
[3]應(yīng)用GIS和最大熵模型分析秦嶺冷杉潛在地理分布[J]. 高蓓,衛(wèi)海燕,郭彥龍,顧蔚. 生態(tài)學雜志. 2015(03)
[4]基于MaxEnt分析金錢松適生的生物氣候特征[J]. 王雷宏,楊俊仙,徐小牛. 林業(yè)科學. 2015(01)
[5]基于生態(tài)位模型的石蒜適生區(qū)預(yù)測[J]. 毛志遠,張兆金,周堅. 林業(yè)科技開發(fā). 2014(06)
[6]基于Maxent和ArcGIS預(yù)測川貝母潛在分布及適宜性評價[J]. 王娟娟,曹博,白成科,張琳琳,車樂. 植物研究. 2014(05)
[7]基于MaxEnt生態(tài)學模型的檀香在中國的潛在種植區(qū)預(yù)測[J]. 胡秀,吳福川,郭微,劉念. 林業(yè)科學. 2014(05)
[8]基于MaxEnt和ArcGIS對太白米的潛在分布預(yù)測及適宜性評價[J]. 車樂,曹博,白成科,王娟娟,張琳琳. 生態(tài)學雜志. 2014(06)
[9]提高生態(tài)位模型轉(zhuǎn)移能力來模擬入侵物種的潛在分布[J]. 朱耿平,劉強,高玉葆. 生物多樣性. 2014(02)
[10]雜交-漸滲的遺傳進化效應(yīng)與栽培作物野生近緣種多樣性保護[J]. 盧寶榮. 科學通報. 2014(06)
碩士論文
[1]基于微衛(wèi)星分子標記研究井岡山和廬山六倍體野生油茶的遺傳結(jié)構(gòu)[D]. 黃小毛.南昌大學 2016
[2]廬山和井岡山不同海拔野生油茶葉片比較轉(zhuǎn)錄組研究[D]. 陳家銘.南昌大學 2015
[3]基于GARP和MAXENT的空心蓮子草在中國的入侵風險預(yù)測[D]. 劉欣.山東師范大學 2012
[4]中亞熱帶常綠闊葉林植物區(qū)系地理研究[D]. 陳衛(wèi)娟.華東師范大學 2006
本文編號:3581034
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