發(fā)布時(shí)間：2021-11-29 04:39

　　從細(xì)胞代謝到種群動態(tài),許多生物學(xué)過程在大小和速率之間都存在異速尺度（冪律函數(shù)）關(guān)系。雖然這種異速尺度關(guān)系是由一定的遺傳因素決定的,但由于缺少合適的分析工具,生物學(xué)家對其精確的遺傳機(jī)制仍不清楚。為了定位與異速生長相關(guān)的QTLs并探究其可能的調(diào)控機(jī)制,本研究開發(fā)一個(gè)基本的統(tǒng)計(jì)學(xué)框架,異速生長的博弈作圖模型,通過將普適的1/4冪律公式嵌入到系統(tǒng)作圖的基本框架內(nèi),定位與冪尺度異速生長相關(guān)的QTLs,并將系統(tǒng)內(nèi)各個(gè)組成性狀的整體生長分解為獨(dú)立生長和互作生長,探討它們之間的競爭與合作模式。將模型應(yīng)用于胡楊實(shí)際數(shù)據(jù),模型成功檢測到地上生物量和地下生物量異速生長相關(guān)SNP 122個(gè),其中雜交類型位點(diǎn)50個(gè),測交類型位點(diǎn)72個(gè),分布在97個(gè)scaffold上。功能注釋發(fā)現(xiàn)各個(gè)SNP都存在可能參與的生物學(xué)過程,發(fā)現(xiàn)部分顯著的SNP與生長調(diào)節(jié)因子（Laplaze et al.,2007;Omidbakhshfard et al.,2015）和細(xì)胞分裂素合成（Dzurova et al.,2015）等相關(guān),已被研究證實(shí)在根系發(fā)育和在不利的環(huán)境條件下根系與其它部位的協(xié)調(diào)生長產(chǎn)生重要作用。對胡楊異速生長的遺傳解析... 

【文章來源】：北京林業(yè)大學(xué)北京市 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：64 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖３－２胡楊自然群體實(shí)驗(yàn)材料的培養(yǎng)過程??

ｒｅｐｒｅｓｅｎｔ?ａｎ?ｉｎｄｉｖｉｄｕａｌ；?Ｌｏｃａｔｉｏｎ?ｏｆ?ｉｎｄｉｖｉｄｕａｌｓ?ａｒｅ?ｉｌｌｕｓｔｒａｔｅｄ?ｏｎ?ｔｈｅ?ｍａｐ?ｂａｓｅｄ?ｏｎ?ｌｏｎｇｉｔｕｄｅｓ?ａｎｄ??ｌａｔｉｔｕｄｅｓ）??圖３－２胡楊自然群體實(shí)驗(yàn)材料的培養(yǎng)過程??Ｆｉｇｕｒｅ?３－２?Ｔｈｅ?ｃｕｌｔｕｒｉｎｇ?ｐｒｏｃｅｄｕｒｅ?ｏｆ?Ｐｏｐｕｌｕｓ?ｅｕｐｈｒａｔｉｃａ??３．１．２表型測定??根據(jù)Ｃｌａｒｋ搭建３６０°植物表型拍照系統(tǒng)，此系統(tǒng)由攜帶試管自轉(zhuǎn)的裝盤、校正光??折射的水箱、Ｃａｎｎｏｎ拍照相機(jī)、背景燈箱和計(jì)算機(jī)組成（Ｃｌａｒｋｅｔａｌ．，２０１１）。在獲取植??株圖像前，將Ｃａｎｎｏｎ相機(jī)調(diào)至固定焦距和位置，隨時(shí)確保水箱內(nèi)無菌，保證水干無雜??質(zhì)。確保拍照室內(nèi)除了背景燈箱外無其它干擾光源，以減小實(shí)驗(yàn)誤差。在固定的１２??個(gè)角度即０。、１５。、３０。、４５。、６０。、７５。、９０。、１０５。、１２０。、１３５。、１５０。、１６５。獲取胡??楊試管苗全株形態(tài)圖像，以ｊｐｇ格式存儲在電腦中。每個(gè)試管從接種后第７天開始圖像??采集，之后每隔一周采集一次，共采集５６天即８個(gè)測量時(shí)間點(diǎn)的胡楊幼苗植株生長形??態(tài)圖像。??２０??

３．２．１群體結(jié)構(gòu)分析??基于貝葉斯聚類軟件ｆａｓｔＳＴＲＵＣＴＵＲＥ，使用經(jīng)過質(zhì)量控制和篩選得到的２５１９６９??個(gè)ＳＮＰ，對胡楊自然群體進(jìn)行群體結(jié)構(gòu)分析。具體如圖３－５所示，每種顏色代表一個(gè)??亞群，每列代表一個(gè)樣本，每列中每個(gè)顏色段代表不同亞群貢獻(xiàn)的比例根據(jù)設(shè)置的每??個(gè)Ｋ值得到的后驗(yàn)概率值變化速率的變化幅度，最終確認(rèn)最優(yōu)的亞群數(shù)量為５，這５個(gè)??亞群分別包含?１０個(gè)（５．３５％），６個(gè)（３．２０％），?１５５個(gè)（８２．８９％），８個(gè)（４．２８％），８個(gè)（４．２８％）樣??本。絕大多數(shù)個(gè)體都屬于同一個(gè)群體，表明在進(jìn)行后續(xù)定位分析時(shí)可以不考慮群體結(jié)??構(gòu)（Ｑ矩陣）對基因定位的影響，忽略群體結(jié)構(gòu)的影響。試驗(yàn)群體自于塔里木河流域“羅??布人村寨”附近，其不屬于由全國范圍內(nèi)搜集的種質(zhì)資源構(gòu)成的植物天然群體。群體??結(jié)構(gòu)分析有助于深入了解試驗(yàn)群體的演化狀況，提高作圖分析的精度。??＼?Ｖ?＜〇??＃?＃?＃?＃＃??〇?＾?ｏ?ｏ?〇??＃?＃?＃?＃＃??圖３－５胡楊自然群體內(nèi)１８７個(gè)個(gè)體群體結(jié)構(gòu)示意圖（圖中紅色、黃色、綠色、藍(lán)色和紫色分別??代表亞群１、亞群２、亞群３亞群４和亞群５）??Ｆｉｇｕｒｅ?３－５?Ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎ?ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ?ｏｆ?１８７?ｉｎｄｉｖｉｄｕａｌｓ?ｂａｓｅｄ?ｏｎ?ＳＮＰｓ．?（Ｒｅｄ

【參考文獻(xiàn)】：
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本文編號：3525859