楊樹(shù)化感效應(yīng)及水楊苷代謝相關(guān)基因研究
發(fā)布時(shí)間:2021-11-28 14:49
植物的次生代謝產(chǎn)物能夠?qū)ζ渌参锂a(chǎn)生不同程度的影響,這種植物化感作用在自然界中廣泛存在,如植物的連作障礙、外來(lái)植物的入侵等。楊樹(shù)具備生長(zhǎng)快、適應(yīng)性強(qiáng)等特點(diǎn),是綠化及用材的主要樹(shù)種之一。了解楊樹(shù)的化感物質(zhì)組成,探索其產(chǎn)生的分子機(jī)制及其效應(yīng),對(duì)于不同楊樹(shù)種植管理及與其他植物的混合應(yīng)用具有重要指導(dǎo)意義。本研究對(duì)白楊派的’84K楊’、’TC1521楊’、胡楊派的胡楊等3種楊樹(shù)的葉和根的化感成分進(jìn)行了 GC-MS分析,研究了主要化感成分的形成機(jī)制,評(píng)價(jià)了其化感效應(yīng)。主要研究結(jié)果如下:(1)不同楊樹(shù)對(duì)高羊茅的化感效應(yīng)3種楊樹(shù)不同濃度的葉水浸液對(duì)高羊茅種子萌發(fā)都體現(xiàn)出抑制效應(yīng),而且隨著濃度的增加發(fā)芽率、發(fā)芽勢(shì)、發(fā)芽指數(shù)、活力指數(shù)下降明顯;對(duì)幼苗的生長(zhǎng)總體表現(xiàn)為低濃度促進(jìn)高濃度抑制的作用,其中濃度低于5mg/mL的’84K楊’葉水浸液對(duì)高羊茅的根長(zhǎng)、低于50 mg/mL的’84K楊’葉水浸液對(duì)高羊茅的苗長(zhǎng)、低于35 mg/mL的’TC1521楊’葉水浸液對(duì)高羊茅的苗長(zhǎng)表現(xiàn)為促進(jìn)作用,其余濃度下3種楊樹(shù)葉水浸液對(duì)高羊茅根長(zhǎng)、苗長(zhǎng)、單株鮮重表現(xiàn)為抑制作用。3種楊樹(shù)根水浸液對(duì)高羊茅的種子萌發(fā)和幼苗生長(zhǎng)體現(xiàn)出...
【文章來(lái)源】:北京林業(yè)大學(xué)北京市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:83 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
水場(chǎng)昔生物合成途徑Figure3.3路Iioin碗
Reads在mRNA上的覆蓋也越均勻。mRNA片段化的結(jié)果用各mRNA轉(zhuǎn)錄??本上Mapped?Reads的位置分布來(lái)進(jìn)行模擬。其中存在嚴(yán)重降解的堿基序列不能被測(cè)??序,因而也就沒(méi)有Reads被比對(duì)上。圖4.1a中橫坐標(biāo)是mRNA位置,縱坐標(biāo)是相應(yīng)??區(qū)間的總Mapped?Reads中Reads所占的百分比?紤]到參考mRNA的長(zhǎng)度差異,在??作圖時(shí)根據(jù)長(zhǎng)度將每個(gè)mRNA分成100個(gè)區(qū)間,并計(jì)算每一個(gè)區(qū)間內(nèi)的Mapped?Reads??數(shù)量和其所占比例。從圖中可以看出MappedReads的分布相對(duì)較均勻,但基因相對(duì)??位置在75%左右處Mapped?Reads的數(shù)量最多,表明RNA有小程度的降解,但數(shù)據(jù)??基本滿足要求。??由插入片段的長(zhǎng)度檢驗(yàn)可以看出其離散情況,直接反映了磁珠在文庫(kù)制備中純化??效果的好壞。通過(guò)插入片段兩端的Reads在毛果楊基因組上比對(duì)出的起止點(diǎn)距離來(lái)計(jì)??算插入片段的長(zhǎng)度,圖4.1b中橫坐標(biāo)是0到800bp范圍內(nèi)雙端Reads在毛果楊基因??組上比對(duì)的起止點(diǎn)間的距離;縱坐標(biāo)是比對(duì)起止點(diǎn)間不同距離的雙端Reads的數(shù)量或??插入片段的數(shù)量,大多插入片段的長(zhǎng)度在280bp左右。??為評(píng)估數(shù)據(jù)是否能夠滿足后續(xù)的分析
對(duì)照組和處理組兩組樣品的FPKM比較顯示,當(dāng)FPKM為0?1之間時(shí),兩組數(shù)??據(jù)顯示出主要的差別,對(duì)照組要明顯多于處理組;FPKM為-2?-1時(shí),對(duì)照組略高;??FPKM為-1?0、1?2時(shí),處理組略高;FP1CM在2以上時(shí),兩組數(shù)據(jù)基本相當(dāng)(圖4.3a)。??根據(jù)兩組樣品表達(dá)量箱線圖也可以看出對(duì)照組和處理組的整體表達(dá)水平相差不大,表??達(dá)量最高和表達(dá)量最低的基因均位于對(duì)照組中(圖4.3b)。??對(duì)照組和處理組中FPKM>10?(SP?loglO(FPKM)>l)的基因分別有10578條和??10607?條,約占全部的?36.86%和?37.85%;?FPKM>100?(loglO(FPKM)〉2)的基因分??別有?1008?條和?977?條,約占全部的?3.51%和?3.49%;?FPKM〉1000(logl0(FPKM)>3)??的基因分別有60條和51條(表4.7)。??4-????A?i??>,?/?Sampte?J?__?1???Semple??%?,丨?-丨:■".丨?一??/?V?I??〇〇-——????????-2?0?2?4?T01?T02??iogiO(fpKmj?Sample??⑷?(b)??40??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]長(zhǎng)期連栽楊樹(shù)林根際土壤自毒作用的生物測(cè)定[J]. 陸茜,張金池,孟苗婧. 生態(tài)學(xué)報(bào). 2017(12)
[2]外源水楊酸誘導(dǎo)的部分甜瓜自毒作用相關(guān)基因的表達(dá)分析[J]. 李易通,張志忠,王革伏,奚玉培. 熱帶作物學(xué)報(bào). 2017(05)
[3]楊樹(shù)人工林連作與輪作土壤酚酸降解細(xì)菌群落特征及酚酸降解代謝規(guī)律[J]. 王文波,馬雪松,董玉峰,王華田,王延平,伊文慧. 應(yīng)用與環(huán)境生物學(xué)報(bào). 2016(05)
[4]三種酚酸類(lèi)化合物對(duì)萵苣幼苗的化感作用及機(jī)理初探[J]. 陳娥,張等宏,王丹丹,金輝,李秀壯,何小鳳,燕志強(qiáng),沈慧敏. 農(nóng)藥學(xué)學(xué)報(bào). 2016(03)
[5]刺柏葉水提液對(duì)高羊茅的化感作用及其GC-MS分析[J]. 王曉英. 草地學(xué)報(bào). 2016(02)
[6]楊樹(shù)根水浸提液對(duì)種子萌發(fā)及幼苗生長(zhǎng)的影響[J]. 蔡新玲,肖正東,季琳琳,王陸軍,周米生,樊巍. 林業(yè)科技開(kāi)發(fā). 2015(06)
[7]馬尾松與楓香根際土壤浸提物的化學(xué)成分[J]. 段劍,王凌云,楊潔,喻馳方,萬(wàn)佳蕾,劉忠. 林業(yè)科學(xué). 2015(08)
[8]雪松枝葉揮發(fā)性物質(zhì)的化感作用及其化學(xué)成分分析[J]. 李曉鳳,焦慧,袁藝,田勝尼. 生態(tài)環(huán)境學(xué)報(bào). 2015(02)
[9]瓊花化感物質(zhì)釋放途徑[J]. 朱強(qiáng),鄒夢(mèng)輝,安黎,田曾元,郭予琦. 西北農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2014(11)
[10]毛白楊根系化感作用[J]. 朱美秋,張麗麗,王輝,袁玉欣. 福建林業(yè)科技. 2014(02)
博士論文
[1]黑沙蒿群落植物演替過(guò)程中的化感作用研究[D]. 鄧文紅.北京林業(yè)大學(xué) 2016
碩士論文
[1]幾種酚酸類(lèi)物質(zhì)協(xié)同作用對(duì)優(yōu)良杉木無(wú)性系化感效應(yīng)研究[D]. 王成偉.福建農(nóng)林大學(xué) 2009
[2]華北落葉松枝葉揮發(fā)物的化感作用及其化學(xué)成分分析[D]. 韓芬.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[3]杉木枯枝落葉不同分解階段化感物質(zhì)生物評(píng)價(jià)與鑒定[D]. 劉學(xué)芝.福建農(nóng)林大學(xué) 2006
本文編號(hào):3524622
【文章來(lái)源】:北京林業(yè)大學(xué)北京市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:83 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
水場(chǎng)昔生物合成途徑Figure3.3路Iioin碗
Reads在mRNA上的覆蓋也越均勻。mRNA片段化的結(jié)果用各mRNA轉(zhuǎn)錄??本上Mapped?Reads的位置分布來(lái)進(jìn)行模擬。其中存在嚴(yán)重降解的堿基序列不能被測(cè)??序,因而也就沒(méi)有Reads被比對(duì)上。圖4.1a中橫坐標(biāo)是mRNA位置,縱坐標(biāo)是相應(yīng)??區(qū)間的總Mapped?Reads中Reads所占的百分比?紤]到參考mRNA的長(zhǎng)度差異,在??作圖時(shí)根據(jù)長(zhǎng)度將每個(gè)mRNA分成100個(gè)區(qū)間,并計(jì)算每一個(gè)區(qū)間內(nèi)的Mapped?Reads??數(shù)量和其所占比例。從圖中可以看出MappedReads的分布相對(duì)較均勻,但基因相對(duì)??位置在75%左右處Mapped?Reads的數(shù)量最多,表明RNA有小程度的降解,但數(shù)據(jù)??基本滿足要求。??由插入片段的長(zhǎng)度檢驗(yàn)可以看出其離散情況,直接反映了磁珠在文庫(kù)制備中純化??效果的好壞。通過(guò)插入片段兩端的Reads在毛果楊基因組上比對(duì)出的起止點(diǎn)距離來(lái)計(jì)??算插入片段的長(zhǎng)度,圖4.1b中橫坐標(biāo)是0到800bp范圍內(nèi)雙端Reads在毛果楊基因??組上比對(duì)的起止點(diǎn)間的距離;縱坐標(biāo)是比對(duì)起止點(diǎn)間不同距離的雙端Reads的數(shù)量或??插入片段的數(shù)量,大多插入片段的長(zhǎng)度在280bp左右。??為評(píng)估數(shù)據(jù)是否能夠滿足后續(xù)的分析
對(duì)照組和處理組兩組樣品的FPKM比較顯示,當(dāng)FPKM為0?1之間時(shí),兩組數(shù)??據(jù)顯示出主要的差別,對(duì)照組要明顯多于處理組;FPKM為-2?-1時(shí),對(duì)照組略高;??FPKM為-1?0、1?2時(shí),處理組略高;FP1CM在2以上時(shí),兩組數(shù)據(jù)基本相當(dāng)(圖4.3a)。??根據(jù)兩組樣品表達(dá)量箱線圖也可以看出對(duì)照組和處理組的整體表達(dá)水平相差不大,表??達(dá)量最高和表達(dá)量最低的基因均位于對(duì)照組中(圖4.3b)。??對(duì)照組和處理組中FPKM>10?(SP?loglO(FPKM)>l)的基因分別有10578條和??10607?條,約占全部的?36.86%和?37.85%;?FPKM>100?(loglO(FPKM)〉2)的基因分??別有?1008?條和?977?條,約占全部的?3.51%和?3.49%;?FPKM〉1000(logl0(FPKM)>3)??的基因分別有60條和51條(表4.7)。??4-????A?i??>,?/?Sampte?J?__?1???Semple??%?,丨?-丨:■".丨?一??/?V?I??〇〇-——????????-2?0?2?4?T01?T02??iogiO(fpKmj?Sample??⑷?(b)??40??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]長(zhǎng)期連栽楊樹(shù)林根際土壤自毒作用的生物測(cè)定[J]. 陸茜,張金池,孟苗婧. 生態(tài)學(xué)報(bào). 2017(12)
[2]外源水楊酸誘導(dǎo)的部分甜瓜自毒作用相關(guān)基因的表達(dá)分析[J]. 李易通,張志忠,王革伏,奚玉培. 熱帶作物學(xué)報(bào). 2017(05)
[3]楊樹(shù)人工林連作與輪作土壤酚酸降解細(xì)菌群落特征及酚酸降解代謝規(guī)律[J]. 王文波,馬雪松,董玉峰,王華田,王延平,伊文慧. 應(yīng)用與環(huán)境生物學(xué)報(bào). 2016(05)
[4]三種酚酸類(lèi)化合物對(duì)萵苣幼苗的化感作用及機(jī)理初探[J]. 陳娥,張等宏,王丹丹,金輝,李秀壯,何小鳳,燕志強(qiáng),沈慧敏. 農(nóng)藥學(xué)學(xué)報(bào). 2016(03)
[5]刺柏葉水提液對(duì)高羊茅的化感作用及其GC-MS分析[J]. 王曉英. 草地學(xué)報(bào). 2016(02)
[6]楊樹(shù)根水浸提液對(duì)種子萌發(fā)及幼苗生長(zhǎng)的影響[J]. 蔡新玲,肖正東,季琳琳,王陸軍,周米生,樊巍. 林業(yè)科技開(kāi)發(fā). 2015(06)
[7]馬尾松與楓香根際土壤浸提物的化學(xué)成分[J]. 段劍,王凌云,楊潔,喻馳方,萬(wàn)佳蕾,劉忠. 林業(yè)科學(xué). 2015(08)
[8]雪松枝葉揮發(fā)性物質(zhì)的化感作用及其化學(xué)成分分析[J]. 李曉鳳,焦慧,袁藝,田勝尼. 生態(tài)環(huán)境學(xué)報(bào). 2015(02)
[9]瓊花化感物質(zhì)釋放途徑[J]. 朱強(qiáng),鄒夢(mèng)輝,安黎,田曾元,郭予琦. 西北農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2014(11)
[10]毛白楊根系化感作用[J]. 朱美秋,張麗麗,王輝,袁玉欣. 福建林業(yè)科技. 2014(02)
博士論文
[1]黑沙蒿群落植物演替過(guò)程中的化感作用研究[D]. 鄧文紅.北京林業(yè)大學(xué) 2016
碩士論文
[1]幾種酚酸類(lèi)物質(zhì)協(xié)同作用對(duì)優(yōu)良杉木無(wú)性系化感效應(yīng)研究[D]. 王成偉.福建農(nóng)林大學(xué) 2009
[2]華北落葉松枝葉揮發(fā)物的化感作用及其化學(xué)成分分析[D]. 韓芬.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[3]杉木枯枝落葉不同分解階段化感物質(zhì)生物評(píng)價(jià)與鑒定[D]. 劉學(xué)芝.福建農(nóng)林大學(xué) 2006
本文編號(hào):3524622
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