NaHCO 3 脅迫下檉柳(T.hispida)根部差異表達蛋白質的研究
發(fā)布時間:2021-11-24 10:57
土壤鹽堿化作為一種重要的非生物限制性因子嚴重影響植物的生長發(fā)育和區(qū)域分布,我國的鹽堿化土壤面積約為1億hm2,面對我國越來越嚴重的土壤鹽堿化,利用分子育種方法提高林木耐鹽性和培育耐鹽新品種是切實有效解決土壤鹽堿化的途徑。檉柳具有極強的抗鹽堿能力,能在0.5%~1%的鹽堿地上生長,是改造鹽堿地的優(yōu)良樹種,通過蛋白質組學手段研究檉柳勢在必行。本實驗以剛毛檉柳(Tamarix hispida Willd.)為材料進行碳酸氫鈉脅迫處理0h、12h、24h和48h,利用iTRAQ定量技術分離并鑒定各處理時間下響應鹽脅迫的根部差異表達蛋白質,并對差異蛋白的功能進行了深入分析,為闡明檉柳響應鹽脅迫的分子機理提供了理論基礎,并為闡明鹽生木本植物的耐鹽機制提供了豐富而強有力的數(shù)據(jù)。本研究共鑒定出521個差異蛋白質,碳酸氫鈉處理12h,表達發(fā)生變化的蛋白質為294個,其中上調表達蛋白質為151個,下調表達蛋白質為143個;碳酸氫鈉處理24h,表達發(fā)生變化的蛋白質為263個,其中上調表達蛋白質124個,下調表達蛋白質139個;碳酸氫鈉處理48h,表達發(fā)生變化的蛋白質為166個,其中上調表達蛋白質78個,下調...
【文章來源】:東北林業(yè)大學黑龍江省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:65 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 緒論
1.1 引言
1.2 鹽脅迫蛋白質組學研究
1.2.1 鹽脅迫對光合作用相關蛋白的影響
1.2.2 鹽脅迫對活性氧清除相關蛋白的影響
1.2.3 鹽脅迫對跨膜運輸與滲透調節(jié)相關蛋白的影響
1.2.4 鹽脅迫對信號轉導相關蛋白的影響
1.3 檉柳鹽脅迫的研究
1.3.1 鹽脅迫對檉柳生理指標的影響
1.3.2 檉柳響應鹽脅迫基因功能的研究
1.4 研究的目的與意義
2 鹽脅迫下檉柳根部蛋白質的鑒定及功能分析
2.1 材料
2.1.1 材料處理與取材
2.1.2 試驗試劑配制
2.2 實驗方法
2.2.1 iTRAQ分析
2.2.2 數(shù)據(jù)庫選擇與Mascot搜索
2.2.3 GO注釋與COG注釋
2.3 結果與討論
2.3.1 檉柳根部總蛋白質的鑒定
2.3.2 檉柳根部總蛋白質的功能注釋
2.3.3 檉柳根部響應鹽脅迫差異蛋白質的鑒定
2.3.4 檉柳根部響應鹽脅迫差異蛋白質的GO分析
2.3.5 檉柳根部響應鹽脅迫差異蛋白質的功能聚類分析
2.4 本章小結
3 檉柳根部差異蛋白質定量PCR的分析
3.1 材料
3.1.1 實驗材料
3.1.2 主要藥劑與儀器
3.2 試驗方法
3.2.1 檉柳根部RNA提取
3.2.2 反轉錄
3.2.3 熒光定量PCR
3.3 結果與討論
3.3.1 差異蛋白質與其mRNA水平的關聯(lián)分析
3.3.2 差異蛋白質的功能分析
3.4 本章小結
4 檉柳根部差異蛋白質與轉錄水平分析
4.1 實驗方法
4.2 結果與討論
4.2.1 檉柳根部差異蛋白質與轉錄水平的相關性分析
4.2.2 檉柳根部差異蛋白質與轉錄水平的功能分析
4.3 本章小結
結論
參考文獻
附錄
攻讀學位期間發(fā)表的學術論文
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]鹽脅迫對亞麻薺幼苗生理生化指標的影響[J]. 李曉雅,趙翠珠,程小軍,賈慶利,李長圣,劉明喆,Chaofu Lu,張猛. 西北農業(yè)學報. 2015(04)
[2]剛毛檉柳TheIF1A基因的互作蛋白及其表達模式分析[J]. 趙震,楊桂燕,張鳳嬌,高彩球. 林業(yè)科學研究. 2015(01)
[3]鹽脅迫對中國檉柳幼苗生理特性的影響[J]. 朱金方,劉京濤,陸兆華,夏江寶,柳海寧,金悅. 生態(tài)學報. 2015(15)
[4]剛毛檉柳TheIF1A基因轉入酵母的抗逆能力分析[J]. 楊桂燕,于麗麗,趙玉琳,趙震,高彩球. 南京林業(yè)大學學報(自然科學版). 2014(05)
[5]檉柳ThERF1與其他ERF家族成員的互作[J]. 聶顯光,及曉宇,劉羽佳,劉文進,王玉成. 東北林業(yè)大學學報. 2014(08)
[6]檉柳ThERF1基因上游調控因子W-box互作蛋白[J]. 臧丹丹,劉文進,王玉成. 東北林業(yè)大學學報. 2014(02)
[7]植物體內活性氧的研究及其在植物抗逆方面的應用[J]. 薛鑫,張芊,吳金霞. 生物技術通報. 2013(10)
[8]檉柳谷胱甘肽轉移酶基因(ThGSTZ1)轉入酵母的抗逆能力分析[J]. 楊桂燕,郭宇聰,王玉成,高彩球. 安徽農業(yè)科學. 2013(28)
[9]植物應答非生物脅迫的代謝組學研究進展[J]. 滕中秋,付卉青,賈少華,孟薇薇,戴榮繼,鄧玉林. 植物生態(tài)學報. 2011(01)
[10]鹽處理對多枝檉柳光合作用和滲調物質的影響[J]. 王偉華,張希明,閆海龍,梁少民,楊小林. 干旱區(qū)研究. 2009(04)
本文編號:3515837
【文章來源】:東北林業(yè)大學黑龍江省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:65 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 緒論
1.1 引言
1.2 鹽脅迫蛋白質組學研究
1.2.1 鹽脅迫對光合作用相關蛋白的影響
1.2.2 鹽脅迫對活性氧清除相關蛋白的影響
1.2.3 鹽脅迫對跨膜運輸與滲透調節(jié)相關蛋白的影響
1.2.4 鹽脅迫對信號轉導相關蛋白的影響
1.3 檉柳鹽脅迫的研究
1.3.1 鹽脅迫對檉柳生理指標的影響
1.3.2 檉柳響應鹽脅迫基因功能的研究
1.4 研究的目的與意義
2 鹽脅迫下檉柳根部蛋白質的鑒定及功能分析
2.1 材料
2.1.1 材料處理與取材
2.1.2 試驗試劑配制
2.2 實驗方法
2.2.1 iTRAQ分析
2.2.2 數(shù)據(jù)庫選擇與Mascot搜索
2.2.3 GO注釋與COG注釋
2.3 結果與討論
2.3.1 檉柳根部總蛋白質的鑒定
2.3.2 檉柳根部總蛋白質的功能注釋
2.3.3 檉柳根部響應鹽脅迫差異蛋白質的鑒定
2.3.4 檉柳根部響應鹽脅迫差異蛋白質的GO分析
2.3.5 檉柳根部響應鹽脅迫差異蛋白質的功能聚類分析
2.4 本章小結
3 檉柳根部差異蛋白質定量PCR的分析
3.1 材料
3.1.1 實驗材料
3.1.2 主要藥劑與儀器
3.2 試驗方法
3.2.1 檉柳根部RNA提取
3.2.2 反轉錄
3.2.3 熒光定量PCR
3.3 結果與討論
3.3.1 差異蛋白質與其mRNA水平的關聯(lián)分析
3.3.2 差異蛋白質的功能分析
3.4 本章小結
4 檉柳根部差異蛋白質與轉錄水平分析
4.1 實驗方法
4.2 結果與討論
4.2.1 檉柳根部差異蛋白質與轉錄水平的相關性分析
4.2.2 檉柳根部差異蛋白質與轉錄水平的功能分析
4.3 本章小結
結論
參考文獻
附錄
攻讀學位期間發(fā)表的學術論文
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]鹽脅迫對亞麻薺幼苗生理生化指標的影響[J]. 李曉雅,趙翠珠,程小軍,賈慶利,李長圣,劉明喆,Chaofu Lu,張猛. 西北農業(yè)學報. 2015(04)
[2]剛毛檉柳TheIF1A基因的互作蛋白及其表達模式分析[J]. 趙震,楊桂燕,張鳳嬌,高彩球. 林業(yè)科學研究. 2015(01)
[3]鹽脅迫對中國檉柳幼苗生理特性的影響[J]. 朱金方,劉京濤,陸兆華,夏江寶,柳海寧,金悅. 生態(tài)學報. 2015(15)
[4]剛毛檉柳TheIF1A基因轉入酵母的抗逆能力分析[J]. 楊桂燕,于麗麗,趙玉琳,趙震,高彩球. 南京林業(yè)大學學報(自然科學版). 2014(05)
[5]檉柳ThERF1與其他ERF家族成員的互作[J]. 聶顯光,及曉宇,劉羽佳,劉文進,王玉成. 東北林業(yè)大學學報. 2014(08)
[6]檉柳ThERF1基因上游調控因子W-box互作蛋白[J]. 臧丹丹,劉文進,王玉成. 東北林業(yè)大學學報. 2014(02)
[7]植物體內活性氧的研究及其在植物抗逆方面的應用[J]. 薛鑫,張芊,吳金霞. 生物技術通報. 2013(10)
[8]檉柳谷胱甘肽轉移酶基因(ThGSTZ1)轉入酵母的抗逆能力分析[J]. 楊桂燕,郭宇聰,王玉成,高彩球. 安徽農業(yè)科學. 2013(28)
[9]植物應答非生物脅迫的代謝組學研究進展[J]. 滕中秋,付卉青,賈少華,孟薇薇,戴榮繼,鄧玉林. 植物生態(tài)學報. 2011(01)
[10]鹽處理對多枝檉柳光合作用和滲調物質的影響[J]. 王偉華,張希明,閆海龍,梁少民,楊小林. 干旱區(qū)研究. 2009(04)
本文編號:3515837
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