新疆密葉楊群體遺傳多樣性及遺傳結(jié)構(gòu)研究
發(fā)布時(shí)間:2021-11-22 04:18
密葉楊(Populus talassica Kom.)是楊柳科(Salicaceae)楊屬(Populus)樹種,落葉喬木,是新疆維吾爾自治區(qū)天山河谷天然次生林生態(tài)系統(tǒng)中重要的建群種,具有重要的用材和生態(tài)價(jià)值。本研究在新疆密葉楊資源分布調(diào)查的基礎(chǔ)上,以在新疆天山中西部山地河谷分布的6個(gè)群體樣本為材料,采用SSR分子標(biāo)記對(duì)密葉楊不同地域群體、不同年齡群體、雌雄群體以及親子代群體間遺傳多樣性和群體遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行了研究,以期為密葉楊種質(zhì)資源的保護(hù)、育種群體策略的制定等提供理論依據(jù)。主要研究結(jié)果如下:(1)從480對(duì)SSR引物中篩選獲得23對(duì)高多態(tài)性引物。使用23對(duì)SSR引物對(duì)密葉楊群體的316個(gè)單株進(jìn)行中性檢測(cè),共獲得217個(gè)等位基因(Na),其中最多為 16 個(gè)(引物 GCPM3390、GCPM4046),最少為 2 個(gè)(引物 GCPM3264),平均為9.435,有效等位基因數(shù)(Ne)在1.663和7.971之間,平均為3.498;23對(duì)引物均位于95%置信區(qū)間,表明所用SSR引物大部分為中性標(biāo)記,基本不受外界選擇因素的干擾...
【文章來源】:北京林業(yè)大學(xué)北京市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:104 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
1密葉楊采樣區(qū)
均在1.9 ̄2.1之間,OD260/OD230均在1.9?2.3之間。檢測(cè)均為標(biāo)準(zhǔn)的DNA曲線,??說明所提DNA沒有蛋白質(zhì)和酚類的雜質(zhì)污染。并將所有的DNA稀釋到50ng/^L。經(jīng)??過試驗(yàn)分析,各樣品均能擴(kuò)增出清晰的條帶。瓊脂糖電泳檢測(cè)結(jié)果如圖2-2:??pp—Wiil—PPPPPI??.?:丨??j:??圖2.2?DNA瓊脂糖電泳圖??Figure?2.2?DNA?agarose?electropherogram??2.2.2?SSR引物篩選及多態(tài)性檢測(cè)??利用2個(gè)DNA混合池作為擴(kuò)增模板,對(duì)480對(duì)SSR引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,發(fā)現(xiàn)??60對(duì)引物可獲取清晰的單一條帶,而剩余的引物沒有條帶或條帶很淡,或者擴(kuò)增出??多條產(chǎn)物,推測(cè)有非特異性擴(kuò)增的產(chǎn)生。??在擴(kuò)增良好的60對(duì)引物中,28對(duì)產(chǎn)物符合期望目的產(chǎn)物大小。為了檢測(cè)開發(fā)的??18??
?5?6??圖3-2樣品材料劃分群組遺傳結(jié)構(gòu)??Figure?3.2?Sample?material?division?group?genetic?structure??在表3.3中,通過Arlequin3.5.2軟件對(duì)Structure分成2組的密葉楊群體對(duì)其米取??分子方差分析(AMOVA)。AMOVA分析表明,二組的變異主要發(fā)生在群體內(nèi),分??別占比占91.15%、95.47%。研宄結(jié)果表明:在亞居群內(nèi),所產(chǎn)生的遺傳變異達(dá)到了??89.79%,在亞居群間則為10.21%。與Popgene顯示群體間遺傳分化系數(shù)值0.094的結(jié)??果相類似。??34??
本文編號(hào):3510920
【文章來源】:北京林業(yè)大學(xué)北京市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:104 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
1密葉楊采樣區(qū)
均在1.9 ̄2.1之間,OD260/OD230均在1.9?2.3之間。檢測(cè)均為標(biāo)準(zhǔn)的DNA曲線,??說明所提DNA沒有蛋白質(zhì)和酚類的雜質(zhì)污染。并將所有的DNA稀釋到50ng/^L。經(jīng)??過試驗(yàn)分析,各樣品均能擴(kuò)增出清晰的條帶。瓊脂糖電泳檢測(cè)結(jié)果如圖2-2:??pp—Wiil—PPPPPI??.?:丨??j:??圖2.2?DNA瓊脂糖電泳圖??Figure?2.2?DNA?agarose?electropherogram??2.2.2?SSR引物篩選及多態(tài)性檢測(cè)??利用2個(gè)DNA混合池作為擴(kuò)增模板,對(duì)480對(duì)SSR引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,發(fā)現(xiàn)??60對(duì)引物可獲取清晰的單一條帶,而剩余的引物沒有條帶或條帶很淡,或者擴(kuò)增出??多條產(chǎn)物,推測(cè)有非特異性擴(kuò)增的產(chǎn)生。??在擴(kuò)增良好的60對(duì)引物中,28對(duì)產(chǎn)物符合期望目的產(chǎn)物大小。為了檢測(cè)開發(fā)的??18??
?5?6??圖3-2樣品材料劃分群組遺傳結(jié)構(gòu)??Figure?3.2?Sample?material?division?group?genetic?structure??在表3.3中,通過Arlequin3.5.2軟件對(duì)Structure分成2組的密葉楊群體對(duì)其米取??分子方差分析(AMOVA)。AMOVA分析表明,二組的變異主要發(fā)生在群體內(nèi),分??別占比占91.15%、95.47%。研宄結(jié)果表明:在亞居群內(nèi),所產(chǎn)生的遺傳變異達(dá)到了??89.79%,在亞居群間則為10.21%。與Popgene顯示群體間遺傳分化系數(shù)值0.094的結(jié)??果相類似。??34??
本文編號(hào):3510920
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