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尖孢鐮刀菌侵染后三年桐、千年桐根部比較轉(zhuǎn)錄組及Vf/VmLRR-RLKs初步分析

發(fā)布時(shí)間:2021-11-05 12:38
  油桐(Vernicia fordii)是原產(chǎn)中國(guó)的世界著名工業(yè)油料樹(shù)種,由其種子提煉而得的桐油是一種優(yōu)質(zhì)干性油,廣泛用于工、農(nóng)、漁、軍事及醫(yī)藥等領(lǐng)域,同時(shí)因其清潔、安全、可再生等特點(diǎn)可作為重要的生物柴油原料。1939年以來(lái),油桐枯萎病的爆發(fā)使大片油桐林被毀,嚴(yán)重制約了油桐的種植及產(chǎn)業(yè)發(fā)展,且該病在2007年卷土重來(lái),再次讓我國(guó)油桐產(chǎn)業(yè)蒙受損失。油桐枯萎病發(fā)病歷時(shí)長(zhǎng)、分布廣、危害重、損失大,多年來(lái)難以從根本上進(jìn)行有效防治,從分子水平對(duì)油桐枯萎病抗性相關(guān)基因的挖掘有助于對(duì)油桐抗枯萎病機(jī)理進(jìn)行解析。油桐枯萎病主要侵害三年桐,而同屬的千年桐具有抗枯萎病能力。本文將油桐枯萎病病原菌[尖孢鐮刀菌(Fusarium oxysporum)]侵染感病三年桐和抗病千年桐,對(duì)侵染前后不同時(shí)期的根部組織進(jìn)行RNA-seq測(cè)序,分析兩個(gè)物種響應(yīng)油桐枯萎病的基因表達(dá)模式及差異,發(fā)現(xiàn)富亮氨酸重復(fù)類受體蛋白(Leucine-rich repeat receptor-like protein,LRR-RLK)基因家族在抗病千年桐中作為中心基因參與千年桐對(duì)枯萎病的應(yīng)答。我們對(duì)兩個(gè)樹(shù)種的LRR-RLK基因家族著重進(jìn)行了比較... 

【文章來(lái)源】:中國(guó)林業(yè)科學(xué)研究院北京市

【文章頁(yè)數(shù)】:129 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

尖孢鐮刀菌侵染后三年桐、千年桐根部比較轉(zhuǎn)錄組及Vf/VmLRR-RLKs初步分析


研究的技術(shù)路線

長(zhǎng)度分布,長(zhǎng)度分布


圖 2-1 三年桐 RNA-seq 結(jié)果 Transcripts 長(zhǎng)度分布統(tǒng)計(jì)Fig.2-1 Length distribution of transcripts of RNA-seq of V.fordii

長(zhǎng)度分布,長(zhǎng)度分布


圖 2-1 三年桐 RNA-seq 結(jié)果 Transcripts 長(zhǎng)度分布統(tǒng)計(jì)Fig.2-1 Length distribution of transcripts of RNA-seq of V.fordii

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]三年桐、千年桐感染枯萎病病原菌后的生理反應(yīng)[J]. 楊素素,高暝,朱慧萍,劉英冠,汪陽(yáng)東,陳益存.  林業(yè)科學(xué)研究. 2014(06)
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[3]直系同源基因的識(shí)別方法與數(shù)據(jù)庫(kù)[J]. 楊婧,黃原,汪曉陽(yáng).  生命科學(xué)研究. 2013(03)
[4]基于高通量測(cè)序的凡納濱對(duì)蝦的轉(zhuǎn)錄組分析[J]. 曾地剛,陳秀荔,謝達(dá)祥,趙永貞,楊春玲,馬寧,李詠梅,陳曉漢.  基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2013(03)
[5]參與植物防御反應(yīng)的LRR型蛋白結(jié)構(gòu)與功能[J]. 張盈玉,馬榮才.  中國(guó)農(nóng)業(yè)科技導(dǎo)報(bào). 2009(03)
[6]KaKsCalculator:Calculating Ka and Ks Through Model Selection and Model Averaging[J]. Gane Ka-Shu Wong.  Genomics Proteomics & Bioinformatics. 2006(04)
[7]不同南瓜砧木品種對(duì)網(wǎng)紋甜瓜生長(zhǎng)發(fā)育的影響[J]. 陳幼源,陳緋翔.  上海農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2002(04)
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[9]AM真菌和鐮刀菌對(duì)西瓜根系幾種酶活性的影響[J]. 李敏,劉潤(rùn)進(jìn),趙洪海.  菌物系統(tǒng). 2001(04)
[10]植株調(diào)整對(duì)無(wú)土栽培網(wǎng)紋甜瓜不同品種產(chǎn)量和品質(zhì)的影響[J]. 陳幼源.  上海農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2000(02)

博士論文
[1]達(dá)爾文氏棉旱脅迫轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、EST-SSR開(kāi)發(fā)及高密度遺傳圖譜構(gòu)建[D]. 陳浩東.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2013
[2]熱脅迫下丹參次生代謝比較轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究[D]. 李東.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011

碩士論文
[1]基于RNA-Seq技術(shù)的國(guó)產(chǎn)沉香轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及數(shù)字基因表達(dá)譜分析[D]. 吳宏清.江西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[2]基于RNA-seq測(cè)序的梅花轉(zhuǎn)錄組分析[D]. 石文芳.北京林業(yè)大學(xué) 2012
[3]中華蜜蜂轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及雌性蜜蜂基因表達(dá)分析[D]. 劉亭亭.江西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[4]江南卷柏孢子發(fā)育轉(zhuǎn)錄組分析及其與擬南芥種子成熟發(fā)育轉(zhuǎn)錄組特征的比較[D]. 張彥.復(fù)旦大學(xué) 2012



本文編號(hào):3477812

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