PtrGATA12在毛果楊樹次生生長中生物學(xué)功能分析
發(fā)布時(shí)間:2021-10-19 14:17
GATA轉(zhuǎn)錄因子是一類廣泛存在于真核生物中的轉(zhuǎn)錄因子,在植物光響應(yīng)調(diào)控、細(xì)胞分裂素響應(yīng)以及碳、氮代謝等與次生生長相關(guān)的生物學(xué)過程中發(fā)揮重要作用。目前,對GATA家族的基因只局限于對其家族基因及其編碼蛋白基本特性的分析。前期研究中,利用生物信息學(xué)手段推測出GATA12參與植物次生生長。本文對毛果楊(GATA12在其次生生長中的生物學(xué)功能進(jìn)行初步的探討,主要結(jié)果如下。1.從毛果楊中克隆到擬南芥GATA12直系同源基因PtrGATA12全長cDNA序列,與毛果楊GATA家族的PtrGATA18.1和PtrGATAT1相似性到86%,將其命名為PtrGATA12。PtrGATA12編碼373個(gè)氨基酸、分子量為41397.57、等電點(diǎn)(PI)為6.04,且在260-310個(gè)氨基酸處具有GATA家族轉(zhuǎn)錄因子典型結(jié)構(gòu)域:存在C-X2-C-X17-20-C-X2-C鋅指結(jié)構(gòu)域。2.通過農(nóng)桿菌介導(dǎo)法獲得7個(gè)過表達(dá)PtrG4T4A2轉(zhuǎn)基因毛果楊株系,對其中GATA12表達(dá)量最高的3個(gè)株系的表型進(jìn)行了連續(xù)觀測,結(jié)果表明,轉(zhuǎn)基因株系生長正常,表型與野生型無明顯差異,但在生長90天時(shí),PtrGATA12轉(zhuǎn)基因毛...
【文章來源】:東北林業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:77 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1-1木質(zhì)素合成相關(guān)功能基因??Fig.?1-1?The?functional?genes?involved?in?lignin?synthesis??
圖2-1毛果楊RNA??Fig.2-1?Total?RNA??
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【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]植物次生細(xì)胞壁加厚調(diào)控研究進(jìn)展[J]. 黃成,李來庚. 植物生理學(xué)報(bào). 2016(01)
[2]植物轉(zhuǎn)錄因子分類、預(yù)測和數(shù)據(jù)庫構(gòu)建[J]. 靳進(jìn)樸,郭安源,何坤,張禾,朱其慧,陳新,高歌,羅靜初. 生物技術(shù)通報(bào). 2015(11)
[3]香蕉枯萎病菌GATA轉(zhuǎn)錄因子基因Fnr1的克隆及序列分析[J]. 漆艷香,張欣,張賀,陸英,蒲金基,喻群芳,謝藝賢. 果樹學(xué)報(bào). 2014(04)
[4]植物GRAS家族轉(zhuǎn)錄因子的研究現(xiàn)狀[J]. 李桂英,田玉富,楊成君. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(14)
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[7]植物bZIP轉(zhuǎn)錄因子的研究進(jìn)展[J]. 楊穎,高世慶,唐益苗,冶曉芳,王永波,劉美英,趙昌平. 麥類作物學(xué)報(bào). 2009(04)
[8]鋅指蛋白結(jié)構(gòu)及功能研究進(jìn)展[J]. 趙楠,趙飛,李玉花. 生物技術(shù)通訊. 2009(01)
[9]GATA轉(zhuǎn)錄因子研究進(jìn)展[J]. 史瑩華,許梓榮. 生物學(xué)通報(bào). 2005(03)
[10]植物細(xì)胞次生壁形成的研究進(jìn)展[J]. 賀新強(qiáng),崔克明. 植物學(xué)通報(bào). 2002(05)
博士論文
[1]楊樹PtoVNS11和PtoMYB156轉(zhuǎn)錄因子在次生壁形成及類黃酮代謝途徑中的功能分析[D]. 楊立.西南大學(xué) 2016
[2]楊樹木質(zhì)素合成酶PAL基因的克隆、鑒定及其表達(dá)載體的構(gòu)建[D]. 薛永常.中國林業(yè)科學(xué)研究院 2001
本文編號:3445029
【文章來源】:東北林業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:77 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1-1木質(zhì)素合成相關(guān)功能基因??Fig.?1-1?The?functional?genes?involved?in?lignin?synthesis??
圖2-1毛果楊RNA??Fig.2-1?Total?RNA??
?2?ftrGJU/2的克隆與表達(dá)分析???2.3.2?構(gòu)建?pEASYTM-BIunt-P"?GL47>^?載體以及克隆??將上述RNA進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄,以其為模板,以P/rG47^2-F/R為引物,進(jìn)行克隆,P電泳檢??測結(jié)果如圖2-2A所示。將PCR產(chǎn)物進(jìn)行膠回收,并與/7£^Sy?-Blunt載體連接,轉(zhuǎn)化大腸??桿菌,菌液檢測結(jié)果如圖2-2B所示,選取正確位置的菌液送到生物公司測序,結(jié)果比對與毛??果洋網(wǎng)站數(shù)據(jù)一致,序列全長為1122?bp,將其命名為乃rGJUW。??圖2-2?PW24Z4/2基因CDS全長PCR擴(kuò)增產(chǎn)物及菌液PCR檢測??A:?/VG^472基因編碼區(qū)全長的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物;B:菌液PCR檢測??Fig.2-2?Amplification?of?the?PtrATGAT12?gene?CDS?and?Bacterial?liquid?PCR?of?Pti<}ATA12?recombinant??A:?Amplification?of?the?PtrGATA12?gene?CDS;?B:?Bacterial?liquid?PCR?of?PtrGATA12?recombinant??2.3.3?/VKZ47^72的生物信息學(xué)分析??2.3.3.1?PtrGATAU??通過尸/7<^及/2相關(guān)基因的理化性質(zhì)分析發(fā)現(xiàn):蛋白的氧基酸總數(shù)位373,??且其分子量高達(dá)41808.29,等電點(diǎn)(PI)為6.04,結(jié)構(gòu)式為CmsH^oNsMOwSw,由5643個(gè)??原子組成,正、負(fù)電荷殘基數(shù)分別是37與47個(gè),其他的GATA家族成員的情況如下(表2-3)。??表2-3毛果楊G-42:4基因概況??Tab.2-3?
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[3]香蕉枯萎病菌GATA轉(zhuǎn)錄因子基因Fnr1的克隆及序列分析[J]. 漆艷香,張欣,張賀,陸英,蒲金基,喻群芳,謝藝賢. 果樹學(xué)報(bào). 2014(04)
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[5]植物bHLH轉(zhuǎn)錄因子研究進(jìn)展[J]. 劉文文,李文學(xué). 生物技術(shù)進(jìn)展. 2013(01)
[6]沙冬青GATA型鋅指蛋白基因序列及表達(dá)分析[J]. 史軍娜,劉美芹,師靜,王艷萍,智冠華,陳玉珍,盧存福. 北京林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2011(03)
[7]植物bZIP轉(zhuǎn)錄因子的研究進(jìn)展[J]. 楊穎,高世慶,唐益苗,冶曉芳,王永波,劉美英,趙昌平. 麥類作物學(xué)報(bào). 2009(04)
[8]鋅指蛋白結(jié)構(gòu)及功能研究進(jìn)展[J]. 趙楠,趙飛,李玉花. 生物技術(shù)通訊. 2009(01)
[9]GATA轉(zhuǎn)錄因子研究進(jìn)展[J]. 史瑩華,許梓榮. 生物學(xué)通報(bào). 2005(03)
[10]植物細(xì)胞次生壁形成的研究進(jìn)展[J]. 賀新強(qiáng),崔克明. 植物學(xué)通報(bào). 2002(05)
博士論文
[1]楊樹PtoVNS11和PtoMYB156轉(zhuǎn)錄因子在次生壁形成及類黃酮代謝途徑中的功能分析[D]. 楊立.西南大學(xué) 2016
[2]楊樹木質(zhì)素合成酶PAL基因的克隆、鑒定及其表達(dá)載體的構(gòu)建[D]. 薛永常.中國林業(yè)科學(xué)研究院 2001
本文編號:3445029
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