毛竹是竹類植物中應(yīng)用最廣泛的一類,它原產(chǎn)中國,是具有較高生態(tài)和經(jīng)濟(jì)價(jià)值的竹類植物,也在安徽省農(nóng)業(yè)經(jīng)濟(jì)中占據(jù)重要地位。然而,隨著全球變暖趨勢(shì)的日益加劇,安徽冬秋季節(jié)性干旱氣候?qū)γ裆L的負(fù)面影響越來越顯著,毛竹竹材及竹筍的產(chǎn)量和品質(zhì)嚴(yán)重下降,毛竹的干旱問題亟待解決。傳統(tǒng)的干旱解決辦法如灌溉不僅耗資巨大,管理困難,而且水資源浪費(fèi)嚴(yán)重。隨著2013年我國對(duì)毛竹全基因組測(cè)序工作的全面完成,以及毛竹相關(guān)網(wǎng)站的日益完善,在當(dāng)今的大數(shù)據(jù)時(shí)代背景下,對(duì)毛竹進(jìn)行基因水平的抗旱機(jī)制研究已是大勢(shì)所趨。植物HD-Zip蛋白是一類重要的調(diào)控植物生長發(fā)育以及抵抗非生物脅迫的轉(zhuǎn)錄因子家族。HD-Zip蛋白共分為四個(gè)亞家族,各亞家族功能不同,其中HD-Zip I亞家族基因主要參與調(diào)控干旱等非生物脅迫反應(yīng),目前在擬南芥、水稻、玉米等物種中已經(jīng)分離并驗(yàn)證了該亞家族一系列抗旱相關(guān)基因,但是在有關(guān)毛竹抗旱的研究工作當(dāng)中,還沒有涉及到HD-Zip轉(zhuǎn)錄因子。因此,本研究重點(diǎn)關(guān)注毛竹HD-Zip I亞家族基因。在本研究中,首先利用毛竹網(wǎng)站從毛竹全基因組中鑒定出毛竹HD-Zip轉(zhuǎn)錄因子,然后通過基因結(jié)構(gòu)、進(jìn)化關(guān)系以及轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)等生物... 

【文章來源】：安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)安徽省

【文章頁數(shù)】：67 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

HD-Zip的分類及其結(jié)構(gòu)特征

基因序列進(jìn)行比對(duì)。3 PeHDZ45 基因的組織表達(dá)模式分析(一) 毛竹組織材料的采集毛竹組織材料全部采集于安徽省寧國市。在毛竹的整個(gè)生長周期內(nèi)分別獲取葉、成熟葉、根、筍和花，液氮速凍后存于-70 oC 冰箱保存。(二) RNA 的提取和組織表達(dá)模式熒光定量 PCR 實(shí)驗(yàn) 3.2.104 PeHDZ45 基因的亞細(xì)胞定位分析(一) PeHDZ45 的亞細(xì)胞定位載體的構(gòu)建我們使用改造后的 pCAMBIA1305 載體 (簡稱 p1305) 和 GFP 綠色熒光蛋白構(gòu)建了 p1305-CaMV35S-PeHDZ45-GFP 融合表達(dá)載體，同時(shí)構(gòu)建了一個(gè)對(duì)1305-CaMV35S- GFP（圖 3-1）。

6圖 4-1 毛竹 HD-Zip 轉(zhuǎn)錄因子的進(jìn)化樹關(guān)系及基因結(jié)構(gòu)圖4-1 A: 毛竹 HD-Zip 轉(zhuǎn)錄因子的進(jìn)化樹關(guān)系 4-1 B: 毛竹 HD-Zip 轉(zhuǎn)錄因子的基因結(jié)構(gòu)Fig. 4-1 Phylogenetic relationships and gene structures of PeHDZ genes4-1 A: Phylogenetic relationships of PeHDZ genes 4-1 B: Gene structures of PeHDZ genes4.3 毛竹 HD-Zip 轉(zhuǎn)錄因子的保守基序分析為了對(duì)毛竹 HD-Zip 轉(zhuǎn)錄因子的保守結(jié)構(gòu)域有更全面深刻的了解，我們?cè)?MEME網(wǎng)站在線搜索毛竹 HD-Zip 轉(zhuǎn)錄因子的保守基序（設(shè)置查找的保守基序個(gè)數(shù)為 25），然后利用 Pfam 和 SMART 工具對(duì)搜索到的基序進(jìn)行注釋，詳細(xì)信息見附錄 A 和 B。簡化搜索到的基序結(jié)構(gòu)圖，只保留毛竹 HD-Zip 轉(zhuǎn)錄因子主要保守基序，結(jié)果如圖 4-2所示。觀察分析圖 4-2 可知，48 個(gè)毛竹 PeHDZ 轉(zhuǎn)錄因子聚類成四個(gè)亞家族，對(duì)比進(jìn)化樹分析可知，進(jìn)化關(guān)系比較近的基因擁有相似的保守基序結(jié)構(gòu)，說明處于同一亞家族的基因可能擁有相似的功能。此外，我們發(fā)現(xiàn)，所有的毛竹 HD-Zip 轉(zhuǎn)錄因子都含有HD 和 LZ 保守結(jié)構(gòu)域

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]毛竹TIPs基因家族成員組織表達(dá)模式研究[J]. 孫化雨,婁永峰,李利超,趙韓生,高志民.  林業(yè)科學(xué)研究. 2016(04)
[2]毛竹資源現(xiàn)狀與經(jīng)營利用淺析[J]. 鐘華斌,孫春濤,李亮光,陳昀.  湖南林業(yè)科技. 2016(03)
[3]提高毛竹林產(chǎn)量和質(zhì)量的實(shí)用方法[J]. 袁銘.  現(xiàn)代園藝. 2016(07)
[4]試論種植毛竹收獲生態(tài)經(jīng)濟(jì)兩效益[J]. 嚴(yán)圣欽.  綠色科技. 2016(01)
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[7]皖南山區(qū)毛竹豐產(chǎn)培育的技術(shù)要點(diǎn)[J]. 張建中.  安徽農(nóng)學(xué)通報(bào). 2015(20)
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[9]毛竹低產(chǎn)林改造技術(shù)應(yīng)用微探[J]. 莊金坤.  農(nóng)業(yè)與技術(shù). 2015(07)
[10]植物轉(zhuǎn)錄因子家族在耐鹽抗旱調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中的作用[J]. 李田,孫景寬,劉京濤.  生命科學(xué). 2015(02)

碩士論文
[1]毛竹AP2/ERF基因家族分析及DREB類轉(zhuǎn)錄因子表達(dá)研究[D]. 吳惠俐.中國林業(yè)科學(xué)研究院 2015
[2]安徽竹類病害種類調(diào)查及主要病害發(fā)生規(guī)律研究[D]. 余雯雯.安徽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[3]毛竹經(jīng)營規(guī)模效率的影響因素研究[D]. 李芳寧.福建農(nóng)林大學(xué) 2010
[4]毛竹幼苗干旱脅迫生理響應(yīng)機(jī)制研究[D]. 郭璟.浙江林學(xué)院 2009



本文編號(hào)：3340125