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中國(guó)癭蜂科部分屬種DNA條形碼及系統(tǒng)發(fā)育研究

發(fā)布時(shí)間:2021-07-27 00:14
  蟲癭是自然界極常見的生物現(xiàn)象,是植物與昆蟲互作的奇特產(chǎn)物,而癭蜂是致癭昆蟲的主要類群之一。癭蜂棲息于完全封閉的蟲癭內(nèi),高效截獲寄主植物的營(yíng)養(yǎng)而嚴(yán)重危害植物。由于其高度隱蔽導(dǎo)致防治難度大,生產(chǎn)實(shí)踐急需建立準(zhǔn)確而高效的癭蜂昆蟲鑒定體系。DNA條形碼技術(shù)作為新興的物種鑒定技術(shù),受到廣泛關(guān)注。本研究首次將DNA條形碼技術(shù)應(yīng)用于我國(guó)癭蜂科昆蟲,基于COⅠ、COⅡ、28SrDNA基因序列以及聯(lián)合數(shù)據(jù)集COⅠ+COⅡ+28SrDNA,對(duì)4屬22種癭蜂科昆蟲進(jìn)行堿基成分、種內(nèi)及種間遺傳距離、系統(tǒng)發(fā)育檢驗(yàn),運(yùn)用鄰接法、最大似然法、最小進(jìn)化法等方法構(gòu)建了癭蜂科昆蟲系統(tǒng)發(fā)育樹。通過(guò)分析得出如下結(jié)果:1、癭蜂科昆蟲的堿基分析結(jié)果顯示,COⅠ、COⅡ序列以及聯(lián)合數(shù)據(jù)集A+T含量均顯著高于G+C含量,而28SrDNA基因序列G+C含量則高于A+T含量;COI基因序列變異位點(diǎn)數(shù)占總位點(diǎn)數(shù)的比列最高,其次為COⅡ和聯(lián)合數(shù)據(jù)集,最后為28SrDNA,說(shuō)明COⅠ基因序列對(duì)近緣種的區(qū)分優(yōu)勢(shì)更明顯;堿基替換分析中,COⅠ基因序列轉(zhuǎn)換與顛換的比值為0.69,COⅡ基因序列轉(zhuǎn)換與顛換的比值為0.64,表現(xiàn)出線粒體基因高突變性的特... 

【文章來(lái)源】:浙江農(nóng)林大學(xué)浙江省

【文章頁(yè)數(shù)】:75 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

中國(guó)癭蜂科部分屬種DNA條形碼及系統(tǒng)發(fā)育研究


COⅠ基因序列的PCR擴(kuò)增結(jié)果

基因序列,PCR擴(kuò)增


圖 3.1 COⅠ基因序列的 PCR 擴(kuò)增結(jié)果Fig 3.1 The PCR amplication results of the COⅠgene sequence6(Synergus): S.ishikarii; S.symbioticus; S.gifuensis; S.belizinellus; S.snecrus): S.globosus; S.shanzhukui; S.shirakashii; S.sp.1; S. nantoui; S. gilvusricus): A.mukaigawae; A. kashiwaphilus; A. flavus;

序列,基因序列,PCR擴(kuò)增,位點(diǎn)


圖 3.3 28SrDNA 基因序列的 PCR 擴(kuò)增結(jié)果Fig 3.3 The PCR amplication results of the 28SrDNA gene sequence(Synergus): S.ishikarii; S.symbioticus; S.gifuensis; S.belizinellus; Secrus): S.globosus; S.shanzhukui; S.shirakashii; S.sp.1; S. nantoui; S. gilvucus): A.mukaigawae; A. kashiwaphilus; A. flavus;因序列的分析成及位點(diǎn)MEGA5.1 軟件,將所得序列以及 GenBank 下載序列進(jìn)行同源性因序列組成進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,所有序列共包含 162 個(gè)保守位點(diǎn)(C3 個(gè)變異位點(diǎn)(V:Variable sites),294 個(gè)簡(jiǎn)約信息位點(diǎn)(Pin sites),198 個(gè)單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)(S:Singleton sites)。癭蜂的變異位點(diǎn),在近緣種的區(qū)分上具有明顯的優(yōu)勢(shì)。的 COⅠ序列進(jìn)行堿基組成分析,結(jié)果顯示,四種堿基的平均),T(41.8%),C(14.2%),G(12.2%),AT 含量(73.6%)明4%),具有明顯的 AT 偏向性,與昆蟲線粒體基因具有高 AT 含碼子第一位點(diǎn) A+T 含量為 89.3%,第二位點(diǎn) A+T 含量為 66.6

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[3]基于COI和28S rDNA的葉蜂科昆蟲分子系統(tǒng)研究[D]. 劉艷霞.中南林業(yè)科技大學(xué) 2012
[4]DNA條形碼技術(shù)在主要實(shí)蠅類害蟲識(shí)別中的應(yīng)用[D]. 劉慎思.西南大學(xué) 2012
[5]不同寄主植物栗癭蜂mtDNA COⅠ和COⅡ基因部分序列及其系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系分析[D]. 陸鵬飛.中南林業(yè)科技大學(xué) 2011



本文編號(hào):3304661

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