中國楊屬物種DNA條形碼及分子系統(tǒng)學(xué)初步研究
發(fā)布時間:2021-06-28 06:19
楊屬物種由于嚴(yán)格的異交性質(zhì)和廣泛的種間雜交使得根據(jù)形態(tài)特征很難區(qū)分。DNA條形碼是一種通過標(biāo)準(zhǔn)的DNA片段來實現(xiàn)物種快速鑒定的方法,因此楊屬物種的DNA條形碼研究有利于天然種質(zhì)資源的鑒別和保護(hù)。本研究對中國楊屬17個代表種69個樣本選取核基因組片段DSH10、DSH28和葉綠體片段matK、ndhF、ycf1、atpH-atpI進(jìn)行DNA條形碼研究,結(jié)果表明單拷貝核基因DSH10和DSH28和ITS的物種區(qū)分能力相當(dāng),都要明顯優(yōu)于葉綠體片段,無論是單片段還是多片段組合,其中三個核基因組片段組合的物種分辨率最高(47.06%),能夠區(qū)分出胡楊(Populus euphrantica)、毛白楊(P. tomentosa)、遼楊(P. maximowiczii)、山楊(P. davidiana)、圓葉楊(P. rotundifolia)、梧桐楊(P.pseudomaximowiczii)、大葉楊(P. lasiocarpa)和三脈青楊(P. trinervis),表明核基因組片段更適合楊屬物種的鑒別。最高物種分辨率的片段組合仍然不能區(qū)分一半的物種,因此需從技術(shù)方法上進(jìn)行改進(jìn),本研究推薦引入特...
【文章來源】:北京林業(yè)大學(xué)北京市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:70 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
1. 引言
1.1 DNA條形碼概述
1.1.1 DNA條形碼研究歷史
1.1.2 DNA條形碼技術(shù)規(guī)范
1.1.3 影響植物DNA條形碼物種分辨率的因素
1.1.4 植物DNA條形碼的展望
1.2 研究對象概述
1.2.1 中國楊屬植物概述
1.2.2 楊屬的分子系統(tǒng)學(xué)研究進(jìn)展
1.2.3 研究目的和意義
2. 中國楊屬部分物種的DNA條形碼研究
2.1 材料與方法
2.1.1 材料
2.1.2 實驗方法
2.2 結(jié)果
2.2.1 序列分析
2.2.2 DNABARCODING GAP分析
2.2.3 物種鑒定成功率分析
2.3 討論
2.3.1 核基因片段比葉綠體基因片段更適合楊屬DNA條形碼研究
2.3.2 不同分析方法的鑒定效果比較
2.3.3 提高楊屬DNA條形碼鑒定效果的探討
3. 中國楊屬物種的分子系統(tǒng)學(xué)研究
3.1 材料與方法
3.1.1 材料與引物
3.1.2 實驗方法
3.2 結(jié)果
3.3 討論
4. 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
個人簡介
導(dǎo)師簡介
獲得成果目錄清單
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于葉綠體片段序列的楊屬系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系分析[J]. 員濤,李佳蔓,周安佩,顏璐茜,縱丹,李旦,何承忠. 植物生理學(xué)報. 2015(08)
[2]植物DNA條形碼、物種形成和分類學(xué)[J]. 劉建全. 生物多樣性. 2015(03)
[3]利用高通量測序分析青藏高原地區(qū)青楊的SSR和SNP特征[J]. 雷淑蕓,張發(fā)起,Khan Gulzar,王久利,劉海瑞,陳世龍. 林業(yè)科學(xué)研究. 2015(01)
[4]“中國珍稀瀕危植物DNA條形碼鑒定平臺”簡介[J]. 李長昊,程濤,董文攀,周世良. 生物多樣性. 2014(01)
[5]生命條形碼與生命之樹[J]. 陳之端,李德銖. 植物分類與資源學(xué)報. 2013(06)
[6]結(jié)合葉綠體和核DNA序列變異可提高云杉屬物種的分子鑒別率[J]. 鄒嘉賓,王茜,李麗麗,劉建全. 植物分類與資源學(xué)報. 2013(03)
[7]中藥材DNA條形碼分子鑒定指導(dǎo)原則[J]. 陳士林,姚輝,韓建萍,辛天怡,龐曉慧,石林春,羅焜,宋經(jīng)元,侯典云,石上梅,錢忠直. 中國中藥雜志. 2013(02)
[8]新一代植物志:iFlora[J]. 李德銖,王雨華,伊廷雙,王紅,高連明,楊俊波. 植物分類與資源學(xué)報. 2012(06)
[9]關(guān)于植物DNA條形碼研究技術(shù)規(guī)范[J]. 高連明,劉杰,蔡杰,楊俊波,張挺,李德銖. 植物分類與資源學(xué)報. 2012(06)
[10]Comparison of phylobetadiversity indices based on community data from Gutianshan forest plot[J]. FENG Gang 1,2,ZHANG JinLong 1,2,PEI NanCai 3,RAO MiDe 4,MI XiangCheng 1,REN HaiBao 1 & MA KePing 1 1 State Key Laboratory of Vegetation and Environmental Change,Institute of Botany,Chinese Academy of Sciences,Beijing 100093,China;2 Graduate University of Chinese Academy of Sciences,Beijing 100049,China;3 Research Institute of Tropical Forestry,Chinese Academy of Forestry,Guangzhou 510520,China;4 College of Chemistry and Life Sciences,Zhejiang Normal University,Jinhua 321004,China. Chinese Science Bulletin. 2012(06)
博士論文
[1]楊屬分子系統(tǒng)發(fā)育及三個山楊物種的生物地理學(xué)研究[D]. 杜淑輝.中國林業(yè)科學(xué)研究院 2014
碩士論文
[1]基于DNA條形碼的系統(tǒng)發(fā)生樹構(gòu)建[D]. 莫瑞峰.吉林大學(xué) 2014
[2]基于基因組條形碼可視化的分枝桿菌的分子進(jìn)化的初步研究[D]. 張瑩.吉林大學(xué) 2013
[3]基于ISSR與ITS序列分析四川鄉(xiāng)土楊屬植物的親緣關(guān)系[D]. 王明福.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[4]DNA條形碼在天南星科芋族植物研究中的應(yīng)用[D]. 劉宇婧.中央民族大學(xué) 2011
[5]四川鄉(xiāng)土楊屬植物的系統(tǒng)發(fā)育與親緣關(guān)系研究[D]. 丁云海.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[6]姜科藥用植物DNA條形碼鑒定研究[D]. 石林春.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2009
本文編號:3253793
【文章來源】:北京林業(yè)大學(xué)北京市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:70 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
1. 引言
1.1 DNA條形碼概述
1.1.1 DNA條形碼研究歷史
1.1.2 DNA條形碼技術(shù)規(guī)范
1.1.3 影響植物DNA條形碼物種分辨率的因素
1.1.4 植物DNA條形碼的展望
1.2 研究對象概述
1.2.1 中國楊屬植物概述
1.2.2 楊屬的分子系統(tǒng)學(xué)研究進(jìn)展
1.2.3 研究目的和意義
2. 中國楊屬部分物種的DNA條形碼研究
2.1 材料與方法
2.1.1 材料
2.1.2 實驗方法
2.2 結(jié)果
2.2.1 序列分析
2.2.2 DNABARCODING GAP分析
2.2.3 物種鑒定成功率分析
2.3 討論
2.3.1 核基因片段比葉綠體基因片段更適合楊屬DNA條形碼研究
2.3.2 不同分析方法的鑒定效果比較
2.3.3 提高楊屬DNA條形碼鑒定效果的探討
3. 中國楊屬物種的分子系統(tǒng)學(xué)研究
3.1 材料與方法
3.1.1 材料與引物
3.1.2 實驗方法
3.2 結(jié)果
3.3 討論
4. 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
個人簡介
導(dǎo)師簡介
獲得成果目錄清單
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于葉綠體片段序列的楊屬系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系分析[J]. 員濤,李佳蔓,周安佩,顏璐茜,縱丹,李旦,何承忠. 植物生理學(xué)報. 2015(08)
[2]植物DNA條形碼、物種形成和分類學(xué)[J]. 劉建全. 生物多樣性. 2015(03)
[3]利用高通量測序分析青藏高原地區(qū)青楊的SSR和SNP特征[J]. 雷淑蕓,張發(fā)起,Khan Gulzar,王久利,劉海瑞,陳世龍. 林業(yè)科學(xué)研究. 2015(01)
[4]“中國珍稀瀕危植物DNA條形碼鑒定平臺”簡介[J]. 李長昊,程濤,董文攀,周世良. 生物多樣性. 2014(01)
[5]生命條形碼與生命之樹[J]. 陳之端,李德銖. 植物分類與資源學(xué)報. 2013(06)
[6]結(jié)合葉綠體和核DNA序列變異可提高云杉屬物種的分子鑒別率[J]. 鄒嘉賓,王茜,李麗麗,劉建全. 植物分類與資源學(xué)報. 2013(03)
[7]中藥材DNA條形碼分子鑒定指導(dǎo)原則[J]. 陳士林,姚輝,韓建萍,辛天怡,龐曉慧,石林春,羅焜,宋經(jīng)元,侯典云,石上梅,錢忠直. 中國中藥雜志. 2013(02)
[8]新一代植物志:iFlora[J]. 李德銖,王雨華,伊廷雙,王紅,高連明,楊俊波. 植物分類與資源學(xué)報. 2012(06)
[9]關(guān)于植物DNA條形碼研究技術(shù)規(guī)范[J]. 高連明,劉杰,蔡杰,楊俊波,張挺,李德銖. 植物分類與資源學(xué)報. 2012(06)
[10]Comparison of phylobetadiversity indices based on community data from Gutianshan forest plot[J]. FENG Gang 1,2,ZHANG JinLong 1,2,PEI NanCai 3,RAO MiDe 4,MI XiangCheng 1,REN HaiBao 1 & MA KePing 1 1 State Key Laboratory of Vegetation and Environmental Change,Institute of Botany,Chinese Academy of Sciences,Beijing 100093,China;2 Graduate University of Chinese Academy of Sciences,Beijing 100049,China;3 Research Institute of Tropical Forestry,Chinese Academy of Forestry,Guangzhou 510520,China;4 College of Chemistry and Life Sciences,Zhejiang Normal University,Jinhua 321004,China. Chinese Science Bulletin. 2012(06)
博士論文
[1]楊屬分子系統(tǒng)發(fā)育及三個山楊物種的生物地理學(xué)研究[D]. 杜淑輝.中國林業(yè)科學(xué)研究院 2014
碩士論文
[1]基于DNA條形碼的系統(tǒng)發(fā)生樹構(gòu)建[D]. 莫瑞峰.吉林大學(xué) 2014
[2]基于基因組條形碼可視化的分枝桿菌的分子進(jìn)化的初步研究[D]. 張瑩.吉林大學(xué) 2013
[3]基于ISSR與ITS序列分析四川鄉(xiāng)土楊屬植物的親緣關(guān)系[D]. 王明福.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[4]DNA條形碼在天南星科芋族植物研究中的應(yīng)用[D]. 劉宇婧.中央民族大學(xué) 2011
[5]四川鄉(xiāng)土楊屬植物的系統(tǒng)發(fā)育與親緣關(guān)系研究[D]. 丁云海.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[6]姜科藥用植物DNA條形碼鑒定研究[D]. 石林春.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2009
本文編號:3253793
本文鏈接:http://sikaile.net/nykjlw/lylw/3253793.html
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