林木分子育種研究的基因組學(xué)信息資源述評(píng)
發(fā)布時(shí)間:2021-04-25 07:44
分子育種是指利用與性狀相關(guān)的DNA標(biāo)記進(jìn)行選育,也稱標(biāo)記輔助選擇或標(biāo)記輔助育種,廣義上還包括基因工程育種和基因組學(xué)輔助育種。林木分子育種為早期選擇和加速育種提供了極具潛力的高效手段。筆者對(duì)林木分子育種研究的基因組學(xué)信息資源進(jìn)行了進(jìn)展綜述和前景展望。近30年來,林木分子標(biāo)記技術(shù)從早期的低通量方法發(fā)展到目前基于微陣列芯片和新一代測(cè)序的高通量技術(shù),如測(cè)序分型、轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、重測(cè)序、擴(kuò)增子測(cè)序和外顯子組測(cè)序等,并廣泛用于連鎖作圖、關(guān)聯(lián)分析和基因組選擇等林木性狀相關(guān)的DNA變異檢測(cè)研究。隨著2006年毛果楊基因組序列的發(fā)表,已有50余個(gè)樹種完成了基因組測(cè)序;谶B鎖作圖和關(guān)聯(lián)研究檢測(cè)了林木10余個(gè)屬生長(zhǎng)、材性和抗逆及非木質(zhì)產(chǎn)品品質(zhì)等性狀相關(guān)的大量基因組位點(diǎn),主要趨勢(shì)表現(xiàn)為:①表型廣泛,涵蓋經(jīng)濟(jì)性狀、生理指標(biāo)和代謝成分等;②標(biāo)記數(shù)量成千上萬甚至上百萬,覆蓋全基因組;③轉(zhuǎn)錄組和降解組等多組學(xué)的分子變異開始應(yīng)用;④利用大群體以提高位點(diǎn)檢測(cè)的精度;⑤重視環(huán)境的影響,大田試驗(yàn)設(shè)置多個(gè)地點(diǎn),解析QTL與環(huán)境、年份的互作效應(yīng);⑥結(jié)合參考基因組序列和/或轉(zhuǎn)錄組差異表達(dá)基因進(jìn)一步挖掘性狀相關(guān)的候選基因,建立了桉屬、...
【文章來源】:南京林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2020,44(04)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:11 頁
【文章目錄】:
1 林木分子育種研究歷程
2 高通量的分子標(biāo)記檢測(cè)技術(shù)
3 性狀相關(guān)的基因組位點(diǎn)
4 其他基因組學(xué)相關(guān)資源
5 林木分子育種的成效和挑戰(zhàn)
5.1 林木分子育種的成效
5.2 林木分子育種面臨的挑戰(zhàn)
6 展望
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Detection of QTL(quantitative trait loci) associated with wood density by evaluating genetic structure and linkage disequilibrium of teak[J]. Vivek Vaishnav,Shamim Akhtar Ansari. Journal of Forestry Research. 2019(06)
[2]全基因組測(cè)序技術(shù)研究及其在木本植物中的應(yīng)用[J]. 劉海琳,尹佟明. 南京林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2018(05)
[3]赤桉抗風(fēng)和生長(zhǎng)性狀的SSR關(guān)聯(lián)分析[J]. 尚秀華,張沛健,謝耀堅(jiān),羅建中,李超,吳志華. 南京林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2018(04)
[4]細(xì)葉桉(Eucalyptustereticornis)早期生長(zhǎng)的SSR標(biāo)記關(guān)聯(lián)分析[J]. 宋志姣,翁啟杰,周長(zhǎng)品,李發(fā)根,李梅,楊合宇,盧萬鴻,羅建中,甘四明. 分子植物育種. 2016(01)
[5]火炬松生長(zhǎng)和松脂性狀相關(guān)候選基因的單核苷酸多樣性分析[J]. 楊會(huì)肖,劉天頤,徐斌,劉純鑫,王金榜,黃少偉. 華南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2016(01)
[6]桉樹扦插生根和生長(zhǎng)性狀的QTL定位[J]. 于曉麗,李發(fā)根,翁啟杰,周長(zhǎng)品,甘四明. 林業(yè)科學(xué)研究. 2011(02)
本文編號(hào):3159005
【文章來源】:南京林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2020,44(04)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:11 頁
【文章目錄】:
1 林木分子育種研究歷程
2 高通量的分子標(biāo)記檢測(cè)技術(shù)
3 性狀相關(guān)的基因組位點(diǎn)
4 其他基因組學(xué)相關(guān)資源
5 林木分子育種的成效和挑戰(zhàn)
5.1 林木分子育種的成效
5.2 林木分子育種面臨的挑戰(zhàn)
6 展望
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Detection of QTL(quantitative trait loci) associated with wood density by evaluating genetic structure and linkage disequilibrium of teak[J]. Vivek Vaishnav,Shamim Akhtar Ansari. Journal of Forestry Research. 2019(06)
[2]全基因組測(cè)序技術(shù)研究及其在木本植物中的應(yīng)用[J]. 劉海琳,尹佟明. 南京林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2018(05)
[3]赤桉抗風(fēng)和生長(zhǎng)性狀的SSR關(guān)聯(lián)分析[J]. 尚秀華,張沛健,謝耀堅(jiān),羅建中,李超,吳志華. 南京林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2018(04)
[4]細(xì)葉桉(Eucalyptustereticornis)早期生長(zhǎng)的SSR標(biāo)記關(guān)聯(lián)分析[J]. 宋志姣,翁啟杰,周長(zhǎng)品,李發(fā)根,李梅,楊合宇,盧萬鴻,羅建中,甘四明. 分子植物育種. 2016(01)
[5]火炬松生長(zhǎng)和松脂性狀相關(guān)候選基因的單核苷酸多樣性分析[J]. 楊會(huì)肖,劉天頤,徐斌,劉純鑫,王金榜,黃少偉. 華南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2016(01)
[6]桉樹扦插生根和生長(zhǎng)性狀的QTL定位[J]. 于曉麗,李發(fā)根,翁啟杰,周長(zhǎng)品,甘四明. 林業(yè)科學(xué)研究. 2011(02)
本文編號(hào):3159005
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