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白樺WRKY家族基因克隆及表達(dá)分析

發(fā)布時間:2021-03-20 11:29
  WRKY家族基因是近些年來研究較為廣泛的一類植物轉(zhuǎn)錄因子,它在高等植物中存在較廣,在低等植物中很少發(fā)現(xiàn)。WRKY家族成員不僅可以參與植物的多種生物學(xué)過程,如代謝調(diào)控、形態(tài)建成、種子萌發(fā)等,在生物和非生物脅迫條件下也會不同程度被誘導(dǎo),表明了在植物防衛(wèi)反應(yīng)中WRKY蛋白扮演著不可或缺的角色。本研究克隆白樺WRKY家族基因及其啟動子,研究其表達(dá)特性,篩選和抗逆性及材性相關(guān)的WRKY家族成員,進(jìn)行功能研究,為林木分子生物學(xué)提供基礎(chǔ)理論,為培育速生、優(yōu)質(zhì)、高抗白樺新品種提供材料。本研究在前期構(gòu)建的白樺轉(zhuǎn)錄組中查找到131條WRKY基因,利用NCBI網(wǎng)站中的blastx程序進(jìn)行比對分析,最終確定37條具有完整開放讀碼框(ORF)的白樺WRKY基因序列,利用PCR技術(shù)進(jìn)行擴(kuò)增,成功克隆得到20條白樺WRKY基因,并對其進(jìn)行了生物信息學(xué)分析。結(jié)果表明它們都含有高度保守的WRKY氨基酸結(jié)構(gòu)域,并且很多都與擬南芥中的AtWRKY遺傳進(jìn)化關(guān)系較近。利用實(shí)時熒光定量PCR技術(shù)研究了白樺WRKY家族基因在白樺不同組織及不同非生物脅迫下不同時間點(diǎn)的基因表達(dá)模式,結(jié)果表明這些基因在不同組織中的表達(dá)是具有特異性的,在... 

【文章來源】:東北林業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:86 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

白樺WRKY家族基因克隆及表達(dá)分析


圖2-1白樺WRKY家族基因保守區(qū)預(yù)測??表2-6白樺WRKY家族基因蛋白質(zhì)性質(zhì)??

序列,基因系,白樺,家族


?東北林業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文???2.3.2.4白樺WRKY家族基因系統(tǒng)進(jìn)化分析??此外,還對20條白樺辦基因推導(dǎo)的蛋白序列和71條擬南芥A奶況r基因??的蛋白序列進(jìn)行了系統(tǒng)進(jìn)化樹分析(圖2-3)。結(jié)果表明你與的遺傳??進(jìn)化關(guān)系較近;卵/股尺}35與^4/哪尤7¥4的遺傳進(jìn)化關(guān)系較近;你/膽尤725與??/1/W7?AT57的遺傳進(jìn)化關(guān)系較近;辦/^iQ72與的遺傳進(jìn)化關(guān)系較近;??%脈尺與乂爾尺削的遺傳進(jìn)化關(guān)系較近;辦脈燈25與J戯燈27的遺傳進(jìn)化??關(guān)系較近;印/階?尤725與淪的遺傳進(jìn)化關(guān)系較近;辦/階?尺}^與淪奶?KF(55的??遺傳進(jìn)化關(guān)系較近;辦/階?尤7(5與A階?/075的遺傳進(jìn)化關(guān)系較近。??__??AtWRKY74?^?H?L—CZZI—:——AtWRKY57??°?5?°??圖2-3白樺WRKY家族基因系統(tǒng)進(jìn)化分析??-30-??

電泳圖,白樺,野生型,電泳圖


2白樺WRKY家族基因克隆及表達(dá)分析??2.3.3白樺WRKY家族基因響應(yīng)非生物脅迫研究??以未脅迫處理的野生型白樺為對照,對用200?mmol/L?NaCl和300?mmol/L甘露醇??(Mannitol)分別脅迫處理6?h、12?h、24?h和48?h四個不同時間點(diǎn)的20條白樺財(cái)夂F??基因的表達(dá)量進(jìn)行分析,結(jié)果見圖2-5。結(jié)果顯示在20條白樺陳火F基因中,只有??辦/的?尺汾基因在兩種脅迫的不同時間點(diǎn)均上調(diào)表達(dá),其余19條白樺基因在各??個時間點(diǎn)均下調(diào)表達(dá)。在200?mmol/L?NaCl的脅迫處理中,20條白樺WRKY家族基因??隨著脅迫處理時間的增長,其基因表達(dá)量變化的總體表達(dá)趨勢是先下降后又有所恢復(fù),??在脅迫處理24?h左右達(dá)到其表達(dá)量的最低值。在300?mmol/L?Mannitol的脅迫處理中,??20條白樺WRKY家族基因隨著脅迫處理時間的增長,其基因表達(dá)量變化的總體表達(dá)趨??勢表現(xiàn)為有所恢復(fù)而后繼續(xù)下降,在脅迫處理6?h左右表達(dá)量最低。除此之外還可以看??出,基因在兩種脅迫處理的各個時間點(diǎn)表達(dá)量相對穩(wěn)定,差異不大,且在20??條白樺基因中下調(diào)表達(dá)最為明顯。??圖2-4脅迫處理后白樺材料RNA提収檢測電泳圖??注:A:未處理野生型白樺RNA;?B:?200?mmol/L?NaC丨脅迫處理6?h后白樺RNA;?C:?200?mmol/L??NaCl?脅迫處理?12?h?后白樺?RNA;?D:?200?mmol/L?NaCl?脅迫處理?24?h?后白樺?RNA;?E:?200?m.mo.l/L??NaC丨脅迫處理48?h后白樺RNA;?F:?300?mmol/L?Mannito丨脅迫處理6?h后白樺RNA;

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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博士論文
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[2]平榛WRKY轉(zhuǎn)錄因子的克隆與功能鑒定[D]. 趙天田.中國林業(yè)科學(xué)研究院 2012
[3]WRKY基因家族的進(jìn)化及水稻W(wǎng)RKY基因表達(dá)譜的研究[D]. 吳坤陸.浙江大學(xué) 2005

碩士論文
[1]棉花WRKY轉(zhuǎn)錄因子GhWRKY39的分離及功能研究[D]. 史偉娜.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[2]毛竹抗逆相關(guān)基因PeZFP和PeMYB基因的克隆及PeZFP基因功能驗(yàn)證[D]. 楊麗.浙江農(nóng)林大學(xué) 2011
[3]轉(zhuǎn)基因白樺中外源基因整合表達(dá)穩(wěn)定性與遺傳變異分析[D]. 曾凡鎖.東北林業(yè)大學(xué) 2005



本文編號:3090926

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