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砂生槐群體遺傳特性與代表群體表型性狀研究

發(fā)布時(shí)間:2021-01-19 11:56
  砂生槐(Sophora moorcroftiana)是西藏雅魯藏布江流域特有的多年生豆科矮灌木,具有無(wú)可替代的經(jīng)濟(jì)和生態(tài)價(jià)值。一些研究發(fā)現(xiàn),在雅魯藏布江流域不同海拔生長(zhǎng)的砂生槐群體在表型上有明顯的差異,但對(duì)這些差異群體的遺傳學(xué)研究卻很少。對(duì)不同砂生槐天然群體進(jìn)行遺傳特性研究,了解不同地區(qū)砂生槐群體間的遺傳結(jié)構(gòu)及其形成的驅(qū)動(dòng)因素和群體的擴(kuò)展方向和方式,評(píng)價(jià)具有代表性的群體的表型特性,對(duì)于砂生槐的開(kāi)發(fā)、利用以及后續(xù)研究尤為重要。本研究采用高通量基因分型測(cè)序技術(shù)(Genotyping-by-Sequencing)對(duì)來(lái)自不同地理位置的15個(gè)群體的225個(gè)個(gè)體進(jìn)行了簡(jiǎn)化基因組測(cè)序,平均每個(gè)個(gè)體得到了大小為2,828.95 M的序列,鑒定出了2,394,536個(gè)單核苷酸多態(tài)性(SNP),通過(guò)群體遺傳多樣性評(píng)估、系統(tǒng)發(fā)育分析、主成分分析和群體遺傳結(jié)構(gòu)分析,了解了每個(gè)群體以及亞群的遺傳特性。為了探究不同亞群的表型性狀和遺傳特性之間的關(guān)聯(lián)、選擇出具有沙化治理及引種潛力優(yōu)勢(shì)群體,研究選取了3個(gè)代表性群體(Pop 1、Pop 7和Pop 15),并對(duì)這3個(gè)代表性群體做了以下表型性狀研究:測(cè)定了5個(gè)種實(shí)性狀指... 

【文章來(lái)源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】:51 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

砂生槐群體遺傳特性與代表群體表型性狀研究


砂生槐樣本群體在雅魯藏布江流域的地理分布

砂生槐,系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹(shù),外群,日喀則群


個(gè)體 1~15)和 Pop 7(個(gè)體 16~30)相比,位于同一流域(拉薩河)上游 166~180)與其它兩個(gè)群體距離較遠(yuǎn)。在日喀則群體中,Pop 6(個(gè)體 1其它群體分開(kāi)(包括 Pop 5、Pop 3、Pop 4、Pop 1 和 Pop 2),其次為 P~210)。Pop 1 接近 Pop 2 而 Pop 3 接近 Pop 4?偟膩(lái)說(shuō),林芝群體在與其他群體親緣關(guān)系最遠(yuǎn),接下來(lái)是山南、拉薩群體,然后是 Pop 7、日喀則群體。

砂生槐,群體遺傳結(jié)構(gòu),祖先,遺傳信息


顯示了當(dāng)遺傳分類(lèi)亞群數(shù)為 4 和 5 時(shí) 225 個(gè)砂生槐個(gè)體的聚類(lèi)信息。當(dāng)樣本四個(gè)分類(lèi)群時(shí),Pop 14 和 Pop 15 的遺傳信息來(lái)自祖先 I,Pop 12 大約 70%的遺來(lái)自于祖先 I;Pop 9、Pop 10 和 Pop 11 來(lái)自祖先 II;Pop 7 和 Pop 8 有大約一遺傳信息來(lái)自祖先 II,剩下的一半遺傳信息來(lái)自祖先 III;日喀則群體 Pop 1、Pop 3、Pop 4、Pop 5 和 Pop 6 的遺傳信息都來(lái)自祖先 III;只有 Pop 13 的遺傳信于祖先 IV。4 個(gè)遺傳分類(lèi)群的聚類(lèi)情況大致符合 225 個(gè)砂生槐樣本的地理分布分日喀則個(gè)體分為一個(gè)亞群體;Pop 7、Pop 8 位于日喀則亞群和拉薩和山南混體之間;拉薩和山南混合群體;林芝低海拔;林芝工布江達(dá)縣)。當(dāng)所有樣本 5 個(gè)分類(lèi)群時(shí),在 4 個(gè)分類(lèi)群中本為同一分類(lèi)群 II(Pop 9、Pop 10、Pop 11)p 9 被分為另一個(gè)分類(lèi)群,Pop 7 和 Pop 8 的遺傳信息仍然來(lái)自兩個(gè)祖先,但原分類(lèi)群 II(Pop 9、Pop 10 和 Pop 11)的遺傳信息被計(jì)算為來(lái)自拉薩墨竹的 Po喀則群體中的 Pop 5 和 Pop 6 也包含來(lái)自 Pop 9 的遺傳信息。

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[3]SNP分子標(biāo)記及其在木本植物遺傳育種的應(yīng)用[J]. 周琳,段玉,文博,馬媛春,朱旭君,王玉花,房婉萍.  亞熱帶植物科學(xué). 2018(02)
[4]雅魯藏布江流域水文分區(qū)研究[J]. 姬海娟,劉金濤,李瑤,江玉吉,汪銀奎.  水文. 2018(02)
[5]應(yīng)用FastTree2.1.8快速構(gòu)建HIV-1 pol區(qū)基因的最大似然系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)[J]. 張亞麗,韓志剛,吳昊,夏云.  中國(guó)艾滋病性病. 2017(08)
[6]鉛脅迫對(duì)幾種喬木種子萌發(fā)及活力的影響研究[J]. 宋清玉,王進(jìn)鑫,楊楠.  西北林學(xué)院學(xué)報(bào). 2017(04)
[7]藥用植物研究中的分子標(biāo)記技術(shù)應(yīng)用進(jìn)展[J]. 陳紅波,余金芮,楊春先,錢(qián)剛.  湖北農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(13)
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[10]植物群體遺傳進(jìn)化研究方法探析[J]. 郎娜,劉之慧,宋艱難,董清華.  北京農(nóng)學(xué)院學(xué)報(bào). 2016(02)

碩士論文
[1]西藏砂生槐的抗旱性研究[D]. 尼瑪曲珍.西藏大學(xué) 2009



本文編號(hào):2986942

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