基于DNA技術(shù)識(shí)別樟科木材
發(fā)布時(shí)間：2021-01-17 23:02
樟科Lauraceae木材解剖結(jié)構(gòu)相似,傳統(tǒng)形態(tài)解剖學(xué)方法很難做出準(zhǔn)確鑒定,基于分子標(biāo)記的樹種鑒定技術(shù)準(zhǔn)確而且高效。本研究通過增加木粉質(zhì)量與DNA緩沖液體積比、溫浴時(shí)間等改良木質(zhì)部基因組DNA提取;用改良CTAB-SDS法、CTAB法和試劑盒法提取樟科木質(zhì)部DNA,篩選了木質(zhì)部DNA提取方法,初步建立楠屬木材DNA提取技術(shù)體系;利用ISSR和RAPD技術(shù)對樟科16種192株木質(zhì)部DNA進(jìn)行擴(kuò)增,構(gòu)建多態(tài)性鑒別圖譜,比較兩分子標(biāo)記差別;DNA條形碼對葉綠體基因psb A-trnH間隔區(qū)DNA克隆測序,通過序列差異區(qū)別16樹種,構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹。具體結(jié)果如下:（1）通過增加木粉質(zhì)量與DNA緩沖液體積比、溫浴時(shí)間,改變緩沖液成分等參數(shù),將DNA樣品OD260/280值從1.1-1.5提升到1.8-2.0,提高了DNA純度。（2）3種方法提取的DNA質(zhì)量差別明顯,改良CTAB-SDS法最適合提取楠屬木質(zhì)部DNA。DNA濃度:改良CTAB-SDS法最高、試劑盒法最低;DNA純度:改良CTAB-SDS法和CTAB法提取的DNA樣品純度高,OD260/值為1.7-2.0,滿足擴(kuò)增要求,試劑盒法提取的D...
【文章來源】：南京林業(yè)大學(xué)江蘇省
【文章頁數(shù)】：65 頁
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【部分圖文】：
圖2-1臺(tái)式冷凍離心機(jī)
3、梯度 PCR 擴(kuò)增儀（9700，圖 2-3）：設(shè)定 PCR 的程序及其擴(kuò)增；4、瓊脂糖水平電泳儀（圖 2-4）及全自動(dòng)凝膠成像儀（Gel X 1650，圖 2-5）：檢測分析 PCR 擴(kuò)增結(jié)果及觀察、拍照、保存；5、電熱恒溫水槽及震蕩型恒溫金屬�。禾囟囟认聹卦≡噭�6、磁力攪拌器（Wise Stir）及渦旋機(jī)：用于混勻試劑；7、電子天平：精度 0.0001g；8、-80℃超低溫冰箱（Kaltis）：貯藏實(shí)驗(yàn)材料和試劑；9、高溫高壓滅菌鍋（Hirayama）、制冰機(jī)（Sanyo）、微波爐（Midea）、恒溫培養(yǎng)箱（Binder）、搖床（IKAKS 4000）、移液槍（Eppendorf）及槍頭、烘箱、研缽及研棒量筒、玻璃杯、容量瓶。
3、梯度 PCR 擴(kuò)增儀（9700，圖 2-3）：設(shè)定 PCR 的程序及其擴(kuò)增；4、瓊脂糖水平電泳儀（圖 2-4）及全自動(dòng)凝膠成像儀（Gel X 1650，圖 2-5）：檢測分析 PCR 擴(kuò)增結(jié)果及觀察、拍照、保存；5、電熱恒溫水槽及震蕩型恒溫金屬�。禾囟囟认聹卦≡噭�6、磁力攪拌器（Wise Stir）及渦旋機(jī)：用于混勻試劑；7、電子天平：精度 0.0001g；8、-80℃超低溫冰箱（Kaltis）：貯藏實(shí)驗(yàn)材料和試劑；9、高溫高壓滅菌鍋（Hirayama）、制冰機(jī)（Sanyo）、微波爐（Midea）、恒溫培養(yǎng)箱（Binder）、搖床（IKAKS 4000）、移液槍（Eppendorf）及槍頭、烘箱、研缽及研棒量筒、玻璃杯、容量瓶。
【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]3種楠木DNA提取及其ISSR標(biāo)記鑒別[J]. 王英,駱嘉言,鐘文翰,石江濤,樊帥. 四川農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2016(04)
[2]太湖洞庭地區(qū)紅桔種質(zhì)資源基因組提取及ISSR親緣關(guān)系分析[J]. 朱沛煌,周坤杰,郭天瑋,儲(chǔ)春榮,季孔庶. 林業(yè)科技開發(fā). 2015(05)
[3]不同產(chǎn)地貓豆遺傳多樣性的ISSR分析[J]. 邱亞玲,秦民堅(jiān),戴軼群,及佳,謝國勇,吳剛,朱艷. 中國實(shí)驗(yàn)方劑學(xué)雜志. 2015(06)
[4]華山松針葉基因組DNA不同提取方法比較[J]. 謝冬梅,陳國明,何德,李翠新. 廣西林業(yè)科學(xué). 2014(04)
[5]玉米種質(zhì)材料遺傳多樣性的ISSR分析[J]. 祁麗婷,李中青,趙晉峰,李齊霞,李顏芳,王瑞,孫萬榮,王敏,王楓葉. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(34)
[6]降香黃檀木材DNA提取及rDNA-ITS序列條形碼分子鑒定[J]. 余敏,張浩,劉盛全,金青,李大周. 林產(chǎn)化學(xué)與工業(yè). 2014(05)
[7]28個(gè)果桑品種（系）的遺傳多樣性ISSR分析[J]. 黃蓋群,佟萬紅,危玲,殷浩,何寧佳,劉剛,鄭繼川,姚永權(quán),李永遠(yuǎn). 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2014(05)
[8]滇西南地區(qū)樟科17種木材解剖特征研究[J]. 孫瑾,王曉靜,王飛,徐恩光,高振忠. 華南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2014(05)
[9]美洲黑楊新無性系的ISSR鑒別及SCAR標(biāo)記轉(zhuǎn)化[J]. 李薇,王永進(jìn),樊軍鋒. 西北林學(xué)院學(xué)報(bào). 2014(04)
[10]25份槭屬優(yōu)良種質(zhì)資源親緣關(guān)系的ISSR分析[J]. 林樂靜,林立,祝志勇. 廣西植物. 2015(01)
博士論文
[1]基于DNA條形碼的瀕危木材識(shí)別技術(shù)研究[D]. 焦立超.中國林業(yè)科學(xué)研究院 2015
碩士論文
[1]浙江楠EST-SSR標(biāo)記開發(fā)及天然種群遺傳多樣性研究[D]. 丁亞軍.浙江農(nóng)林大學(xué) 2014
[2]水杉木材DNA提取及DNA條形碼分析[D]. 楊路路.湖北大學(xué) 2011
[3]樟科植物DNA Barcode及香樟系統(tǒng)地理學(xué)的初步研究[D]. 高大偉.華東師范大學(xué) 2008
本文編號(hào)：2983758
【文章來源】：南京林業(yè)大學(xué)江蘇省
【文章頁數(shù)】：65 頁
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【部分圖文】：
圖2-1臺(tái)式冷凍離心機(jī)
3、梯度 PCR 擴(kuò)增儀（9700，圖 2-3）：設(shè)定 PCR 的程序及其擴(kuò)增；4、瓊脂糖水平電泳儀（圖 2-4）及全自動(dòng)凝膠成像儀（Gel X 1650，圖 2-5）：檢測分析 PCR 擴(kuò)增結(jié)果及觀察、拍照、保存；5、電熱恒溫水槽及震蕩型恒溫金屬�。禾囟囟认聹卦≡噭�6、磁力攪拌器（Wise Stir）及渦旋機(jī)：用于混勻試劑；7、電子天平：精度 0.0001g；8、-80℃超低溫冰箱（Kaltis）：貯藏實(shí)驗(yàn)材料和試劑；9、高溫高壓滅菌鍋（Hirayama）、制冰機(jī)（Sanyo）、微波爐（Midea）、恒溫培養(yǎng)箱（Binder）、搖床（IKAKS 4000）、移液槍（Eppendorf）及槍頭、烘箱、研缽及研棒量筒、玻璃杯、容量瓶。
3、梯度 PCR 擴(kuò)增儀（9700，圖 2-3）：設(shè)定 PCR 的程序及其擴(kuò)增；4、瓊脂糖水平電泳儀（圖 2-4）及全自動(dòng)凝膠成像儀（Gel X 1650，圖 2-5）：檢測分析 PCR 擴(kuò)增結(jié)果及觀察、拍照、保存；5、電熱恒溫水槽及震蕩型恒溫金屬�。禾囟囟认聹卦≡噭�6、磁力攪拌器（Wise Stir）及渦旋機(jī)：用于混勻試劑；7、電子天平：精度 0.0001g；8、-80℃超低溫冰箱（Kaltis）：貯藏實(shí)驗(yàn)材料和試劑；9、高溫高壓滅菌鍋（Hirayama）、制冰機(jī)（Sanyo）、微波爐（Midea）、恒溫培養(yǎng)箱（Binder）、搖床（IKAKS 4000）、移液槍（Eppendorf）及槍頭、烘箱、研缽及研棒量筒、玻璃杯、容量瓶。
【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]3種楠木DNA提取及其ISSR標(biāo)記鑒別[J]. 王英,駱嘉言,鐘文翰,石江濤,樊帥. 四川農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2016(04)
[2]太湖洞庭地區(qū)紅桔種質(zhì)資源基因組提取及ISSR親緣關(guān)系分析[J]. 朱沛煌,周坤杰,郭天瑋,儲(chǔ)春榮,季孔庶. 林業(yè)科技開發(fā). 2015(05)
[3]不同產(chǎn)地貓豆遺傳多樣性的ISSR分析[J]. 邱亞玲,秦民堅(jiān),戴軼群,及佳,謝國勇,吳剛,朱艷. 中國實(shí)驗(yàn)方劑學(xué)雜志. 2015(06)
[4]華山松針葉基因組DNA不同提取方法比較[J]. 謝冬梅,陳國明,何德,李翠新. 廣西林業(yè)科學(xué). 2014(04)
[5]玉米種質(zhì)材料遺傳多樣性的ISSR分析[J]. 祁麗婷,李中青,趙晉峰,李齊霞,李顏芳,王瑞,孫萬榮,王敏,王楓葉. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(34)
[6]降香黃檀木材DNA提取及rDNA-ITS序列條形碼分子鑒定[J]. 余敏,張浩,劉盛全,金青,李大周. 林產(chǎn)化學(xué)與工業(yè). 2014(05)
[7]28個(gè)果桑品種（系）的遺傳多樣性ISSR分析[J]. 黃蓋群,佟萬紅,危玲,殷浩,何寧佳,劉剛,鄭繼川,姚永權(quán),李永遠(yuǎn). 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2014(05)
[8]滇西南地區(qū)樟科17種木材解剖特征研究[J]. 孫瑾,王曉靜,王飛,徐恩光,高振忠. 華南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2014(05)
[9]美洲黑楊新無性系的ISSR鑒別及SCAR標(biāo)記轉(zhuǎn)化[J]. 李薇,王永進(jìn),樊軍鋒. 西北林學(xué)院學(xué)報(bào). 2014(04)
[10]25份槭屬優(yōu)良種質(zhì)資源親緣關(guān)系的ISSR分析[J]. 林樂靜,林立,祝志勇. 廣西植物. 2015(01)
博士論文
[1]基于DNA條形碼的瀕危木材識(shí)別技術(shù)研究[D]. 焦立超.中國林業(yè)科學(xué)研究院 2015
碩士論文
[1]浙江楠EST-SSR標(biāo)記開發(fā)及天然種群遺傳多樣性研究[D]. 丁亞軍.浙江農(nóng)林大學(xué) 2014
[2]水杉木材DNA提取及DNA條形碼分析[D]. 楊路路.湖北大學(xué) 2011
[3]樟科植物DNA Barcode及香樟系統(tǒng)地理學(xué)的初步研究[D]. 高大偉.華東師范大學(xué) 2008
本文編號(hào)：2983758
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