東北紅豆杉的譜系地理結(jié)構(gòu)研究
發(fā)布時間:2020-12-27 09:54
近年東北紅豆杉(Taxus cuspidata Sieb.et Zucc)遭受到了嚴(yán)重的人為破壞,自然種群數(shù)量銳減。了解東北紅豆杉自然種群的遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)對于評價和保護(hù)東北紅豆杉的自然種群資源具有重要的理論價值和實踐意義。東北紅豆杉是第三紀(jì)孑遺植物,研究其譜系地理可以為推測種群遺傳多樣性的形成機(jī)制和物種遷移演化歷史提供依據(jù)。本研究選用三個父性遺傳的葉綠體DNA片段和一個母性遺傳線粒體DNA片段作為遺傳標(biāo)記,以采集東北紅豆杉中國分布范圍25個居群共231個個體為研究材料,分析其居群遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu),從而推測居群歷史動態(tài),并為該物種的保護(hù)提供理論依據(jù)。研究發(fā)現(xiàn)東北紅豆杉居群具有較高的遺傳多樣性,聯(lián)合葉綠體序列分析得到14個葉綠體單倍型,總的葉綠體單倍型多態(tài)性(Hd)為0.86,總的核苷酸多態(tài)性(π)為2.5 × 10-4;線粒體基因片段只檢測出二種單倍型,單倍型多態(tài)性(Hd)為0.44,核苷酸多態(tài)性(i)為4.0 × 10-4。葉綠體數(shù)據(jù)分析結(jié)果顯示遺傳變異主要分布在居群內(nèi)(98.5%),單倍型數(shù)據(jù)分析得到的遺傳分化系數(shù)GsT為0.10,與Nsr(0.09)相比沒有顯著差異說明東...
【文章來源】:北京林業(yè)大學(xué)北京市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:71 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1-2東北紅豆杉自然地理分布(摘自吳榜華,1995)??Fig.?1-2?Natural?geographical?distribution?of?Z?cuspidate?(Wu,?1995)??
?東北紅豆杉的譜系地理結(jié)構(gòu)研究所有提取的DNA用超微量紫外分光光度計(NanoDrop?8000)測定OD260OD280的比值(當(dāng)A260/A280?=?1_8,表示DNA提取純度較高,若A260/A280?<?1.8表示總DNA中有蛋白污染,而A260/A280?>1.9,則樣品可能有RNA污染),再適量lkbDNA?Ladder?Marker同時在1%瓊脂糖凝膠中進(jìn)行電泳跑膠,凝膠成像(JY04S-3C)拍照,結(jié)果如下:??
d??圖2-3引物在東北紅豆杉中的PCR擴(kuò)增結(jié)果在瓊脂糖膠中的檢測??a:?^77//-;?認(rèn)4引物的擴(kuò)增效果;b:?引物的擴(kuò)增效果;??c:?/^D-^7?r引物的擴(kuò)增效果;d:?m必/4-5引物的擴(kuò)增效果??注:M代表Marker?(Marker?II?),數(shù)字1-24代表擴(kuò)增產(chǎn)物??Fig.?2-3?PCR?results?of?3?cpDNA?and?1?mtDNA?primers?used?in?this?study??a:?amplification?product?of?trnH-psbA?primer;?b:?amplification?product?of?/rwL-/'primer;??c:?amplification?product?ofpsbD-trnTprimer;?d:?amplification?product?oinad5/A-5?primer??Note:?M:?Marker?(Marker?II),?number?1-24:?PCR?product??2.1.2.4?PCR產(chǎn)物測序??根據(jù)測序結(jié)果選擇了四對多態(tài)性好且具有穩(wěn)定可靠突變位點的引物,基于上PCR反應(yīng)體系和程序,進(jìn)行批量擴(kuò)增,本研宄從采樣的25個種群,從中選取了?23個個體進(jìn)行批量擴(kuò)增,PCR產(chǎn)物用0.8%瓊脂糖電泳檢測,然后用北京擎科新業(yè)物技術(shù)公司(TsingKe,?Beijing,?China)的磁珠法進(jìn)行純化。實驗流程如下:??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]東北紅豆杉幼苗光合和熒光特性對不同光照條件的響應(yīng)[J]. 劉彤,崔海嬌,吳淑杰,祝佳媛,周志強(qiáng). 北京林業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2013(03)
[2]東北紅豆杉幼苗對不同水分條件的光合和生理響應(yīng)[J]. 徐博超,周志強(qiáng),李威,劉彤. 北京林業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2012(04)
[3]Phylogeography of Cyananthus delavayi(Campanulaceae) in Hengduan Mountains inferred from variation in nuclear and chloroplast DNA sequences[J]. Guo-Dong LI,Liang-Liang YUE,Hang SUN,Zi-Gang QIAN. Journal of Systematics and Evolution. 2012 (04)
[4]樹齡和性別對天然東北紅豆杉中紫杉醇及三尖杉寧堿質(zhì)量分?jǐn)?shù)的影響[J]. 劉彤,常醉,王洋,周志強(qiáng). 東北林業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2011(12)
[5]天然東北紅豆杉枝中紫杉醇和三尖杉寧堿含量變化特征[J]. 常醉,周志強(qiáng),夏春梅,劉彤. 北京林業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2012(02)
[6]種內(nèi)譜系地理學(xué)及在植物遺傳多樣性保護(hù)中的應(yīng)用[J]. 徐剛標(biāo). 中南林業(yè)科技大學(xué)學(xué)報. 2011(12)
[7]東北紅豆杉的繁育及養(yǎng)護(hù)技術(shù)研究[J]. 滕祥金,孫玉剛,曲線. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2009(12)
[8]葉籽銀杏trnS-trnG序列測定與分析[J]. 董雷雷,邢世巖,李際紅,王京梅. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2008(12)
[9]東北紅豆杉優(yōu)良無性系的篩選[J]. 張玉波,楊燕超,逄宏揚,李雪. 經(jīng)濟(jì)林研究. 2008(02)
[10]基于葉綠體DNA變異研究高山植物偏花報春的種內(nèi)譜系地理結(jié)構(gòu)(英文)[J]. 王鳳英,龔洵,胡啟明,郝剛. 植物分類學(xué)報. 2008(01)
本文編號:2941536
【文章來源】:北京林業(yè)大學(xué)北京市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:71 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1-2東北紅豆杉自然地理分布(摘自吳榜華,1995)??Fig.?1-2?Natural?geographical?distribution?of?Z?cuspidate?(Wu,?1995)??
?東北紅豆杉的譜系地理結(jié)構(gòu)研究所有提取的DNA用超微量紫外分光光度計(NanoDrop?8000)測定OD260OD280的比值(當(dāng)A260/A280?=?1_8,表示DNA提取純度較高,若A260/A280?<?1.8表示總DNA中有蛋白污染,而A260/A280?>1.9,則樣品可能有RNA污染),再適量lkbDNA?Ladder?Marker同時在1%瓊脂糖凝膠中進(jìn)行電泳跑膠,凝膠成像(JY04S-3C)拍照,結(jié)果如下:??
d??圖2-3引物在東北紅豆杉中的PCR擴(kuò)增結(jié)果在瓊脂糖膠中的檢測??a:?^77//-;?認(rèn)4引物的擴(kuò)增效果;b:?引物的擴(kuò)增效果;??c:?/^D-^7?r引物的擴(kuò)增效果;d:?m必/4-5引物的擴(kuò)增效果??注:M代表Marker?(Marker?II?),數(shù)字1-24代表擴(kuò)增產(chǎn)物??Fig.?2-3?PCR?results?of?3?cpDNA?and?1?mtDNA?primers?used?in?this?study??a:?amplification?product?of?trnH-psbA?primer;?b:?amplification?product?of?/rwL-/'primer;??c:?amplification?product?ofpsbD-trnTprimer;?d:?amplification?product?oinad5/A-5?primer??Note:?M:?Marker?(Marker?II),?number?1-24:?PCR?product??2.1.2.4?PCR產(chǎn)物測序??根據(jù)測序結(jié)果選擇了四對多態(tài)性好且具有穩(wěn)定可靠突變位點的引物,基于上PCR反應(yīng)體系和程序,進(jìn)行批量擴(kuò)增,本研宄從采樣的25個種群,從中選取了?23個個體進(jìn)行批量擴(kuò)增,PCR產(chǎn)物用0.8%瓊脂糖電泳檢測,然后用北京擎科新業(yè)物技術(shù)公司(TsingKe,?Beijing,?China)的磁珠法進(jìn)行純化。實驗流程如下:??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]東北紅豆杉幼苗光合和熒光特性對不同光照條件的響應(yīng)[J]. 劉彤,崔海嬌,吳淑杰,祝佳媛,周志強(qiáng). 北京林業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2013(03)
[2]東北紅豆杉幼苗對不同水分條件的光合和生理響應(yīng)[J]. 徐博超,周志強(qiáng),李威,劉彤. 北京林業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2012(04)
[3]Phylogeography of Cyananthus delavayi(Campanulaceae) in Hengduan Mountains inferred from variation in nuclear and chloroplast DNA sequences[J]. Guo-Dong LI,Liang-Liang YUE,Hang SUN,Zi-Gang QIAN. Journal of Systematics and Evolution. 2012 (04)
[4]樹齡和性別對天然東北紅豆杉中紫杉醇及三尖杉寧堿質(zhì)量分?jǐn)?shù)的影響[J]. 劉彤,常醉,王洋,周志強(qiáng). 東北林業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2011(12)
[5]天然東北紅豆杉枝中紫杉醇和三尖杉寧堿含量變化特征[J]. 常醉,周志強(qiáng),夏春梅,劉彤. 北京林業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2012(02)
[6]種內(nèi)譜系地理學(xué)及在植物遺傳多樣性保護(hù)中的應(yīng)用[J]. 徐剛標(biāo). 中南林業(yè)科技大學(xué)學(xué)報. 2011(12)
[7]東北紅豆杉的繁育及養(yǎng)護(hù)技術(shù)研究[J]. 滕祥金,孫玉剛,曲線. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2009(12)
[8]葉籽銀杏trnS-trnG序列測定與分析[J]. 董雷雷,邢世巖,李際紅,王京梅. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2008(12)
[9]東北紅豆杉優(yōu)良無性系的篩選[J]. 張玉波,楊燕超,逄宏揚,李雪. 經(jīng)濟(jì)林研究. 2008(02)
[10]基于葉綠體DNA變異研究高山植物偏花報春的種內(nèi)譜系地理結(jié)構(gòu)(英文)[J]. 王鳳英,龔洵,胡啟明,郝剛. 植物分類學(xué)報. 2008(01)
本文編號:2941536
本文鏈接:http://sikaile.net/nykjlw/lylw/2941536.html
最近更新
教材專著