巴西橡膠樹(shù)乳管細(xì)胞中MYB轉(zhuǎn)錄因子的鑒定與表達(dá)分析
【學(xué)位授予單位】:海南大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號(hào)】:S794.1
【圖文】:
邐巴西橡膠樹(shù)乳管細(xì)胞中MYB轉(zhuǎn)錄因子的鑒定與表達(dá)分析邐逡逑domain,包括激活結(jié)構(gòu)域和抑制結(jié)構(gòu)域)、寡聚化位點(diǎn)(Oligomerization邋site)以及核逡逑定位信號(hào)區(qū)(Nuclear邋localization邋signal,邋NLS)(孫麗芳等,2009;羅賽男等,2005)。逡逑一般依據(jù)DNA結(jié)構(gòu)域的保守性強(qiáng)度將轉(zhuǎn)錄因子分為Zinc-fmger邋(鋅指蛋白)、bHLH逡逑(堿性螺旋-環(huán)-螺旋)、bZIP邋(堿性亮氨酸拉鏈)、MADS-boxing蛋白、Homeodomain逡逑蛋白、HSP蛋白、MYB蛋白、MYC蛋白、AP2/REBP蛋白等不同類家族蛋白逡逑(Takatsuji邋et邋al.,1998;邋Riechmann邋et邋al.,2000)。Riechmann邋等證實(shí)各轉(zhuǎn)錄因子間既逡逑能相互協(xié)作又能相互影響(圖3)邋(Riechmannetal.,邋2000)。轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合特異性逡逑由DNA結(jié)構(gòu)域決定,而轉(zhuǎn)錄調(diào)控區(qū)則決定其與靶基因的作用強(qiáng)度。逡逑MYB邋(V-MY5邋avian邋myeloblastosis邋viral邋oncogene邋homolog)轉(zhuǎn)錄因子是高等植物逡逑轉(zhuǎn)錄因子中的一個(gè)超級(jí)家族,因其基因數(shù)量眾多,種類豐富和功能復(fù)雜,是當(dāng)前植物逡逑轉(zhuǎn)錄因子功能研究的主要成員之一。逡逑
通常根據(jù)高度保守DNA結(jié)合域的重復(fù)區(qū)數(shù)量和種類將MYB類轉(zhuǎn)錄因子分成4逡逑類即邋lR-MYB/MYB-related邋類、R2R3-MYB邋類、R1R2R3-MYB邋類、4R-MYB邋類逡逑(圖4)邋(Dubosetal.,2010)。高等動(dòng)物中主要存在3R-MYB類,而高等植物中是逡逑以R2R3-MYB類為主,由結(jié)構(gòu)域的不同導(dǎo)致MYB類轉(zhuǎn)錄因子的功能差異(Feller邋et逡逑al.,2011)。只含1個(gè)R單元的MYB蛋白通常是作為端粒結(jié)合蛋白,對(duì)染色體結(jié)構(gòu)逡逑的完整性具有支撐作用,如擬南芥的CPC1蛋白和玉米的IBP1蛋白。含有2個(gè)R結(jié)逡逑9逡逑
3.1.2邋Wb/MKSs結(jié)構(gòu)及同源性分析逡逑運(yùn)用在線軟件GSDS邋(http://gsds.cbi.pku.edu.cn/)對(duì)你的結(jié)構(gòu)進(jìn)行在線分逡逑析(圖5)。m/MF價(jià)所含外顯子數(shù)目差異明顯,其中:6個(gè)含有單外顯子,6個(gè)含逡逑有2個(gè)外顯子;17個(gè)含有3個(gè)外顯子;1個(gè)含有4個(gè)外顯子;其余的含外逡逑顯子數(shù)目均超過(guò)5個(gè),其中外顯子數(shù)目高達(dá)15個(gè)。結(jié)合冊(cè)/MT價(jià)聚類分逡逑析發(fā)現(xiàn),所含外顯子數(shù)目相同或相近的/?/_,其親緣關(guān)系親近。推導(dǎo)的HblMYBs逡逑都含有高度保守的R單元,其中含有1個(gè)R單元的HblMYB有5個(gè),含有2個(gè)R逡逑單元的HblMYB有33個(gè),含有3個(gè)R單元的HblMYB有6個(gè)。以R單元數(shù)量為依逡逑據(jù)可以將HblMYBs分為3類
【參考文獻(xiàn)】
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本文編號(hào):2788095
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