在每種藥物的開發(fā)過程中都需要檢測其所含化合物是否具有毒性作用,其中細(xì)胞毒性由于其對人體潛在的危害進(jìn)而導(dǎo)致很多藥物在研發(fā)后期甚至上市之后才被撤回,不僅造成了巨大的經(jīng)濟損失還會對患者造成無法挽回的傷害。因此對于化合物細(xì)胞毒性的檢測逐漸成為藥物開發(fā)過程的重要部分。隨著傳統(tǒng)方法弊端愈發(fā)顯著和計算機技術(shù)的飛速發(fā)展,采用計算機模擬對細(xì)胞毒性進(jìn)行預(yù)測的方法吸引了越來越多的毒理學(xué)研究者。然而,目前該領(lǐng)域還沒有取得一個令人滿意的研究進(jìn)展,究其原因是細(xì)胞毒性數(shù)據(jù)集是高通量的并且具有類不平衡問題。在本文中針對典型的AID364數(shù)據(jù)集的細(xì)胞毒性終點,在以十種分子指紋和隨機森林算法建立的基礎(chǔ)模型上應(yīng)用了AdaBoost集成方法以及其他六種數(shù)據(jù)平衡方法以解決類不平衡問題。綜合比較五折交叉驗證的評估結(jié)果之后,發(fā)現(xiàn)使用MACCS分子指紋的集成模型是預(yù)測性能最優(yōu),其AUC為85.2±0.35%,靈敏度為81.8±0.65%,特異度為76.0±0.12%。在外部驗證中,AUC為78.8%,靈敏度為55.5%,特異度為78.5%。然后將該模型在其他不同數(shù)據(jù)量和不平衡程度的數(shù)據(jù)集上進(jìn)行驗證,同樣也表現(xiàn)出了良好的預(yù)測性能。本系... 

【文章來源】：遼寧大學(xué)遼寧省 211工程院校

【文章頁數(shù)】：76 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

QSAR模型的應(yīng)用過程

圖 2-2 隨機森林 RF 建立過程 語言在計算機領(lǐng)域人工智能已成為熱門詞匯，與之相對的 Python 種最流行的編程語言，雖然 Python 由于其易于理解的語法已

有時需要將數(shù)據(jù)向量映射到高維過一個核函數(shù)在高維空間中構(gòu)造相應(yīng)的超標(biāo)準(zhǔn)變換為 ( ) ( n K( 圖 2-3 線性 SVM 相關(guān)過程

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]QSAR方法的研究進(jìn)展及其應(yīng)用[J]. 趙亞玲,黃方.  毒理學(xué)雜志. 2017(03)
[2]淺談R語言在生物統(tǒng)計學(xué)教學(xué)中的應(yīng)用[J]. 張哲,張豪.  教育教學(xué)論壇. 2013(27)
[3]Web網(wǎng)站功能及性能測試探析[J]. 王云.  電子設(shè)計工程. 2012(20)
[4]淺談PHP技術(shù)[J]. 孫星.  中國新技術(shù)新產(chǎn)品. 2011(10)
[5]軟件架構(gòu)的非功能性需求指標(biāo)和區(qū)域化支持[J]. 張宏升.  電腦知識與技術(shù). 2011(09)
[6]隨機森林方法研究綜述[J]. 方匡南,吳見彬,朱建平,謝邦昌.  統(tǒng)計與信息論壇. 2011(03)
[7]基于因特網(wǎng)的常用化合物活性數(shù)據(jù)庫簡介[J]. 王凱,閻愛俠.  計算機與應(yīng)用化學(xué). 2010(12)
[8]藥物毒理學(xué)研究的發(fā)展現(xiàn)狀與趨勢[J]. 廖明陽,吳純啟.  毒理學(xué)雜志. 2007(05)
[9]PHP中session變量的應(yīng)用研究[J]. 侯金彪,胡凱,王文博.  科技信息(學(xué)術(shù)研究). 2007(27)
[10]基于Apache的Web安全技術(shù)的應(yīng)用研究[J]. 張國祥.  武漢理工大學(xué)學(xué)報. 2004(03)

博士論文
[1]藥物毒性預(yù)測方法研究[D]. 黃劍平.浙江大學(xué) 2014
[2]QSAR研究中提高模型預(yù)測能力的新方法探討及其在藥物化學(xué)中的應(yīng)用[D]. 李加忠.蘭州大學(xué) 2009

碩士論文
[1]基于Web的動漫素材共享平臺的設(shè)計與實現(xiàn)[D]. 方超.廈門大學(xué) 2014
[2]企業(yè)級的B/S模式應(yīng)用軟件非功能性需求分析與研究[D]. 黃浪.廈門大學(xué) 2008
[3]科技文檔中化學(xué)結(jié)構(gòu)的描述與搜索[D]. 張立坤.華中科技大學(xué) 2007
[4]UI的設(shè)計與測試[D]. 孫濤.天津大學(xué) 2006



本文編號：3330073