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單分子基因測序儀成像系統(tǒng)設計與振動分析

發(fā)布時間:2021-09-07 09:15
  隨著生活水平的提高,人們對自己的生命健康越來越注重,自從精準醫(yī)療概念出現(xiàn)以后,國內(nèi)的下游基因測序公司呈爆發(fā)式增長,因而對上游的基因測序儀需求越發(fā)巨大。文中設計的單分子基因測序儀采用了邊合成邊測序的方法,對打斷的DNA分子進行直接測序,非常適用于臨床診療應用。其采用的是全內(nèi)反射熒光成像技術,檢測極其微小、脆弱的DNA單分子熒光信號,因而測序儀對振動非常敏感,因此本文主要通過針對單分子基因測序儀系統(tǒng)特性展開其振動抑制技術研究、隔振系統(tǒng)設計以及振動評價方案,有效隔絕和衰減外部和內(nèi)部振動因素的干擾,以確保測序過程獲得清晰、穩(wěn)定的單分子圖像,保證測序結(jié)果的準確性以及可靠性。根據(jù)單分子基因測序儀需求及功能分析完成了成像系統(tǒng)的搭建,設計了各個功能模塊;應用Solidworks三維軟件設計了三種不同的結(jié)構模型;分析了光學系統(tǒng)的構成、工作原理及其對振動的異常敏感特性;根據(jù)成像原理,設計了一套振動評估方案作為后續(xù)測試實驗驗證的基礎。研究了測序儀的振動激勵源,基于振動理論建立了系統(tǒng)的動力學模型,以便于觀察振動抑制的本質(zhì)規(guī)律,研究了振動抑制優(yōu)化方法。分析了成像系統(tǒng)在外部激勵、內(nèi)部激勵作用下,系統(tǒng)的響應特性。通... 

【文章來源】:哈爾濱工業(yè)大學黑龍江省 211工程院校 985工程院校

【文章頁數(shù)】:74 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

單分子基因測序儀成像系統(tǒng)設計與振動分析


ABI基因測序儀370A

堿基序列,磁珠,光信號,堿基配對


2005 年,羅氏公司推出了具有檢測機制的 454 基因組測序儀,其檢測機理是將捕獲 DNA 的磁珠[7]隨機放入精密孔板中進行測序。一枚磁珠直徑約 20 μm,一個孔直徑約 29 μm,設計理念是板中一個孔容納一枚磁珠。磁珠作為待測目標,每加入一種堿基時,儀器的視覺檢測 CCD 會實時捕獲與磁珠發(fā)生生化反應釋放出的光信號。一個堿基配對成功釋放一分子的光信號,多個堿基配對成功釋放多倍光信號,堿基不同對應的光信號也不同,由此通過采集光強和顏色信號來識別待測模板的堿基序列[8]。454 測序儀檢測對象是在 20 μm 級別,因而對振動敏感性還不是非常強烈,其隔振原理[9]是采用基板降低重心,吸收震動,雖然是桌面儀器,但儀器體積還是比較大。2006 年,Illumina 推出基于 Solexa 技術[10]的基因測序儀 GA。隨后,Illumina基于該技術原理推出了不同系列的第二代測序儀,如 GAIIx,NextSeq,MiSeq和 NovaSeq。 其中, GAIIx 如圖 1-2 所示, NextSeq 如圖 1-3 所示。 Illumina測序儀目前占全球市場的 70%以上。

堿基序列,磁珠,光信號,堿基配對


2005 年,羅氏公司推出了具有檢測機制的 454 基因組測序儀,其檢測機理是將捕獲 DNA 的磁珠[7]隨機放入精密孔板中進行測序。一枚磁珠直徑約 20 μm,一個孔直徑約 29 μm,設計理念是板中一個孔容納一枚磁珠。磁珠作為待測目標,每加入一種堿基時,儀器的視覺檢測 CCD 會實時捕獲與磁珠發(fā)生生化反應釋放出的光信號。一個堿基配對成功釋放一分子的光信號,多個堿基配對成功釋放多倍光信號,堿基不同對應的光信號也不同,由此通過采集光強和顏色信號來識別待測模板的堿基序列[8]。454 測序儀檢測對象是在 20 μm 級別,因而對振動敏感性還不是非常強烈,其隔振原理[9]是采用基板降低重心,吸收震動,雖然是桌面儀器,但儀器體積還是比較大。2006 年,Illumina 推出基于 Solexa 技術[10]的基因測序儀 GA。隨后,Illumina基于該技術原理推出了不同系列的第二代測序儀,如 GAIIx,NextSeq,MiSeq和 NovaSeq。 其中, GAIIx 如圖 1-2 所示, NextSeq 如圖 1-3 所示。 Illumina測序儀目前占全球市場的 70%以上。

【參考文獻】:
期刊論文
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[3]棱鏡耦合法測折射率在光學測量技術教學中的應用[J]. 何春鳳,林曉瓏,馮毅,姜永恒,白炳蓮.  科教導刊(中旬刊). 2015(01)
[4]基因測序技術及其臨床應用[J]. 陳丹,劉根焰,徐建,黃珮珺,潘世揚.  中華臨床實驗室管理電子雜志. 2014(04)
[5]隔震技術的研究與發(fā)展[J]. 姚丹丹,梁偉,孔令林,楊昆.  工程質(zhì)量. 2014(09)
[6]衛(wèi)星位置視覺測量[J]. 李想,朱遵尚,卜彥龍,尚洋.  國防科技大學學報. 2014(03)
[7]基于有限元分析法的船舶液壓動力站管路振動研究[J]. 何曦光,彭利坤,楊國志,喬小瑞.  液壓氣動與密封. 2014(06)
[8]被動毫米波實時成像技術[J]. 苗俊剛,鄭成,胡岸勇,姚現(xiàn)勛.  微波學報. 2013(Z1)
[9]DNA測序技術的進展和挑戰(zhàn)[J]. 蔡曉靜,朱煌,孔繁琪,馮婕妤,趙立全,牛宗鎮(zhèn).  現(xiàn)代生物醫(yī)學進展. 2013(20)
[10]第三代測序技術及其應用[J]. 張得芳,馬秋月,尹佟明,夏濤.  中國生物工程雜志. 2013(05)

博士論文
[1]基于高速視覺系統(tǒng)的振動及位移場測量[D]. 馮威.中國科學技術大學 2018
[2]高速視覺動態(tài)測量系統(tǒng)關鍵技術與應用研究[D]. 雷秀軍.中國科學技術大學 2016

碩士論文
[1]履帶式裝甲車懸掛優(yōu)化及減振性能研究[D]. 滕緋虎.中北大學 2017



本文編號:3389284

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