本文關(guān)鍵詞：國際石油價格波動行為機理及預(yù)測模型研究，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

《中國醫(yī)科大學(xué)》 2006年

急性白血病相關(guān)基因的文本挖掘分析

閆雷  

【摘要】：目的 尋找一種通過文本挖掘獲取醫(yī)學(xué)文獻中的有益信息進而用于解釋生物數(shù)據(jù)的方法。本文以急性白血病為例,通過主題詞和自然語言兩種途徑以疾病與基因的共現(xiàn)關(guān)系為基礎(chǔ)進行聚類分析,挖掘基因與疾病之間的關(guān)系,并對兩種途徑的有效性進行評價。 材料與方法 以“l(fā)eukemia[majr] AND genes[majr]”為檢索策略通過PUBMED檢索1966年到2005年9月6日的有關(guān)白血病與基因關(guān)系的相關(guān)文獻,共檢得3529篇。將檢索結(jié)果分別保存為XML格式和Medline格式,作為挖掘樣本。對XML格式的樣本,根據(jù)主題詞的樹狀結(jié)構(gòu)從中篩選急性白血病類和基因類主題詞進行處理,選取出現(xiàn)頻次大于等于3的主要主題詞共75個進行統(tǒng)計,生成詞篇矩陣,對生成的詞篇矩陣采用二值(Binary)資料測量中的hamann變換,使用重心法(centroid clustering)進行聚類。對medline格式樣本采用MMTx進行處理,從處理結(jié)果中提取語義類型為“neoplastic process”出現(xiàn)頻次大于30的前30個腫瘤類概念為列,另取語義類型為“gene or genome”出現(xiàn)頻次大于67的前60個基因類概念為行,計算生成腫瘤類概念與基因類概念的共句矩陣,對生成的矩陣采用計數(shù)資料(counts)測量中的chisquare法,使用最大距離(furthest neighbor)進行聚類。 結(jié)果 從XML格式文件中提取出來的有關(guān)急性白血病類主題詞/副主題詞與基因類主題詞/副主題詞生成的詞篇矩陣中涉及29種具體基因。medline

【關(guān)鍵詞】：
【學(xué)位授予單位】：中國醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2006
【分類號】：R733.71
【目錄】：

一、摘要5-11

1. 中文論著摘要5-8

2. 英文論著摘要8-11

二、英文縮略語11-12

三、論文12-32

1. 前言12-14

2. 實驗材料與方法14-17

3. 實驗結(jié)果(附論文圖片)17-24

4. 討論24-26

5. 結(jié)論26-27

6. 本研究創(chuàng)新性的自我評價27-28

7. 參考文獻28-32

四、附錄32-46

1. 綜述32-44

2. 在學(xué)期間科研成績44-45

3. 致謝45-46

4. 個人簡介46

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【引證文獻】

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【共引文獻】

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【同被引文獻】

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本文編號：77259