本文關(guān)鍵詞：基于全基因組測序的禾谷炭疽菌中碳水化合物酶類蛋白預(yù)測

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【摘要】：禾谷炭疽菌侵染玉米、小麥等農(nóng)作物引起的炭疽病,給各國農(nóng)業(yè)生產(chǎn)造成了巨大經(jīng)濟(jì)損失.基于前期研究結(jié)果,以630個分泌蛋白為基礎(chǔ)序列,利用CAT預(yù)測程序,對上述蛋白進(jìn)行碳水化合物酶類蛋白(CAZymes)的找尋,明確該菌中CAZymes含有267個,分為主要類別和復(fù)合類別兩大類,前者包括89個GHs、53個CBMs以及41個AAs、28個CEs、11個PLs、2個GTs;后者則包括30個GHs/CBMs、10個AAs/CBMs、1個CEs/CBMs等.該研究為深入開展該病菌侵染植物的作用機(jī)制提供重要的理論基礎(chǔ).
【作者單位】： 西南林業(yè)大學(xué)林學(xué)院云南省森林災(zāi)害預(yù)警與控制重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】： 全基因組測序 禾谷炭疽菌 碳水化合物酶類蛋白
【基金】：國家自然科學(xué)基金(31560211) 云南省森林災(zāi)害預(yù)警與控制重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室開放基金項(xiàng)目(ZK150004) 云南省優(yōu)勢特色重點(diǎn)學(xué)科生物學(xué)一級學(xué)科建設(shè)項(xiàng)目(50097505) 云南省高校林下生物資源保護(hù)及利用科技創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)(2014015)
【分類號】：S432.4
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本文編號：988589