本文關(guān)鍵詞：禾谷炭疽菌GPCR蛋白生物信息學(xué)分析

  更多相關(guān)文章： 禾谷炭疽菌 G蛋白偶聯(lián)受體 信號(hào)肽 二級(jí)結(jié)構(gòu) 生物信息學(xué)

【摘要】：基于釀酒酵母中已經(jīng)報(bào)道的3個(gè)典型GPCR序列,利用Blastp以及關(guān)鍵詞對(duì)炭疽菌蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì)、搜索,通過(guò)SMART保守結(jié)構(gòu)域及遺傳關(guān)系分析。結(jié)果表明:發(fā)現(xiàn)該菌存在4個(gè)典型的GPCR;4個(gè)GPCR在蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)上均含有典型的7跨膜結(jié)構(gòu)域以及較高比例的α螺旋結(jié)構(gòu),均不含有明顯的信號(hào)肽序列;在定位方面,4個(gè)GPCR均定位在質(zhì)膜上;該菌中的GPCR與C.higginsianum、C.fioriniae等炭疽菌屬中的病菌具有較高的同源序列以及較近的親緣關(guān)系。
【作者單位】： 西南林業(yè)大學(xué)林學(xué)院云南省森林災(zāi)害預(yù)警與控制重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;廊坊市文安縣農(nóng)業(yè)局;
【關(guān)鍵詞】： 禾谷炭疽菌 G蛋白偶聯(lián)受體 信號(hào)肽 二級(jí)結(jié)構(gòu) 生物信息學(xué)
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31560211)資助 云南省森林災(zāi)害預(yù)警與控制重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室開放基金項(xiàng)目(ZK150004)資助 云南省教育廳科學(xué)研究基金項(xiàng)目(2014Y330)資助 云南省優(yōu)勢(shì)特色重點(diǎn)學(xué)科生物學(xué)一級(jí)學(xué)科建設(shè)項(xiàng)目(50097505)資助 云南省高校林下生物資源保護(hù)及利用科技創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)(2014015)資助
【分類號(hào)】：S432.4
【正文快照】： 禾谷炭疽菌(Colletotrichum graminicola)侵染小麥(Triticum aestivum)、高粱(Sorghum bicolor)等禾本科作物引起炭疽病,自20世紀(jì)70年代以來(lái),由該菌引起的玉米(Zea mays)炭疽病在美國(guó)、印度等國(guó)就非常普遍,給各國(guó)農(nóng)業(yè)造成巨大損失[1-7]。隨著該菌全基因組序列的釋放[8],目前,

【相似文獻(xiàn)】

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中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

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本文編號(hào)：933738