本文關鍵詞：黃單胞菌Xanthomonas campestris pv.raphani 756C中Ⅵ型分泌蛋白的生物信息學分析

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【摘要】：為明確黃單胞菌Xanthomonas campestris pv.raphani 756C(Xcr)中存在的Ⅵ型分泌蛋白(Tss)數(shù)量及其所具有的信號肽、保守motif等信息以及該菌中Tss與其他病菌中同源序列之間的遺傳關系,利用關鍵詞對Xcr蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫進行搜索,并對Xcr中Tss氨基酸序列開展信號肽、跨膜結(jié)構域以及保守基序(motif)的生物信息學分析,同時,對Xcr中所含有的Tss與其他病原菌中同源序列之間的遺傳關系進行分析。明確Xcr中存在3個Tss,分別命名為TssA、TssB、TssC,上述Tss均含有高于50%比例的!螺旋結(jié)構,均定位在細胞膜上以及具有3個保守motif,而就信號肽而言,僅TssC含有明顯的信號肽序列。Xcr中的Tss與Xcc、Xca等黃單胞菌屬病菌中的Tss具有較近的親緣關系。
【作者單位】： 西南林業(yè)大學林學院/云南省森林災害預警與控制重點實驗室;云南省林業(yè)科學院/國家林業(yè)局云南珍稀瀕特森林植物保護和繁育重點實驗室/云南省森林植物培育與開發(fā)利用重點實驗室;
【關鍵詞】： Xanthomonas campestris pv.raphani C Ⅵ型分泌系統(tǒng) Ⅵ型分泌蛋白 黃單胞菌屬
【基金】：云南省森林植物培育與開發(fā)利用重點實驗室/國家林業(yè)局云南珍稀瀕特植物保護與繁育重點實驗室開放基金項目(2016-05) 國家自然科學基金項目(31200488,31560211) 云南省科技計劃項目(2015IA005) 云南省森林災害預警與控制重點實驗室開放基金項目(ZK150004) 云南省教育廳科學研究基金項目(2014Y330)
【分類號】：S432.4
【正文快照】： 病原細菌與植物相互作用過程中,病原細菌為了有效地侵染植物,可通過分泌系統(tǒng)將分泌蛋白輸入到寄主組織中,這些分泌蛋白作為效應分子具有操控植物防衛(wèi)反應的功能[1]。目前,在細菌中已經(jīng)發(fā)現(xiàn)有7種分泌系統(tǒng),包括Ⅰ型分泌系統(tǒng)(typeⅠsecretion system,T1SS)到Ⅶ型分泌系統(tǒng)(typeⅦs

【相似文獻】

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本文編號：825881