本文關(guān)鍵詞：禾谷炭疽菌CFEM效應(yīng)子的生物信息學(xué)鑒定與轉(zhuǎn)錄分析

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【摘要】：植物病原真菌效應(yīng)子是指可以改變寄主植物細(xì)胞結(jié)構(gòu)或者細(xì)胞功能的分泌蛋白或其他小分子物質(zhì)。效應(yīng)子對病原真菌的侵入、擴展以及致病發(fā)揮著至關(guān)重要的作用,是植物病原真菌與寄主的互作不斷演化的必然結(jié)果。真菌特有的CFEM(common in several fungal extracellular membrane protein)蛋白對于病原真菌的致病性起重要作用,一些能夠被分泌到胞外的CFEM蛋白被證明是病原真菌效應(yīng)子。由禾谷炭疽菌(Colletotrichum graminicola)引起的玉米炭疽病是玉米上的重要病害,常年造成嚴(yán)重?fù)p失。本研究運用生物信息學(xué)工具對禾谷炭疽菌中的CFEM蛋白進(jìn)行信號肽分析和亞細(xì)胞定位分析,進(jìn)而通過轉(zhuǎn)錄分析明確禾谷炭疽菌CFEM蛋白的表達(dá)時期。分析結(jié)果表明,該病原真菌編碼32個CFEM蛋白,其中22個具有信號肽并可分泌至胞外,為分泌蛋白。轉(zhuǎn)錄分析表明,10個CFEM分泌蛋白于病菌侵染時附著胞形成期表達(dá),2個CFEM分泌蛋白于侵染后的活體寄生階段表達(dá),1個于死體寄生階段表達(dá),其余9個CFEM分泌蛋白在病菌侵染時期的3個階段均穩(wěn)定表達(dá)。結(jié)合生物信息學(xué)和轉(zhuǎn)錄分析結(jié)果,我們預(yù)測這22個CFEM分泌蛋白為禾谷炭疽菌致病相關(guān)的效應(yīng)子(簡稱CFEM效應(yīng)子)。明確禾谷炭疽菌中CFEM蛋白數(shù)量,預(yù)測病菌致病相關(guān)的CFEM效應(yīng)子組成,可為開展病原真菌CFEM蛋白介導(dǎo)的病菌—寄主互作研究奠定基礎(chǔ),并為玉米炭疽病的防治和抗性育種研究提供參考。
【作者單位】： 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所植物病蟲害生物學(xué)國家重點實驗室;
【關(guān)鍵詞】： 禾谷炭疽菌 CFEM效應(yīng)子 生物信息學(xué)分析
【基金】：植物病蟲害生物學(xué)國家重點實驗室開放課題(SKLOF201508)
【分類號】：S432.44
【正文快照】： 玉米是世界三大作物之一,也是目前中國第一大糧食作物。每年作物病害都會造成嚴(yán)重的經(jīng)濟損失,直接威脅世界糧食安全[1-3]。據(jù)統(tǒng)計,玉米絲黑穗病以及大斑病、小斑病是危害我國玉米生產(chǎn)的3種主要病害,但隨著耕作方式的轉(zhuǎn)變以及全球氣候、生態(tài)的改變,十余種次要病害逐年加重[4-5]

【相似文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前3條

1 莊軍;吳祖建;;TAL效應(yīng)子介導(dǎo)基因組DNA的靶向修飾[J];中國生物工程雜志;2014年08期

2 梁龍;皮文輝;;TAL效應(yīng)子應(yīng)用研究進(jìn)展[J];生物技術(shù)通報;2012年11期

3 ;[J];;年期

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本文編號：629195