發(fā)布時(shí)間：2017-08-02 01:05

  本文關(guān)鍵詞：疣蝗轉(zhuǎn)錄組分析

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【摘要】：疣蝗分布廣泛,是一種常見的害蟲,主要危害農(nóng)作物,但分子信息缺乏。我們采用高通量Illumina測(cè)序技術(shù)和從頭組裝的方法獲得了疣蝗轉(zhuǎn)錄組unigenes,并鑒定了天然免疫相關(guān)信號(hào)通路基因。本研究共獲得疣蝗轉(zhuǎn)錄組unigenes 86 756個(gè),平均長度為670 bp,N50為1 033 bp。使用六大數(shù)據(jù)庫Nr、Nt、Swiss-Prot、GO、COG和KEGG注釋疣蝗轉(zhuǎn)錄組unigenes,分別對(duì)應(yīng)有29 627,13 866,23 398,13 474,11 968和21 027個(gè)unigenes獲得注釋。本研究共鑒定319個(gè)天然免疫信號(hào)通路相關(guān)的unigenes,其中,參與Toll通路的unigenes 49個(gè),參與免疫缺失(IMD)通路的unigenes 13個(gè),參與JAK-STAT信號(hào)通路的unigenes 117個(gè),參與MAPK-fly通路相關(guān)的unigenes 58個(gè),參與黑化(Melanization)通路的unigenes 82個(gè)。另外,我們還預(yù)測(cè)到了9 287個(gè)微衛(wèi)星(SSRs)。本研究為疣蝗基因功能分析、免疫通路相關(guān)基因和分子標(biāo)記的進(jìn)一步研究提供了分子理論基礎(chǔ)。
【作者單位】： 陜西師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;陜西學(xué)前師范學(xué)院生命科學(xué)與食品工程學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】： 疣蝗 轉(zhuǎn)錄組 天然免疫 SSRs
【基金】：國家自然科學(xué)基金(31372192)資助
【分類號(hào)】：S433
【正文快照】： De novo Assembly and Analysis of the Trilophidia annulata TranscriptomeQiu Zhongying1Liu Fei1,2Zhang Keyao1Huang Yuan1*1 College of Life Sciences,Shaanxi Normal University,Xi'an,710062;2 College of Life Sciences and Food Engineering,Shaanxi Xueqian Norma，

本文編號(hào)：606948