【目的】研究多粘類芽孢桿菌LRS-1生防菌對患疫霉病的辣椒根際土壤細菌多樣性的影響�！痉椒ā客ㄟ^對無病陰性對照(CK)、辣椒疫霉菌陽性處理(PC)和生防菌+辣椒疫霉菌處理(LRS1) 3個處理的盆栽根際土壤樣品16S r RNA基因的V3-V4區(qū)進行高通量測序,并對下機數(shù)據(jù)予以相關(guān)生物信息學(xué)分析,獲得了不同處理根際土壤細菌的OTU豐度、Alpha多樣性、OTUs分布、群落組成差異以及PCA聚類分析等數(shù)據(jù)結(jié)果�！窘Y(jié)果】各處理間的根際土壤細菌群落變化明顯,疫霉菌處理明顯降低了根際土壤細菌群落的豐富度和多樣性,而接種多粘類芽孢桿菌LRS-1則可明顯改善根際土壤細菌群落豐富度與多樣性;接種LRS-1明顯提高了辣椒根際土壤細菌種類組成的相似性,并改善疫霉菌脅迫下的細菌種類組成;各處理的優(yōu)勢物種類群均分布于變形菌門(Proteobacteria)、厚壁菌門(Firmicutes)、放線菌門(Actinobacteria),但疫霉脅迫條件下Sphingomonadaceae、Clostridiales物種豐度顯著降低,而Burkholderiales、Micrococcales等物種豐度顯著增加,接...

【文章頁數(shù)】：7 頁

【部分圖文】：

圖1 根際土壤細菌OTUs豐度稀釋曲線

用Alpha多樣性分析反映樣本中細菌群落的豐富度與多樣性，其中Ace指數(shù)和Chao指數(shù)描述細菌群落豐富度，shannon指數(shù)描述細菌群落多樣性。Alpha多樣性分析結(jié)果顯示（表1），無論Ace指數(shù)、Chao指數(shù)或Shanno指數(shù)，各處理的數(shù)值結(jié)果均表現(xiàn)為CK>LRS1>PC，說明....

圖2 根際細菌OTUs分布韋恩圖

如圖2所示，各根際土壤樣本共獲得1069個細菌OTUs，其3者共有OTUs數(shù)量為664，占OTUs總數(shù)的62.11%，說明疫霉菌的脅迫或生防菌LRS1的修復(fù)對辣椒根際土壤細菌OUT豐度具有明顯影響。CK處理的根際土壤樣本與PC處理的根際土壤樣本共有715個細菌OTUs,CK處理的....

圖3 門水平上的根際細菌相對豐度柱狀圖

根據(jù)各處理根際土壤樣本OTU中代表序列的物種注釋結(jié)果，選取在細菌門和屬分類水平上豐度最大的前10名物種生成物種相對豐度柱狀圖（圖3和圖4）。從圖3可以看出，就門分類水平而言，根際土壤細菌排名前10的物種為：變形菌門（Proteobacteria）、厚壁菌門（Firmicutes）....

圖4 屬水平上的根際細菌群落餅圖

在屬分類水平上平均豐度大于1%的根際土壤細菌物種主要有Massilia、Microvirga、Bacillus、Tepidisphaeraceae、Chitinophagaceae、Flavisolibacter、Sphingomonadaceae、Sporolactobacil....

本文編號：4041596