煙嘧磺隆降解菌的篩選與代謝組學(xué)檢測
發(fā)布時(shí)間:2024-01-23 15:08
本實(shí)驗(yàn)中以農(nóng)藥廠排污口及周圍農(nóng)田土壤為起始接種物。將采集來的土壤樣品接種于富集培養(yǎng)基中,以100mg/L為初始濃度進(jìn)行富集培養(yǎng),每7天轉(zhuǎn)接一次并提升100mg/L的煙嘧磺隆濃度,致使最終富集濃度為700mg/L。涂布平板后得到一株真菌YC-WZ1,經(jīng)鑒定該菌株為斜臥青霉,可在6天內(nèi)將100mg/L的煙嘧磺隆完全降解。 為了詳細(xì)了解所篩選菌株YC-WZ1的煙嘧磺隆降解機(jī)制,利用代謝組學(xué)的研究方法,對(duì)YC-WZ1在煙嘧磺隆存在條件下產(chǎn)生的所有代謝物質(zhì)進(jìn)行檢測。將待檢測的菌株分為煙嘧磺隆處理組(TG)和空白對(duì)照組(CG)。取樣后使用液氮迅速淬滅,使用衍生化試劑對(duì)樣品菌株進(jìn)行衍生化處理,然后使用氣相色譜-飛行時(shí)間質(zhì)譜(GC/TOF-MS)得到所有代謝物的檢測數(shù)據(jù)。然后利用化學(xué)計(jì)量學(xué)的方法如主成分分析(PCA),偏最小二乘法(PLS),正交偏最小二乘法(O-PLS)對(duì)所得數(shù)據(jù)進(jìn)行建模分析,結(jié)果顯示處理組和對(duì)照組的代謝組學(xué)檢測數(shù)據(jù)經(jīng)化學(xué)計(jì)量法建模處理后所得數(shù)據(jù)不同組別相對(duì)集中,區(qū)分明顯,可以很好地反映處理組和對(duì)照組的代謝差異。所得檢測數(shù)據(jù)可以用于差異代謝產(chǎn)物的篩選和相關(guān)代謝通路的研究。 通過代謝組...
【文章頁數(shù)】:56 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
英文縮略表
第一章 引言
1.1 磺酰脲類除草劑概述
1.2 磺酰脲類除草劑降解研究
1.2.1 磺酰脲類除草劑的光降解
1.2.2 磺酰脲類除草劑的化學(xué)水解
1.2.3 磺酰脲類除草劑的微生物降解
1.3 代謝組學(xué)概述
1.3.1 代謝組學(xué)
1.3.2 研究歷史
1.3.3 代謝組學(xué)的研究對(duì)象和研究層次
1.3.4 代謝組學(xué)研究方法簡介
1.3.5 代謝組學(xué)研究領(lǐng)域
1.4 氣相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)
1.4.1 氣相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)原理及特點(diǎn)
1.4.2 氣相色譜-飛行時(shí)間質(zhì)譜儀(GC/TOF- MS)
1.4.3 氣相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)在代謝組學(xué)中的應(yīng)用
1.5 代謝組學(xué)在微生物中的應(yīng)用
1.5.1 產(chǎn)核黃素枯草芽孢桿菌代謝工程
1.5.2 乳酸菌生理功能的代謝工程
1.5.3 絲狀真菌異源蛋白表達(dá)的代謝工程
1.5.4 醫(yī)學(xué)微生物學(xué)中的代謝組學(xué)研究
1.5.5 環(huán)境微生物學(xué)中的代謝組學(xué)研究
1.6 本課題的研究目的與意義
第二章 煙嘧磺隆降解菌的篩選
2.1 儀器與藥品
2.1.1 供試樣品
2.1.2 培養(yǎng)基
2.1.3 試劑與化學(xué)藥品
2.1.4 主要儀器
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.1 煙嘧磺隆降解菌株的富集培養(yǎng)與篩選分離
2.2.2 煙嘧磺隆濃度標(biāo)準(zhǔn)曲線的制作
2.2.3 菌株 YC-WZ1 降解能力的測定
2.2.4 降解菌株的形態(tài)特征
2.2.5 降解菌株的 18SRDNA 的鑒定
2.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
2.3.1 降解菌株的分離與篩選
2.3.2 煙嘧磺隆標(biāo)準(zhǔn)曲線的繪制
2.3.3 菌株 YC-WZ1 降解能力的測定
2.3.4 降解菌株的形態(tài)特征
2.3.5 降解菌株的 18SRDNA 鑒定
2.4 本章小結(jié)
第三章 煙嘧磺隆降解菌代謝組學(xué)研究
3.1 儀器和試劑
3.1.1 試劑
3.1.2 儀器
3.2 實(shí)驗(yàn)方法
3.2.1 待測菌種的培養(yǎng)
3.2.2 代謝物萃取
3.2.3 代謝物衍生化
3.2.4 系統(tǒng)穩(wěn)定性檢測
3.2.5 預(yù)實(shí)驗(yàn)
3.2.6 正式實(shí)驗(yàn)
3.2.7 上機(jī)檢測
3.2.8 檢測結(jié)果
3.3 數(shù)據(jù)結(jié)果分析
3.3.1 數(shù)據(jù)預(yù)處理
3.3.2 主成分(PCA)分析
3.3.3 偏最小二乘法-判別分析(PLS-DA)及對(duì)模型的驗(yàn)證
3.3.4 正交偏最小二乘法-判別分析(OPLS-DA)
3.3.5 差異代謝物的篩選及鑒定
3.4 本章小結(jié)
第四章 結(jié)果與討論
4.1 煙嘧磺隆的水解
4.2 氨基酸代謝
4.3 糖類代謝
4.4 核苷酸代謝
4.5 抗逆性物質(zhì)
4.6 總體代謝輪廓
第五章 全文總結(jié)
5.1 研究結(jié)果
5.2 創(chuàng)新點(diǎn)
5.3 展望
附錄
參考文獻(xiàn)
致謝
作者簡歷
本文編號(hào):3882881
【文章頁數(shù)】:56 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
英文縮略表
第一章 引言
1.1 磺酰脲類除草劑概述
1.2 磺酰脲類除草劑降解研究
1.2.1 磺酰脲類除草劑的光降解
1.2.2 磺酰脲類除草劑的化學(xué)水解
1.2.3 磺酰脲類除草劑的微生物降解
1.3 代謝組學(xué)概述
1.3.1 代謝組學(xué)
1.3.2 研究歷史
1.3.3 代謝組學(xué)的研究對(duì)象和研究層次
1.3.4 代謝組學(xué)研究方法簡介
1.3.5 代謝組學(xué)研究領(lǐng)域
1.4 氣相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)
1.4.1 氣相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)原理及特點(diǎn)
1.4.2 氣相色譜-飛行時(shí)間質(zhì)譜儀(GC/TOF- MS)
1.4.3 氣相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)在代謝組學(xué)中的應(yīng)用
1.5 代謝組學(xué)在微生物中的應(yīng)用
1.5.1 產(chǎn)核黃素枯草芽孢桿菌代謝工程
1.5.2 乳酸菌生理功能的代謝工程
1.5.3 絲狀真菌異源蛋白表達(dá)的代謝工程
1.5.4 醫(yī)學(xué)微生物學(xué)中的代謝組學(xué)研究
1.5.5 環(huán)境微生物學(xué)中的代謝組學(xué)研究
1.6 本課題的研究目的與意義
第二章 煙嘧磺隆降解菌的篩選
2.1 儀器與藥品
2.1.1 供試樣品
2.1.2 培養(yǎng)基
2.1.3 試劑與化學(xué)藥品
2.1.4 主要儀器
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.1 煙嘧磺隆降解菌株的富集培養(yǎng)與篩選分離
2.2.2 煙嘧磺隆濃度標(biāo)準(zhǔn)曲線的制作
2.2.3 菌株 YC-WZ1 降解能力的測定
2.2.4 降解菌株的形態(tài)特征
2.2.5 降解菌株的 18SRDNA 的鑒定
2.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
2.3.1 降解菌株的分離與篩選
2.3.2 煙嘧磺隆標(biāo)準(zhǔn)曲線的繪制
2.3.3 菌株 YC-WZ1 降解能力的測定
2.3.4 降解菌株的形態(tài)特征
2.3.5 降解菌株的 18SRDNA 鑒定
2.4 本章小結(jié)
第三章 煙嘧磺隆降解菌代謝組學(xué)研究
3.1 儀器和試劑
3.1.1 試劑
3.1.2 儀器
3.2 實(shí)驗(yàn)方法
3.2.1 待測菌種的培養(yǎng)
3.2.2 代謝物萃取
3.2.3 代謝物衍生化
3.2.4 系統(tǒng)穩(wěn)定性檢測
3.2.5 預(yù)實(shí)驗(yàn)
3.2.6 正式實(shí)驗(yàn)
3.2.7 上機(jī)檢測
3.2.8 檢測結(jié)果
3.3 數(shù)據(jù)結(jié)果分析
3.3.1 數(shù)據(jù)預(yù)處理
3.3.2 主成分(PCA)分析
3.3.3 偏最小二乘法-判別分析(PLS-DA)及對(duì)模型的驗(yàn)證
3.3.4 正交偏最小二乘法-判別分析(OPLS-DA)
3.3.5 差異代謝物的篩選及鑒定
3.4 本章小結(jié)
第四章 結(jié)果與討論
4.1 煙嘧磺隆的水解
4.2 氨基酸代謝
4.3 糖類代謝
4.4 核苷酸代謝
4.5 抗逆性物質(zhì)
4.6 總體代謝輪廓
第五章 全文總結(jié)
5.1 研究結(jié)果
5.2 創(chuàng)新點(diǎn)
5.3 展望
附錄
參考文獻(xiàn)
致謝
作者簡歷
本文編號(hào):3882881
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