【背景】土壤采樣是土壤研究的基礎(chǔ),采樣方案的不同可能會(huì)對土壤微生物多樣性的研究結(jié)果產(chǎn)生一定影響。【目的】研究不同的土壤采樣設(shè)計(jì)方案對土壤樣品16S rRNA基因高通量測序結(jié)果的影響。【方法】對2個(gè)不同生境樣地的土壤進(jìn)行網(wǎng)格化采樣,對采集的18個(gè)土壤樣品進(jìn)行16S rRNA基因測序分析,通過模擬5種常見土壤采樣方法,對比不同采樣方式所獲得的測序結(jié)果。【結(jié)果】不同采樣方式會(huì)產(chǎn)生不同的測序結(jié)果。在測序深度有效的情況下,細(xì)菌總物種數(shù)隨著采樣數(shù)的增加而逐漸增長,增長速度在采樣數(shù)大于5以后趨于平緩;樣品中的優(yōu)勢物種(序列數(shù)200以上)只需很少的采樣數(shù)(1-3)即可觀察到全部物種;Shannon-Wiener指數(shù)與Simpson指數(shù)的變化較相似,當(dāng)采樣數(shù)由1到3時(shí)兩指數(shù)均有較大增長,之后變化放緩�！窘Y(jié)論】土壤細(xì)菌微生物測序研究中,土壤樣地采樣數(shù)量低于3個(gè)會(huì)影響測序結(jié)果的可靠性,采樣方案選擇梅花形采樣法或蛇形采樣法較為適宜。

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 研究區(qū)概況
    1.2 土壤采樣設(shè)計(jì)和樣品采集
    1.3 測序方法
    1.4 α多樣性分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 測序結(jié)果
    2.2 OTU分析
    2.3 α多樣性分析
        2.3.1 物種數(shù)
        2.3.2 Shannon-Wiener和Simpson指數(shù)
3 討論
4 結(jié)論



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