利用高通量測序技術(shù)對陜西省中部和北部2個中國沙棘林地(永壽縣馬坊鎮(zhèn)馬坊林場和榆林市榆陽區(qū)轉(zhuǎn)龍灣鄉(xiāng))表層(5～20 cm)土壤中細菌的特征區(qū)域進行檢測,對比分析了2個林地土壤細菌群落結(jié)構(gòu)和組成,并分析弗蘭克氏菌科各細菌屬的相對豐度與年平均降雨量和主要土壤營養(yǎng)因子之間的關(guān)系,以闡明環(huán)境條件對沙棘林地表層土壤中弗蘭克氏菌群落的影響。結(jié)果表明,轉(zhuǎn)龍灣林地土壤中細菌菌群豐富度指數(shù)(Ace指數(shù)和Chao1指數(shù))高于馬坊林地,而2個地區(qū)的細菌群落多樣性指數(shù)(Shannon指數(shù)和Simpson指數(shù))差異不大。從馬坊和轉(zhuǎn)龍灣林地土壤中分別獲得89 467條和85 279條測序序列,可歸類為2 658條和2 887個操作分類單元(operational taxonomic unit,OTU),其對應(yīng)的細菌分屬于26個門66個綱144個目275個科474個屬和30個門75個綱164個目322個科584個屬;2個林地在門和綱組成上的一致性分別達到83%和78%;在細菌目和科的分類水平上,2個林地土壤細菌群落中相對豐度較高的細菌目的組成、以及這些目所含的主要細菌科的組成高度相似,但各菌目以及同一菌目中各菌科的相...

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 樣品采集
    1.2 土壤主要營養(yǎng)因子的測定
    1.3 土壤總DNA的提取
    1.4 土壤細菌多樣性分析
    1.5 主要環(huán)境因子與弗蘭克氏菌目各菌屬相對豐度的相關(guān)性分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 2個沙棘林地土壤的主要營養(yǎng)因子
    2.2 細菌群落特征分析
        2.2.1 細菌群落的α多樣性分析
        2.2.2 細菌群落的組成分析
        2.2.3 弗蘭克氏菌目細菌的群落特征分析
3 結(jié)論與討論



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