兩株潛在放線菌新種的多相分類研究
發(fā)布時(shí)間:2022-10-23 20:18
本研究旨在對(duì)兩株放線菌潛在新種K55和D34進(jìn)行鑒定,分別分離自陜西略陽鎳礦污染土壤廣布野豌豆根際土壤和黃土高原云霧山大針茅根際土壤中,使用多相分類的方法,對(duì)供試菌株從形態(tài)學(xué)特征、生理生化特性、化學(xué)分類水平和分子水平進(jìn)行研究,以確定供試菌株的分類地位。 形態(tài)學(xué)特征研究表明,菌株K55氣生菌絲和基內(nèi)菌絲發(fā)育良好,產(chǎn)黑色素,產(chǎn)孢子,孢子球形,單生,表面光滑,著生于菌絲體表面。這些特征符合典型的小單胞菌屬的形態(tài)特征。菌株D34氣生菌絲和基內(nèi)菌絲發(fā)育良好,產(chǎn)淡黃色素,產(chǎn)孢子,菌絲體不斷裂,無橫隔,并發(fā)育為螺旋狀的孢子鏈,孢子橢球形,表面粗糙。這些特征符合典型的糖絲菌屬的形態(tài)特征。 化學(xué)方法研究表明,菌株K55細(xì)胞壁有機(jī)酸主要包括丙氨酸,谷氨酸和meso-DAP;全細(xì)胞糖主要包括木糖和阿拉伯糖(D型);磷酸類脂主要為磷脂酰乙醇胺(PE),屬于PⅡ磷酸類脂;醌型為MK-12;脂肪酸主要成分及含量包括15:0iso(20.53%)、17:0iso(12.74%)、16:0iso(12.15%)等飽和與不飽和脂肪酸組成。菌株D34細(xì)胞壁有機(jī)酸主要包括丙氨酸,谷氨酸和meso-DAP;全細(xì)胞...
【文章頁數(shù)】:53 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 引言
1.2 放線菌的分類地位
1.3 放線菌的多相分類簡(jiǎn)介
1.3.1 經(jīng)典分類方法
1.3.2 數(shù)值分類方法
1.3.3 化學(xué)分類
1.3.4 分子分類
1.4 放線菌分類學(xué)的發(fā)展及國內(nèi)外研究現(xiàn)狀
1.4.1 放線菌分類學(xué)的發(fā)展
1.4.2 放線菌分類學(xué)國內(nèi)外研究現(xiàn)狀
1.5 研究目的與內(nèi)容
1.6 技術(shù)路線
第二章 形態(tài)學(xué)特征及生理生化特征研究
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.1 供試菌株
2.2 實(shí)驗(yàn)內(nèi)容與方法
2.2.1 形態(tài)學(xué)內(nèi)容與方法
2.2.2 生理生化內(nèi)容及方法
2.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
2.3.1 形態(tài)學(xué)特征結(jié)果
2.3.2 各菌株在不同培養(yǎng)基上的生長情況
2.3.3 生理生化特征研究結(jié)果
第三章 細(xì)胞化學(xué)組分分析
3.1 全細(xì)胞壁氨基酸分析
3.2 全細(xì)胞糖分析
3.3 磷酸類脂分析
3.3.1 菌體培養(yǎng)與收集
3.3.2 磷酸類脂的粗提與純化
3.3.3 雙相點(diǎn)樣展層
3.3.4 顯色劑配制
3.3.5 顯色
3.4 醌組分分析
3.4.1 菌體培養(yǎng)與收集
3.4.2 醌的提取與純化
3.4.3 高壓液相色譜(HPLC)測(cè)定
3.5 脂肪酸分析
3.5.1 菌體的培養(yǎng)與收集
3.5.2 提取方法
3.5.3 儀器分析方法
3.6 實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析
第四章 分子水平鑒定
4.1 16S RRNA 系統(tǒng)發(fā)育分析
4.1.1 菌體收集
4.1.2 DNA 提取
4.1.3 純度檢測(cè)
4.1.4 16S rRNA PCR 擴(kuò)增
4.1.5 16S rRNA 系統(tǒng)發(fā)育分析
4.2 G+C MOL% 含量測(cè)定
4.2.1 所用儀器及試劑
4.2.2 DNA 提取方法
4.2.3 DNA 純化
4.2.4 純度及濃度檢測(cè)
4.2.5 DNA 的酶解
4.2.6 DNA G+C mol%含量測(cè)定
4.2.7 測(cè)定的結(jié)果分析
第五章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
作者簡(jiǎn)介
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]放線菌分類研究進(jìn)展[J]. 劉燕娟,李嬋,周倩. 湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2009(S1)
[2]放線菌綱內(nèi)亞綱、目、亞目、科的16S rDNA/rRNA特征序列簡(jiǎn)介[J]. 阮繼生. 微生物學(xué)通報(bào). 2005(03)
[3]放線菌的多相分類法[J]. 馬利,張利平,趙剛勇. 河北省科學(xué)院學(xué)報(bào). 2004(01)
[4]細(xì)胞壁氨基酸的定量分析在放線菌分類中的應(yīng)用研究[J]. 蔣凌月,李銘剛,李文軍,崔曉龍,徐麗華,姜成林. 微生物學(xué)報(bào). 2001(03)
[5]放線菌分類研究的歷史與現(xiàn)狀[J]. 馬邦亞,楊俊秀,曹支敏. 西北林學(xué)院學(xué)報(bào). 1999(03)
[6]放線菌化學(xué)分類學(xué)的現(xiàn)狀及發(fā)展趨勢(shì)[J]. 張利平,陳冠華. 微生物學(xué)通報(bào). 1997(05)
[7]細(xì)菌的數(shù)值分類方法[J]. 郭秀花,李愛國,馮丹,張德舜,樸相浩. 微生物學(xué)通報(bào). 1996(03)
[8]測(cè)定放線菌菌體中氨基酸和單糖的快速方法——薄層層析法[J]. 王平. 微生物學(xué)通報(bào). 1986(05)
碩士論文
[1]一株黃土高原土壤放線菌新種的鑒定[D]. 王婷婷.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2011
[2]深海樣品中放線菌菌株的分離和兩株放線菌的多相分類[D]. 羅應(yīng)學(xué).國家海洋局第三海洋研究所 2010
本文編號(hào):3697056
【文章頁數(shù)】:53 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 引言
1.2 放線菌的分類地位
1.3 放線菌的多相分類簡(jiǎn)介
1.3.1 經(jīng)典分類方法
1.3.2 數(shù)值分類方法
1.3.3 化學(xué)分類
1.3.4 分子分類
1.4 放線菌分類學(xué)的發(fā)展及國內(nèi)外研究現(xiàn)狀
1.4.1 放線菌分類學(xué)的發(fā)展
1.4.2 放線菌分類學(xué)國內(nèi)外研究現(xiàn)狀
1.5 研究目的與內(nèi)容
1.6 技術(shù)路線
第二章 形態(tài)學(xué)特征及生理生化特征研究
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.1 供試菌株
2.2 實(shí)驗(yàn)內(nèi)容與方法
2.2.1 形態(tài)學(xué)內(nèi)容與方法
2.2.2 生理生化內(nèi)容及方法
2.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
2.3.1 形態(tài)學(xué)特征結(jié)果
2.3.2 各菌株在不同培養(yǎng)基上的生長情況
2.3.3 生理生化特征研究結(jié)果
第三章 細(xì)胞化學(xué)組分分析
3.1 全細(xì)胞壁氨基酸分析
3.2 全細(xì)胞糖分析
3.3 磷酸類脂分析
3.3.1 菌體培養(yǎng)與收集
3.3.2 磷酸類脂的粗提與純化
3.3.3 雙相點(diǎn)樣展層
3.3.4 顯色劑配制
3.3.5 顯色
3.4 醌組分分析
3.4.1 菌體培養(yǎng)與收集
3.4.2 醌的提取與純化
3.4.3 高壓液相色譜(HPLC)測(cè)定
3.5 脂肪酸分析
3.5.1 菌體的培養(yǎng)與收集
3.5.2 提取方法
3.5.3 儀器分析方法
3.6 實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析
第四章 分子水平鑒定
4.1 16S RRNA 系統(tǒng)發(fā)育分析
4.1.1 菌體收集
4.1.2 DNA 提取
4.1.3 純度檢測(cè)
4.1.4 16S rRNA PCR 擴(kuò)增
4.1.5 16S rRNA 系統(tǒng)發(fā)育分析
4.2 G+C MOL% 含量測(cè)定
4.2.1 所用儀器及試劑
4.2.2 DNA 提取方法
4.2.3 DNA 純化
4.2.4 純度及濃度檢測(cè)
4.2.5 DNA 的酶解
4.2.6 DNA G+C mol%含量測(cè)定
4.2.7 測(cè)定的結(jié)果分析
第五章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
作者簡(jiǎn)介
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]放線菌分類研究進(jìn)展[J]. 劉燕娟,李嬋,周倩. 湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2009(S1)
[2]放線菌綱內(nèi)亞綱、目、亞目、科的16S rDNA/rRNA特征序列簡(jiǎn)介[J]. 阮繼生. 微生物學(xué)通報(bào). 2005(03)
[3]放線菌的多相分類法[J]. 馬利,張利平,趙剛勇. 河北省科學(xué)院學(xué)報(bào). 2004(01)
[4]細(xì)胞壁氨基酸的定量分析在放線菌分類中的應(yīng)用研究[J]. 蔣凌月,李銘剛,李文軍,崔曉龍,徐麗華,姜成林. 微生物學(xué)報(bào). 2001(03)
[5]放線菌分類研究的歷史與現(xiàn)狀[J]. 馬邦亞,楊俊秀,曹支敏. 西北林學(xué)院學(xué)報(bào). 1999(03)
[6]放線菌化學(xué)分類學(xué)的現(xiàn)狀及發(fā)展趨勢(shì)[J]. 張利平,陳冠華. 微生物學(xué)通報(bào). 1997(05)
[7]細(xì)菌的數(shù)值分類方法[J]. 郭秀花,李愛國,馮丹,張德舜,樸相浩. 微生物學(xué)通報(bào). 1996(03)
[8]測(cè)定放線菌菌體中氨基酸和單糖的快速方法——薄層層析法[J]. 王平. 微生物學(xué)通報(bào). 1986(05)
碩士論文
[1]一株黃土高原土壤放線菌新種的鑒定[D]. 王婷婷.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2011
[2]深海樣品中放線菌菌株的分離和兩株放線菌的多相分類[D]. 羅應(yīng)學(xué).國家海洋局第三海洋研究所 2010
本文編號(hào):3697056
本文鏈接:http://sikaile.net/kejilunwen/nykj/3697056.html
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