球孢白僵菌的退化與DNA甲基化關(guān)系的初步研究
發(fā)布時間:2022-01-09 19:23
球孢白僵菌Beauveria bassiana (以下簡稱白僵菌)具有侵染力強、分布廣以及流行快的特點;同時也具有易于培養(yǎng),不污染環(huán)境等優(yōu)勢。因此,作為重要的昆蟲病原真菌,白僵菌目前已廣泛應(yīng)用于農(nóng)林業(yè)害蟲生物防治。然而,在實驗室培養(yǎng)和工業(yè)生產(chǎn)過程中,白僵菌也普遍存在著菌體退化問題。白僵菌菌體退化對于其發(fā)酵生產(chǎn)及殺蟲效果有著直接的負面影響。研究表明,DNA甲基化修飾普遍存在于生物生命過程中。它通過調(diào)節(jié)基因表達使生物體在生長發(fā)育過程中產(chǎn)生出不同的性狀。因此,揭示球孢白僵菌在培養(yǎng)過程中菌體退化與其DNA甲基化的關(guān)系,可以為今后進一步研究白僵菌表觀遺傳學(xué)以及DNA甲基化在菌體生長發(fā)育機制中的具體功能提供基礎(chǔ)材料和科學(xué)依據(jù),同時也將為白僵菌的規(guī);l(fā)酵與產(chǎn)業(yè)化奠定更加堅實的理論基礎(chǔ)。本研究采用RACE技術(shù)克隆出球孢白僵菌DNA甲基轉(zhuǎn)移酶編碼基因Dim-2全序列,并通過生物信息學(xué)方法,對該蛋白進行了同源序列比對與系統(tǒng)發(fā)育樹分析。同時,本研究還利用Realtime-PCR技術(shù)和HPLC技術(shù)對球孢白僵菌在生長發(fā)育過程中Dim-2基因的轉(zhuǎn)錄表達以及基因組DNA中5-甲基胞嘧啶的含量進行了檢測,分析了球孢...
【文章來源】:安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)安徽省
【文章頁數(shù)】:57 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
球抱白僵菌B620d5菌株菌落形態(tài)
4.2球抱白僵菌總民NA的提純??用TRIzol法提取球抱白僵菌總RNA,在1.0%的瓊脂糖凝膠電泳后觀察了大小分??別為28SrRNA、ISSrRNA和5Sr艮NA的清晰條帶(圖4-2)。各條帶亮度強弱趨勢大??致為28S>18S>W。用核酸測定儀檢測RNA樣品的OD260/OD280數(shù)值位于1.8?2.0??之間。由此可知,提取的總RNA質(zhì)量很好,沒有發(fā)生降解,可W進行下一步實驗。??I??■??圖4-3球巧白僵菌總RNA檢測??Fig.4-3?Profile?of?RNA?extraUed?行om?公.6口抓/打內(nèi)口??4.3球抱白僵菌。/W-2基因cDNA的3V5’RACE末端片段擴增??用CLOTECH公司的SMART?民ace證NA?Amplification?kit試劑構(gòu)建球抱白僵??菌3'-RACE庫和5'-RACE庫,并通過兩輪PC民反應(yīng)得到相關(guān)片段(圖4-3)。經(jīng)克??隆轉(zhuǎn)化,挑取陽性克隆進行菌落PCR驗證(圖4-4,圖4-5),并進行測序。??M??400bp?—??200bp???圖4-4?PCR產(chǎn)物的檢測??Fig.4-4?Detection?of?PCR?products??23??
┚?#?鰨?不?潁悖模危列蛄腥?さ鈉唇蛹胺治觶崳?將RACE克隆得到的球抱白僵菌化W-2基因3'端和5’端序列,與GenBank中已??知的該基因部分序列進行拼接,最終獲得了全長402化P的cDNA序列(圖4-6)。分析??表明,球抱白僵菌。加-2基因開放式閩讀框由3429個核昔酸組成,編碼了?1142個氨??基酸。5'非翻譯區(qū)(5'-UTR)與3'非翻譯區(qū)(3'-UTR)分別為283個核昔酸和303??個核昔酸。白僵菌0/W-2編碼蛋白的分子量128kD,理論等電點6.13。1142個氨基??酸中含強堿氨基酸127個(K,?R),強酸氨基酸143個(D,E),疏水氨基酸367個??(A,I,L,F,W,?V),極性氨基酸301個(N,C,?Q,?S,T,Y),分別占總氨基??酸的?11.12%,12.52〇/〇,32.13〇/〇和?26.36%。??數(shù)據(jù)統(tǒng)計顯示,球抱白僵菌甲基轉(zhuǎn)移酶基因在密碼子的第S位堿基的使用概率分??別為C:29.5%,T:23.8%,G:26.3%,A:20.4%。表明該基因在密碼子的使用上,沒有??顯示出明顯的偏愛性。??4.5球抱白僵菌。/W-2基因編碼蛋白的結(jié)構(gòu)分析??白僵菌DIM-2蛋白結(jié)構(gòu)域分析顯示
【參考文獻】:
期刊論文
[1]真菌殺蟲劑的研究現(xiàn)狀與展望[J]. 解嬌,劉霞,張正坤,徐文靜,李啟云. 吉林農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(01)
[2]表觀遺傳學(xué)研究進展[J]. 李光雷,喻樹迅,范術(shù)麗,宋美珍,龐朝友. 生物技術(shù)通報. 2011(01)
[3]蟲生真菌多樣性及其在害蟲生物防治中的作用[J]. 王聯(lián)德,尤民生,黃建,周然. 江西農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2010(05)
[4]球孢白僵菌單孢子分離株在繼代培養(yǎng)過程中菌落局變的遺傳分析[J]. 徐金柱,黃勃,李增智. 菌物學(xué)報. 2010(02)
[5]DNA甲基轉(zhuǎn)移酶分類、功能及其研究進展[J]. 王志剛,吳建新. 遺傳. 2009(09)
[6]真菌表觀遺傳學(xué)研究進展[J]. 邱立友,余翠,戚元成,高玉千,申進文. 細胞生物學(xué)雜志. 2009(02)
[7]表觀遺傳學(xué)及其相關(guān)研究進展[J]. 白麗榮,時麗冉. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2007(20)
[8]真菌殺蟲劑的研究進展與展望[J]. 張俊華. 安徽農(nóng)學(xué)通報. 2007(12)
[9]表觀遺傳學(xué)及其研究進展[J]. 郭新紅,劉文彬. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2007(01)
[10]白僵菌對害蟲致病性的研究進展[J]. 李春香,張淑紅. 唐山師范學(xué)院學(xué)報. 2005(05)
博士論文
[1]金龜子綠僵菌侵染東亞飛蝗特異表達基因篩選與體內(nèi)定殖階段cDNA文庫構(gòu)建[D]. 張傳博.重慶大學(xué) 2009
本文編號:3579300
【文章來源】:安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)安徽省
【文章頁數(shù)】:57 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
球抱白僵菌B620d5菌株菌落形態(tài)
4.2球抱白僵菌總民NA的提純??用TRIzol法提取球抱白僵菌總RNA,在1.0%的瓊脂糖凝膠電泳后觀察了大小分??別為28SrRNA、ISSrRNA和5Sr艮NA的清晰條帶(圖4-2)。各條帶亮度強弱趨勢大??致為28S>18S>W。用核酸測定儀檢測RNA樣品的OD260/OD280數(shù)值位于1.8?2.0??之間。由此可知,提取的總RNA質(zhì)量很好,沒有發(fā)生降解,可W進行下一步實驗。??I??■??圖4-3球巧白僵菌總RNA檢測??Fig.4-3?Profile?of?RNA?extraUed?行om?公.6口抓/打內(nèi)口??4.3球抱白僵菌。/W-2基因cDNA的3V5’RACE末端片段擴增??用CLOTECH公司的SMART?民ace證NA?Amplification?kit試劑構(gòu)建球抱白僵??菌3'-RACE庫和5'-RACE庫,并通過兩輪PC民反應(yīng)得到相關(guān)片段(圖4-3)。經(jīng)克??隆轉(zhuǎn)化,挑取陽性克隆進行菌落PCR驗證(圖4-4,圖4-5),并進行測序。??M??400bp?—??200bp???圖4-4?PCR產(chǎn)物的檢測??Fig.4-4?Detection?of?PCR?products??23??
┚?#?鰨?不?潁悖模危列蛄腥?さ鈉唇蛹胺治觶崳?將RACE克隆得到的球抱白僵菌化W-2基因3'端和5’端序列,與GenBank中已??知的該基因部分序列進行拼接,最終獲得了全長402化P的cDNA序列(圖4-6)。分析??表明,球抱白僵菌。加-2基因開放式閩讀框由3429個核昔酸組成,編碼了?1142個氨??基酸。5'非翻譯區(qū)(5'-UTR)與3'非翻譯區(qū)(3'-UTR)分別為283個核昔酸和303??個核昔酸。白僵菌0/W-2編碼蛋白的分子量128kD,理論等電點6.13。1142個氨基??酸中含強堿氨基酸127個(K,?R),強酸氨基酸143個(D,E),疏水氨基酸367個??(A,I,L,F,W,?V),極性氨基酸301個(N,C,?Q,?S,T,Y),分別占總氨基??酸的?11.12%,12.52〇/〇,32.13〇/〇和?26.36%。??數(shù)據(jù)統(tǒng)計顯示,球抱白僵菌甲基轉(zhuǎn)移酶基因在密碼子的第S位堿基的使用概率分??別為C:29.5%,T:23.8%,G:26.3%,A:20.4%。表明該基因在密碼子的使用上,沒有??顯示出明顯的偏愛性。??4.5球抱白僵菌。/W-2基因編碼蛋白的結(jié)構(gòu)分析??白僵菌DIM-2蛋白結(jié)構(gòu)域分析顯示
【參考文獻】:
期刊論文
[1]真菌殺蟲劑的研究現(xiàn)狀與展望[J]. 解嬌,劉霞,張正坤,徐文靜,李啟云. 吉林農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(01)
[2]表觀遺傳學(xué)研究進展[J]. 李光雷,喻樹迅,范術(shù)麗,宋美珍,龐朝友. 生物技術(shù)通報. 2011(01)
[3]蟲生真菌多樣性及其在害蟲生物防治中的作用[J]. 王聯(lián)德,尤民生,黃建,周然. 江西農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2010(05)
[4]球孢白僵菌單孢子分離株在繼代培養(yǎng)過程中菌落局變的遺傳分析[J]. 徐金柱,黃勃,李增智. 菌物學(xué)報. 2010(02)
[5]DNA甲基轉(zhuǎn)移酶分類、功能及其研究進展[J]. 王志剛,吳建新. 遺傳. 2009(09)
[6]真菌表觀遺傳學(xué)研究進展[J]. 邱立友,余翠,戚元成,高玉千,申進文. 細胞生物學(xué)雜志. 2009(02)
[7]表觀遺傳學(xué)及其相關(guān)研究進展[J]. 白麗榮,時麗冉. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2007(20)
[8]真菌殺蟲劑的研究進展與展望[J]. 張俊華. 安徽農(nóng)學(xué)通報. 2007(12)
[9]表觀遺傳學(xué)及其研究進展[J]. 郭新紅,劉文彬. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2007(01)
[10]白僵菌對害蟲致病性的研究進展[J]. 李春香,張淑紅. 唐山師范學(xué)院學(xué)報. 2005(05)
博士論文
[1]金龜子綠僵菌侵染東亞飛蝗特異表達基因篩選與體內(nèi)定殖階段cDNA文庫構(gòu)建[D]. 張傳博.重慶大學(xué) 2009
本文編號:3579300
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